Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09023
Subject:
NM_001308183.1
Aligned Length:
507
Identities:
341
Gaps:
116

Alignment

Query   1  MEDHQHVPIDIQTSKLLDWLVDRRHCSLKWQSLVLTIREKINAAIQDMPESEEIAQLLSGSYIHYFHCLRILDL  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  LKGTEASTKNIFGRYSSQRMKDWQEIIALYEKDNTYLVELSSLLVRNVNYEIPSLKKQIAKCQQLQQEYSRKEE  148
                                                .||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------------MELCSLLVRNVSYEIPSLKKQIAKCQQLQQEYSRKEE  37

Query 149  ECQAGAAEMREQFYHSCKQYGITGENVRGELLALVKDLPSQLAEIGAAAQQSLGEAIDVYQASVGFVCESPTEQ  222
           |.||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||.| ||||||||.|||.|.|||.|||||
Sbjct  38  EGQAGAAEMREQFYHSCKQYGITGDNVRRELLALVKDLPSQLAEIGAGA-QSLGEAIDLYQACVEFVCDSPTEQ  110

Query 223  VLPMLRFVQKRGNSTVYEWRTGTEPSVVERPHLEELPEQVAEDAIDWGDFGVEAVSEGTDSGISAEAAGIDWGI  296
           ||||||.|||.||||||||||||||||||||.|||.||||.||.||||||||||||   ||||.||..||||||
Sbjct 111  VLPMLRYVQKKGNSTVYEWRTGTEPSVVERPQLEEPPEQVQEDEIDWGDFGVEAVS---DSGIVAETPGIDWGI  181

Query 297  FPESDSKDPGGDGIDWGDDAVAL-QITVLEAGTQAPEGVARGPDALTLLEYTETRNQFLDELMELEIFLAQRAV  369
           ..||..||.|.|.|||||||.|. .|||||.||.||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||||
Sbjct 182  SLESEAKDAGADKIDWGDDAAAASEITVLETGTEAPEGVARGSDALTLLEYPETRNQFIDELMELEIFLSQRAV  255

Query 370  ELSEEADVLSVSQFQLAPAILQGQTKEKMVTMVSVLEDLIGKLTSLQLQHLFMILASPRYVDRVTEFLQQKLKQ  443
           |.|||||.|||||||||||||||||||||...||.|..|||.||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256  EMSEEADILSVSQFQLAPAILQGQTKEKMLSLVSTLQQLIGRLTSLRMQHLFMILASPRYVDRVTEFLQQKLKQ  329

Query 444  SQLLALKKELMVQKQQEALEEQAALEPKLDLLLEKTKELQKLIEADISKRYSGRPVNLMGTSL  506
           ||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330  SQLLALKKELMVEKQQEALQEQAALEPKLDLLLEKTRELQKLIEADISKRYSGRPVNLMGTSL  392