Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09005
• Subject: XM_011536147.2
• Aligned Length: 2174
• Identities: 2120
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  ATGAGCC---TGG--ACTGCACCAGCCATATCGCGCTGGGTGCCG-CTTC---------GCCA-----------  48
            |||||.|   |||  ||.|.|||||           .||||.|.| ||.|         ||||           
Sbjct    1  ATGAGTCAGATGGAAACAGGACCAG-----------AGGGTTCAGTCTGCAGCCCACAGGCCAAACCCACCAAA  63

Query   49  ---GCGCCCGAGGAAACTTACGATCATCTTTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAA  119
               ||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  TCTGCTCTGCAGGAAACTTACGATCATCTTTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAA  137

Query  120  TGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTGCAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAG  193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  TGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTGCAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAG  211

Query  194  ACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAAGTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAA  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  ACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAAGTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAA  285

Query  268  AACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTACCTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGC  341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  AACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTACCTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGC  359

Query  342  ACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAATCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGA  415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  ACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAATCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGA  433

Query  416  AAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAAAAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAG  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  AAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAAAAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAG  507

Query  490  AATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGACTCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGC  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  AATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGACTCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGC  581

Query  564  ATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTAGAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTA  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  ATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTAGAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTA  655

Query  638  TTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAGATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCA  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  TTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAGATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCA  729

Query  712  GAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGCCTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAG  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  GAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGCCTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAG  803

Query  786  TGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAAGGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGG  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  TGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAAGGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGG  877

Query  860  TCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGCCTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCC  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  TCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGCCTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCC  951

Query  934  AGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAGCCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCACAGCCCTCCTTAGGGG  1007
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  952  AGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAGCCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCGCAGCCCTCCTTAGGGG  1025

Query 1008  CAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGGACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAA  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  CAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGGACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAA  1099

Query 1082  GCAGGGACCGGATGGTCTCCCAGCTTGAAGCCCAAATATCTGAGCTTGTTGAACAGTTGGGAAAGGAGTCTGGG  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  GCAGGGACCGGATGGTCTCCCAGCTTGAAGCCCAAATATCTGAGCTTGTTGAACAGTTGGGAAAGGAGTCTGGG  1173

Query 1156  TTTCACCAGAAAGCTCTCCAGAGGGCCCAGAAAGCAGAGAATATGTTGGAGACTCTTCAGGGTCAGCTGACACA  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  TTTCACCAGAAAGCTCTCCAGAGGGCCCAGAAAGCAGAGAATATGTTGGAGACTCTTCAGGGTCAGCTGACACA  1247

Query 1230  CCTGGAGGCAGAGCTGGTTTCTGGAGGTGTTTTGCGAGACAACTTGAATTTTGAGAAACAAAAATATCTTAAAT  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  CCTGGAGGCAGAGCTGGTTTCTGGAGGTGTTTTGCGAGACAACTTGAATTTTGAGAAACAAAAATATCTTAAAT  1321

Query 1304  TTCTGGATCAGCTCTCTCAGAAAATGAAGTTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGAC  1377
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  TTCTGGATCAGCTTTCTCAGAAAATGAAGTTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGAC  1395

Query 1378  GTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGTTCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCA  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  GTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGTTCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCA  1469

Query 1452  CAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGAAAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGC  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  CAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGAAAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGC  1543

Query 1526  AGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAGCAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTT  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  AGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAGCAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTT  1617

Query 1600  ACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGAGAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGA  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  ACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGAGAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGA  1691

Query 1674  GCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATGAACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATC  1747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1692  GCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATGAACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATC  1765

Query 1748  TAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAGATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAA  1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  TAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAGATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAA  1839

Query 1822  CTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGAGAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGA  1895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  CTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGAGAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGA  1913

Query 1896  AATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAGAAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGG  1969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914  AATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAGAAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGG  1987

Query 1970  TGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACCAGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGA  2043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1988  TGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACCAGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGA  2061

Query 2044  TTGATCCATTCACATCAGCATCACTTTGTTACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCA  2117
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2062  TTGGTCCATTCACATCAGCATCACTTTGTTACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCA  2135

Query 2118  CCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2136  CCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT  2163