Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09038
Subject:
NM_001371413.1
Aligned Length:
507
Identities:
456
Gaps:
26

Alignment

Query   1  -----------MDCYRTSLSSSWIYPTVILCLFGFFSMMRPSEPFLIPYLSGPDKNLTSAEITNEIFPVWTYSY  63
                      .| ..|.|.|......|...|.         .|.....||.|     ...|||||||||||||
Sbjct   1  MNPLGSASRATVD-QLTDLPSKEQLSCVVFALW---------PPAFSSNLSDP-----GVKITNEIFPVWTYSY  59

Query  64  LVLLLPVFVLTDYVRYKPVIILQGISFIITWLLLLFGQGVKTMQVVEFFYGMVTAAEVAYYAYIYSVVSPEHYQ  137
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  60  LVLLLPVFVLTDYVRYKPVIILQGISFIITWLLLLFGQGVKTMQVVEFFYGMVTAAEVAYYAYIYSVVSPEHYQ  133

Query 138  RVSGYCRSVTLAAYTAGSVLAQLLVSLANMSYFYLNVISLASVSVAFLFSLFLPMPKKSMFFHAKPSREIKKSS  211
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 134  RVSGYCRSVTLAAYTAGSVLAQLLVSLANMSYFYLNVISLASVSVAFLFSLFLPMPKKSMFFHAKPSREIKKSS  207

Query 212  SVNPVLEETHEGEAPGCEEQKPTSEILSTSGKLNKGQLNSLKPSNVTVDVFVQWFQDLKECYSSKRLFYWSLWW  285
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 208  SVNPVLEETHEGEAPGCEEQKPTSEILSTSGKLNKGQLNSLKPSNVTVDVFVQWFQDLKECYSSKRLFYWSLWW  281

Query 286  AFATAGFNQVLNYVQILWDYKAPSQDSSIYNGAVEAIATFGGAVAAFAVGYVKVNWDLLGELALVVFSVVNAGS  359
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282  AFATAGFNQVLNYVQILWDYKAPSQDSSIYNGAVEAIATFGGAVAAFAVGYVKVNWDLLGELALVVFSVVNAGS  355

Query 360  LFLMHYTANIWACYAGYLIFKSSYMLLITIAVFQIAVNLNVERYALVFGINTFIALVIQTIMTVIVVDQRGLNL  433
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356  LFLMHYTANIWACYAGYLIFKSSYMLLITIAVFQIAVNLNVERYALVFGINTFIALVIQTIMTVIVVDQRGLNL  429

Query 434  PVSIQFLVYGSYFAVIAGIFLMRSMYITYSTKSQKDVQSPAPSENPDVSHPEEESNIIMSTKL  496
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430  PVSIQFLVYGSYFAVIAGIFLMRSMYITYSTKSQKDVQSPAPSENPDVSHPEEESNIIMSTKL  492