Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09038
• Subject: XM_017005030.1
• Aligned Length: 1728
• Identities: 1487
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGAT  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGGGAAAGGTAAACATCTGGCTTTCACAGCCATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGAT  74

Query   39  TTACCCCACTGTGATCCTCTGCTTATTTGGTTTTTTCTCCATGATGAGACCCTCAGAACCGTTCCTTATCCCAT  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  TTACCCCACTGTGATCCTCTGCTTATTTGGTTTTTTCTCCATGATGAGACCCTCAGAACCATTCCTTATCCCAT  148

Query  113  ATTTATCTGGACCAGATAAAAACCTGACCAGTGCAG--------------------------------------  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  149  ATTTATCTGGACCAGATAAAAACCTGACCAGTGCAGAGTTGCTCAGGTTGAAGCATGCCACAATTAAGACAACA  222

Query  149  --------------------------------------------------------------------------  148
                                                                                      
Sbjct  223  AAGGACAGATGCAGGGTCAGAAGCAACTCAATGAATCCACTGGGTTCTGCTTCTCGAGCCACTGTGGACCAGTT  296

Query  149  --------------------------------------------------------------------------  148
                                                                                      
Sbjct  297  AACAGACCTTCCCTCCAAGGAGCAGCTCAGTTGTGTGGTCTTTGCTCTGTGGCCTCCTGCTTTCTCCAGCAACC  370

Query  149  ------------------AGATAACAAATGAGATCTTCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTG  204
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGTGATCCAGGTGTCAAGATAACAAATGAGATCTTCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTG  444

Query  205  CCTGTGTTTGTCCTCACCGATTATGTCCGCTACAAGCCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTAC  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTGTGTTTGTCCTCACCGATTATGTCCGCTACAAGCCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTAC  518

Query  279  CTGGCTGCTGCTGTTGTTTGGCCAAGGAGTGAAGACCATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCG  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGGCTGCTGCTGTTGTTTGGCCAAGGAGTGAAGACCATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCG  592

Query  353  CCGCCGAGGTGGCCTACTACGCCTACATATACAGCGTGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTAC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGCCGAGGTGGCCTACTACGCCTACATATACAGCGTGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTAC  666

Query  427  TGCAGGAGCGTCACGCTGGCCGCCTACACAGCAGGGTCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACAT  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCAGGAGCGTCACGCTGGCCGCCTACACAGCAGGGTCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACAT  740

Query  501  GTCGTACTTTTACCTCAACGTCATATCCTTGGCCTCTGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAA  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTCGTACTTTTACCTCAACGTCATATCCTTGGCCTCTGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAA  814

Query  575  TGCCCAAGAAAAGCATGTTTTTTCATGCAAAACCCAGCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCCCAAGAAAAGCATGTTTTTTCATGCAAAACCCAGCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTA  888

Query  649  TTAGAGGAAACTCACGAAGGTGAAGCACCAGGCTGTGAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTC  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTAGAGGAAACTCACGAAGGTGAAGCACCAGGCTGTGAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTC  962

Query  723  AGGGAAGCTGAATAAGGGCCAGCTGAACAGCCTGAAACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGT  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGGAAGCTGAATAAGGGCCAGCTGAACAGCCTGAAACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGT  1036

Query  797  TCCAAGATTTGAAGGAGTGCTACTCCTCAAAACGTCTTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCA  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCAAGATTTGAAGGAGTGCTACTCCTCAAAACGTCTTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCA  1110

Query  871  GGTTTTAACCAGGTTTTGAACTATGTTCAAATCCTGTGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTA  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTTTTAACCAGGTTTTGAACTATGTTCAAATCCTGTGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTA  1184

Query  945  TAATGGGGCCGTAGAAGCTATTGCAACCTTTGGAGGGGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAATGGGGCCGTAGAAGCTATTGCAACCTTTGGAGGGGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCA  1258

Query 1019  ACTGGGACCTTCTGGGAGAGCTGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCAT  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTGGGACCTTCTGGGAGAGCTGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCAT  1332

Query 1093  TACACAGCCAATATCTGGGCGTGCTATGCTGGCTATTTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCAT  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TACACAGCCAATATCTGGGCGTGCTATGCTGGCTATTTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCAT  1406

Query 1167  AGCAGTATTTCAGATTGCAGTTAATCTGAATGTGGAACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTG  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCAGTATTTCAGATTGCAGTTAATCTGAATGTGGAACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTG  1480

Query 1241  CCTTGGTGATTCAGACCATCATGACTGTGATTGTAGTAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAG  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCTTGGTGATTCAGACCATCATGACTGTGATTGTAGTAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAG  1554

Query 1315  TTTTTAGTTTATGGGAGCTATTTTGCAGTAATTGCTGGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTC  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTTTAGTTTATGGGAGCTATTTTGCAGTAATTGCTGGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTC  1628

Query 1389  AACCAAATCCCAGAAGGATGTACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGA  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AACCAAATCCCAGAAGGATGTACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGA  1702

Query 1463  GTAATATCATCATGTCAACAAAACTC  1488
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTAATATCATCATGTCAACAAAACTC  1728