Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08956
• Subject: NM_001350735.1
• Aligned Length: 1080
• Identities: 876
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGTCCCGGCTGCCGGTCGACGACCGCCCCGCGTCATGCGGCTCCTCGGCTGGTGGCAAGTATTGCTGTGGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGGGACTTCCCGTCCGCGGCGTGGAGGTTGCAGAGGAAAGTGGTCGCTTATGGTCAGAGGAGCAGCCTGCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACCCTCTCCAGGTTGGGGCTGTGTACCTGGGTGAGGAGGAGCTCCTGCATGACCCGATGGGCCAGGACAGGGCA  222
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------ATGGGCCAGGACAGGGCA  18

Query  223  GCAGAAGAGGCCAATGCGGTGCTGGGGCTGGACACCCAAGGCGATCACATGGTGATGCTGTCTGTGATTCCTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   19  GCAGAAGAGGCCAATGCGGTGCTGGGGCTGGACACCCAAGGCGATCACATGGTGATGCTGTCTGTGATTCCTGG  92

Query  297  GGAAGCTGAGGACAAAGTGAGTTCAGAGCCTAGCGGCGTCACCTGTGGTGCTGGAGGAGCGGAGGACTCAAGGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   93  GGAAGCTGAGGACAAAGTGAGTTCAGAGCCTAGCGGCGTCACCTGTGGTGCTGGAGGAGCGGAGGACTCAAGGT  166

Query  371  GCAACGTCCGAGAGAGCCTTTTCTCTCTGGATGGCGCTGGAGCACACTTCCCTGACAGAGAAGAGGAGTATTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  167  GCAACGTCCGAGAGAGCCTTTTCTCTCTGGATGGCGCTGGAGCACACTTCCCTGACAGAGAAGAGGAGTATTAC  240

Query  445  ACAGAGCCAGAAGTGGCGGAATCTGACGCAGCCCCGACAGAGGACTCCAATAACACTGAAAGTCTGAAATCCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ACAGAGCCAGAAGTGGCGGAATCTGACGCAGCCCCGACAGAGGACTCCAATAACACTGAAAGTCTGAAATCCCC  314

Query  519  AAAGGTGAACTGTGAGGAGAGAAACATTACAGGATTAGAAAATTTCACTCTGAAAATTTTAAATATGTCACAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  315  AAAGGTGAACTGTGAGGAGAGAAACATTACAGGATTAGAAAATTTCACTCTGAAAATTTTAAATATGTCACAGG  388

Query  593  ACCTTATGGATTTTCTGAACCCAAACGGTAGTGACTGTACTCTAGTCCTGTTTTACACCCCGTGGTGCCGCTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  389  ACCTTATGGATTTTCTGAACCCAAACGGTAGTGACTGTACTCTAGTCCTGTTTTACACCCCGTGGTGCCGCTTT  462

Query  667  TCTGCCAGTTTGGCCCCTCACTTTAACTCTCTGCCCCGGGCATTTCCAGCTCTTCACTTTTTGGCACTGGATGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  463  TCTGCCAGTTTGGCCCCTCACTTTAACTCTCTGCCCCGGGCATTTCCAGCTCTTCACTTTTTGGCACTGGATGC  536

Query  741  ATCTCAGCACAGCAGCCTTTCTACCAGGTTTGGCACCGTAGCTGTTCCTAATATTTTATTATTTCAAGGAGCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  537  ATCTCAGCACAGCAGCCTTTCTACCAGGTTTGGCACCGTAGCTGTTCCTAATATTTTATTATTTCAAGGAGCTA  610

Query  815  AACCAATGGCCAGATTTAATCATACAGATCGAACACTGGAAACACTGAAAATCTTCATTTTTAATCAGACAGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  611  AACCAATGGCCAGATTTAATCATACAGATCGAACACTGGAAACACTGAAAATCTTCATTTTTAATCAGACAGGT  684

Query  889  ATAGAAGCCAAGAAGAATGTGGTGGTAACTCAAGCCGACCAAATAGGCCCTCTTCCCAGCACTTTGATAAAAAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  685  ATAGAAGCCAAGAAGAATGTGGTGGTAACTCAAGCCGACCAAATAGGCCCTCTTCCCAGCACTTTGATAAAAAG  758

Query  963  TGTGGACTGGTTGCTTGTATTTTCCTTATTCTTTTTAATTAGTTTTATTATGTATGCTACCATTCGAACTGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  759  TGTGGACTGGTTGCTTGTATTTTCCTTATTCTTTTTAATTAGTTTTATTATGTATGCTACCATTCGAACTGAGA  832

Query 1037  GTATTCGGTGGCTAATTCCAGGACAAGAGCAGGAACATGTGGAG  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  833  GTATTCGGTGGCTAATTCCAGGACAAGAGCAGGAACATGTGGAG  876