Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09005
• Subject: XM_011536148.2
• Aligned Length: 2174
• Identities: 1919
• Gaps: 241

Alignment

Query    1  ATGAGCC---TGG--ACTGCACCAGCCATATCGCGCTGGGTGCCG-CTTC---------GCCA-----------  48
            |||||.|   |||  ||.|.|||||           .||||.|.| ||.|         ||||           
Sbjct    1  ATGAGTCAGATGGAAACAGGACCAG-----------AGGGTTCAGTCTGCAGCCCACAGGCCAAACCCACCAAA  63

Query   49  ---GCGCCCGAGGAAACTTACGATCATCTTTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAA  119
               ||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  TCTGCTCTGCAGGAAACTTACGATCATCTTTCGGAAGTCCCGGTCACGCGGGAGCAGTTAAACCACTATCGGAA  137

Query  120  TGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTGCAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAG  193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  TGTGGCTCAAAATGCTCGAAGTGAACTTGCAGCAACTTTGGTCAAATTTGAATGTGCTCAGTCTGAGCTTCAAG  211

Query  194  ACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAAGTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAA  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  ACCTCCGATCCAAGATGCTTTCTAAAGAAGTCTCCTGTCAAGAACTGAAAGCTGAAATGGAGAGCTACAAGGAA  285

Query  268  AACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTACCTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGC  341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  AACAATGCCAGAAAATCATCTCTCCTTACCTCTTTGAGAGACAGAGTTCAGGAACTAGAAGAAGAATCAGCAGC  359

Query  342  ACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAATCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGA  415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  ACTTTCCACTTCTAAAATCAGAACAGAAATCACAGCTCACGCTGCAATCAAGGAGAACCAGGAATTAAAGAAGA  433

Query  416  AAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAAAAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAG  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  AAGTTGTAGAGTTAAATGAAAAATTACAAAAGTGTTCAAAAGAAAATGAGGAGAATAAGAAACAAGTTTCAAAG  507

Query  490  AATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGACTCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGC  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  AATTGCAGGAAACATGAGGAATTTCTGACTCAACTGCGTGACTGCTTGGATCCAGATGAGAGGAATGACAAGGC  581

Query  564  ATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTAGAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTA  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  ATCAGATGAAGATTTAATTTTAAAGCTTAGAGACCTGCGCAAAGAAAATGAATTCGTGAAAGGACAAATTGTTA  655

Query  638  TTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAGATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCA  711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  TTCTTGAAGAGACTATAAATGTCCATGAGATGGAAGCAAAAGCTAGCAGAGAAACGATCATGAGGCTGGCTTCA  729

Query  712  GAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGCCTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAG  785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  GAAGTCAACAGAGAGCAGAAAAAAGCTGCCTCCTGTACTGAAGAGAAAGAGAAGCTGAACCAGGACCTGCTCAG  803

Query  786  TGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAAGGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGG  859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  TGCTGTAGAAGCAAAAGAAGCTCTTGAAAGGGAAGTTAAGATCTTCCAAGAAAGGCTGCTTGCTGGCCAGCAGG  877

Query  860  TCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGCCTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCC  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  TCTGGGATGCCTCAAAGCAGGAAGTGAGCCTCCTGAAGAAAAGCTCTTCTGAGTTGGAGAAGAGTTTGAAGGCC  951

Query  934  AGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAGCCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCACAGCCCTCCTTAGGGG  1007
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  952  AGTCAGGATGCAGTCACAACCTCACAAAGCCAGTACTTCTCATTTAGGGAGAAAATCGCAGCCCTCCTTAGGGG  1025

Query 1008  CAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGGACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAA  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  CAGATTGAGCATGACTGGGTCCACTGAGGACACCATTTTGGAGAAGATTCGAGAAATGGACAGCCGGGAAGAAA  1099

Query 1082  GCAGGGACCGGATGGTCTCCCAGCTTGAAGCCCAAATATCTGAGCTTGTTGAACAGTTGGGAAAGGAGTCTGGG  1155
            |||||||||||                                                               
Sbjct 1100  GCAGGGACCGG---------------------------------------------------------------  1110

Query 1156  TTTCACCAGAAAGCTCTCCAGAGGGCCCAGAAAGCAGAGAATATGTTGGAGACTCTTCAGGGTCAGCTGACACA  1229
                                                                                      
Sbjct 1111  --------------------------------------------------------------------------  1110

Query 1230  CCTGGAGGCAGAGCTGGTTTCTGGAGGTGTTTTGCGAGACAACTTGAATTTTGAGAAACAAAAATATCTTAAAT  1303
                                                                            ||||||||||
Sbjct 1111  ----------------------------------------------------------------TATCTTAAAT  1120

Query 1304  TTCTGGATCAGCTCTCTCAGAAAATGAAGTTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGAC  1377
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  TTCTGGATCAGCTTTCTCAGAAAATGAAGTTGGACCAGATGGCTGCCGAACTTGGCTTTGACATGCGGCTGGAC  1194

Query 1378  GTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGTTCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCA  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195  GTGGTTTTAGCTCGAACAGAGCAGCTGGTTCGTCTTGAGAGCAATGCAGTCATTGAGAACAAGACCATTGCCCA  1268

Query 1452  CAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGAAAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGC  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269  CAATTTGCAGAGAAAGCTAAAGACACAGAAAGAGAGACTGGAGAGCAAAGAATTACACATGAGCCTCCTCCGGC  1342

Query 1526  AGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAGCAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTT  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343  AGAAAATAGCCCAGCTGGAGGAGGAGAAGCAGGCACGCACGGCCTTGGTGGTTGAGAGGGACAACGCGCATCTT  1416

Query 1600  ACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGAGAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGA  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417  ACCATCAGGAACTTGCAGAAGAAGGTGGAGAGGCTGCAGAAAGAGCTGAACACGTGTCGAGACTTGCACACCGA  1490

Query 1674  GCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATGAACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATC  1747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1491  GCTCAAAGCCAAACTGGCCGACACCAATGAACTGAAGATTAAAACTTTGGAACAGACTAAAGCCATTGAAGATC  1564

Query 1748  TAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAGATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAA  1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1565  TAAACAAATCCAGAGACCAACTGGAGAAGATGAAGGAGAAAGCTGAGAAAAAGCTCATGTCTGTCAAGTCAGAA  1638

Query 1822  CTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGAGAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGA  1895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1639  CTGGATACCACAGAACATGAGGCTAAGGAGAATAAAGAAAGGGCCAGAAACATGATAGAAGTGGTAACCAGTGA  1712

Query 1896  AATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAGAAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGG  1969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1713  AATGAAGACACTAAAAAAATCTCTGGAAGAAGCAGAAAAGAGAGAAAAGCAGCTGGCAGACTTCAGGGAGGTGG  1786

Query 1970  TGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACCAGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGA  2043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1787  TGTCGCAGATGCTAGGCTTGAACGTGACCAGCCTTGCTCTTCCTGATTATGAAATCATCAAGTGTCTTGAAAGA  1860

Query 2044  TTGATCCATTCACATCAGCATCACTTTGTTACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCA  2117
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1861  TTGGTCCATTCACATCAGCATCACTTTGTTACCTGTGCCTGCCTCAAAGATGTGACTACTGGGCAAGAGAGGCA  1934

Query 2118  CCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1935  CCCACAAGGCCATTTACAGCTTCTTCAT  1962