Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09038
• Subject: NM_001371412.1
• Aligned Length: 1488
• Identities: 1487
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGATTTACCCCACTGTGATCCTCTGCTTATTTGGTTTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGATTTACCCCACTGTGATCCTCTGCTTATTTGGTTTTTT  74

Query   75  CTCCATGATGAGACCCTCAGAACCGTTCCTTATCCCATATTTATCTGGACCAGATAAAAACCTGACCAGTGCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCATGATGAGACCCTCAGAACCATTCCTTATCCCATATTTATCTGGACCAGATAAAAACCTGACCAGTGCAG  148

Query  149  AGATAACAAATGAGATCTTCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGATAACAAATGAGATCTTCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACC  222

Query  223  GATTATGTCCGCTACAAGCCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATTATGTCCGCTACAAGCCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTT  296

Query  297  TGGCCAAGGAGTGAAGACCATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCCAAGGAGTGAAGACCATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACT  370

Query  371  ACGCCTACATATACAGCGTGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACGCCTACATATACAGCGTGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTG  444

Query  445  GCCGCCTACACAGCAGGGTCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGCCTACACAGCAGGGTCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAA  518

Query  519  CGTCATATCCTTGGCCTCTGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTCATATCCTTGGCCTCTGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGT  592

Query  593  TTTTTCATGCAAAACCCAGCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTTCATGCAAAACCCAGCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAA  666

Query  667  GGTGAAGCACCAGGCTGTGAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGAAGCACCAGGCTGTGAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGG  740

Query  741  CCAGCTGAACAGCCTGAAACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGCTGAACAGCCTGAAACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGT  814

Query  815  GCTACTCCTCAAAACGTCTTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTACTCCTCAAAACGTCTTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTG  888

Query  889  AACTATGTTCAAATCCTGTGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACTATGTTCAAATCCTGTGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGC  962

Query  963  TATTGCAACCTTTGGAGGGGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATTGCAACCTTTGGAGGGGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAG  1036

Query 1037  AGCTGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGG  1110

Query 1111  GCGTGCTATGCTGGCTATTTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCGTGCTATGCTGGCTATTTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGC  1184

Query 1185  AGTTAATCTGAATGTGGAACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTTAATCTGAATGTGGAACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCA  1258

Query 1259  TCATGACTGTGATTGTAGTAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCATGACTGTGATTGTAGTAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGC  1332

Query 1333  TATTTTGCAGTAATTGCTGGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TATTTTGCAGTAATTGCTGGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGA  1406

Query 1407  TGTACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGTACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAA  1480

Query 1481  CAAAACTC  1488
            ||||||||
Sbjct 1481  CAAAACTC  1488