Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09038
• Subject: NM_001371413.1
• Aligned Length: 1537
• Identities: 1410
• Gaps: 110

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGA-TTGTT-ACAGAACTTCACT-----AAGCAGTTCCT  34
                                             .|||| ..||| |||||.||||.||     .|||||     
Sbjct    1  ATGAATCCACTGGGTTCTGCTTCTCGAGCCACTGTGGACCAGTTAACAGACCTTCCCTCCAAGGAGCAG-----  69

Query   35  GGATTTACCCCACTGTGATCCTCTGCTTATTTGGTTTTTTCTCCATGATGAGACCCTCAGAACCGTTCCTTATC  108
                                |||.| ||.|.||||.|||.|||     ||.|.||           ||||    
Sbjct   70  --------------------CTCAG-TTGTGTGGTCTTTGCTC-----TGTGGCC-----------TCCT----  102

Query  109  CCATATTTATCTGGACCAGATAAAAACCTGACCAGTG---CAG------AGATAACAAATGAGATCTTCCCCGT  173
               ..|||.|     ||||    .|||||   |||||   |||      |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  ---GCTTTCT-----CCAG----CAACCT---CAGTGATCCAGGTGTCAAGATAACAAATGAGATCTTCCCCGT  161

Query  174  TTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACCGATTATGTCCGCTACAAGCCAGTCA  247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  162  TTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACCGATTATGTCCGCTACAAGCCAGTCA  235

Query  248  TCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTTTGGCCAAGGAGTGAAGACCATGCAG  321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  236  TCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTTTGGCCAAGGAGTGAAGACCATGCAG  309

Query  322  GTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACTACGCCTACATATACAGCGTGGTCAG  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  310  GTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACTACGCCTACATATACAGCGTGGTCAG  383

Query  396  CCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTGGCCGCCTACACAGCAGGGTCGGTGC  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  384  CCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTGGCCGCCTACACAGCAGGGTCGGTGC  457

Query  470  TGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAACGTCATATCCTTGGCCTCTGTCTCC  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  TGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAACGTCATATCCTTGGCCTCTGTCTCC  531

Query  544  GTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGTTTTTTCATGCAAAACCCAGCAGAGA  617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  532  GTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGTTTTTTCATGCAAAACCCAGCAGAGA  605

Query  618  AATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAAGGTGAAGCACCAGGCTGTGAAGAGC  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  AATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAAGGTGAAGCACCAGGCTGTGAAGAGC  679

Query  692  AGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGGCCAGCTGAACAGCCTGAAACCAAGC  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  AGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGGCCAGCTGAACAGCCTGAAACCAAGC  753

Query  766  AATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGTGCTACTCCTCAAAACGTCTTTTCTA  839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  AATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGTGCTACTCCTCAAAACGTCTTTTCTA  827

Query  840  CTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTGAACTATGTTCAAATCCTGTGGGATT  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  CTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTGAACTATGTTCAAATCCTGTGGGATT  901

Query  914  ACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGCTATTGCAACCTTTGGAGGGGCTGTG  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  ACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGCTATTGCAACCTTTGGAGGGGCTGTG  975

Query  988  GCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAGAGCTGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGT  1061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  GCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAGAGCTGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGT  1049

Query 1062  TGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGGGCGTGCTATGCTGGCTATTTGATAT  1135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  TGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGGGCGTGCTATGCTGGCTATTTGATAT  1123

Query 1136  TCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGCAGTTAATCTGAATGTGGAACGCTAT  1209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  TCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGCAGTTAATCTGAATGTGGAACGCTAT  1197

Query 1210  GCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCATCATGACTGTGATTGTAGTAGATCA  1283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198  GCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCATCATGACTGTGATTGTAGTAGATCA  1271

Query 1284  GAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGCTATTTTGCAGTAATTGCTGGAATTT  1357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1272  GAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGCTATTTTGCAGTAATTGCTGGAATTT  1345

Query 1358  TCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGATGTACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAG  1431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1346  TCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGATGTACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAG  1419

Query 1432  AATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAACAAAACTC  1488
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420  AATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAACAAAACTC  1476