Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09038
• Subject: XM_017005031.1
• Aligned Length: 1707
• Identities: 1487
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ---------------ATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGATTTACCCCACTGTGATCCTCTG  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGGGAAAGCCATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGATTTACCCCACTGTGATCCTCTG  74

Query   60  CTTATTTGGTTTTTTCTCCATGATGAGACCCTCAGAACCGTTCCTTATCCCATATTTATCTGGACCAGATAAAA  133
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTATTTGGTTTTTTCTCCATGATGAGACCCTCAGAACCATTCCTTATCCCATATTTATCTGGACCAGATAAAA  148

Query  134  ACCTGACCAGTGCAG-----------------------------------------------------------  148
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  149  ACCTGACCAGTGCAGAGTTGCTCAGGTTGAAGCATGCCACAATTAAGACAACAAAGGACAGATGCAGGGTCAGA  222

Query  149  --------------------------------------------------------------------------  148
                                                                                      
Sbjct  223  AGCAACTCAATGAATCCACTGGGTTCTGCTTCTCGAGCCACTGTGGACCAGTTAACAGACCTTCCCTCCAAGGA  296

Query  149  -----------------------------------------------------------------------AGA  151
                                                                                   |||
Sbjct  297  GCAGCTCAGTTGTGTGGTCTTTGCTCTGTGGCCTCCTGCTTTCTCCAGCAACCTCAGTGATCCAGGTGTCAAGA  370

Query  152  TAACAAATGAGATCTTCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACCGAT  225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAACAAATGAGATCTTCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACCGAT  444

Query  226  TATGTCCGCTACAAGCCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTTTGG  299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGTCCGCTACAAGCCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTTTGG  518

Query  300  CCAAGGAGTGAAGACCATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACTACG  373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAAGGAGTGAAGACCATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACTACG  592

Query  374  CCTACATATACAGCGTGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTGGCC  447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTACATATACAGCGTGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTGGCC  666

Query  448  GCCTACACAGCAGGGTCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAACGT  521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCTACACAGCAGGGTCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAACGT  740

Query  522  CATATCCTTGGCCTCTGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGTTTT  595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATATCCTTGGCCTCTGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGTTTT  814

Query  596  TTCATGCAAAACCCAGCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAAGGT  669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCATGCAAAACCCAGCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAAGGT  888

Query  670  GAAGCACCAGGCTGTGAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGGCCA  743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGCACCAGGCTGTGAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGGCCA  962

Query  744  GCTGAACAGCCTGAAACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGTGCT  817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGAACAGCCTGAAACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGTGCT  1036

Query  818  ACTCCTCAAAACGTCTTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTGAAC  891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTCCTCAAAACGTCTTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTGAAC  1110

Query  892  TATGTTCAAATCCTGTGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGCTAT  965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGTTCAAATCCTGTGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGCTAT  1184

Query  966  TGCAACCTTTGGAGGGGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAGAGC  1039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCAACCTTTGGAGGGGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAGAGC  1258

Query 1040  TGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGGGCG  1113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCTCTGGTGGTCTTCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGGGCG  1332

Query 1114  TGCTATGCTGGCTATTTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGCAGT  1187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGCTATGCTGGCTATTTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGCAGT  1406

Query 1188  TAATCTGAATGTGGAACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCATCA  1261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAATCTGAATGTGGAACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCATCA  1480

Query 1262  TGACTGTGATTGTAGTAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGCTAT  1335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGACTGTGATTGTAGTAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGCTAT  1554

Query 1336  TTTGCAGTAATTGCTGGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGATGT  1409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTGCAGTAATTGCTGGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGATGT  1628

Query 1410  ACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAACAA  1483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAGAGCCCTGCTCCAAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAACAA  1702

Query 1484  AACTC  1488
            |||||
Sbjct 1703  AACTC  1707