Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09038
• Subject: XM_017005034.2
• Aligned Length: 1692
• Identities: 1487
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGATTTACCCCACTGTGATCCTCTGCTTATTTGGTTTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTGTTACAGAACTTCACTAAGCAGTTCCTGGATTTACCCCACTGTGATCCTCTGCTTATTTGGTTTTTT  74

Query   75  CTCCATGATGAGACCCTCAGAACCGTTCCTTATCCCATATTTATCTGGACCAGATAAAAACCTGACCAGTGCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCCATGATGAGACCCTCAGAACCATTCCTTATCCCATATTTATCTGGACCAGATAAAAACCTGACCAGTGCAG  148

Query  149  --------------------------------------------------------------------------  148
                                                                                      
Sbjct  149  AGTTGCTCAGGTTGAAGCATGCCACAATTAAGACAACAAAGGACAGATGCAGGGTCAGAAGCAACTCAATGAAT  222

Query  149  --------------------------------------------------------------------------  148
                                                                                      
Sbjct  223  CCACTGGGTTCTGCTTCTCGAGCCACTGTGGACCAGTTAACAGACCTTCCCTCCAAGGAGCAGCTCAGTTGTGT  296

Query  149  --------------------------------------------------------AGATAACAAATGAGATCT  166
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTCTTTGCTCTGTGGCCTCCTGCTTTCTCCAGCAACCTCAGTGATCCAGGTGTCAAGATAACAAATGAGATCT  370

Query  167  TCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACCGATTATGTCCGCTACAAG  240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCCCGTTTGGACATACTCCTACCTGGTGCTGCTGCTGCCTGTGTTTGTCCTCACCGATTATGTCCGCTACAAG  444

Query  241  CCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTTTGGCCAAGGAGTGAAGAC  314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCAGTCATCATCTTGCAAGGTATCAGTTTCATCATTACCTGGCTGCTGCTGTTGTTTGGCCAAGGAGTGAAGAC  518

Query  315  CATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACTACGCCTACATATACAGCG  388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGCAGGTTGTAGAGTTCTTCTATGGGATGGTCACCGCCGCCGAGGTGGCCTACTACGCCTACATATACAGCG  592

Query  389  TGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTGGCCGCCTACACAGCAGGG  462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTCAGCCCCGAGCACTACCAGAGAGTGAGCGGCTACTGCAGGAGCGTCACGCTGGCCGCCTACACAGCAGGG  666

Query  463  TCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAACGTCATATCCTTGGCCTC  536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGGTGCTGGCTCAACTCTTGGTATCCCTGGCGAACATGTCGTACTTTTACCTCAACGTCATATCCTTGGCCTC  740

Query  537  TGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGTTTTTTCATGCAAAACCCA  610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCTCCGTGGCTTTCCTTTTCTCACTTTTCCTACCAATGCCCAAGAAAAGCATGTTTTTTCATGCAAAACCCA  814

Query  611  GCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAAGGTGAAGCACCAGGCTGT  684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGAGAAATAAAGAAGTCATCAAGCGTGAATCCAGTATTAGAGGAAACTCACGAAGGTGAAGCACCAGGCTGT  888

Query  685  GAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGGCCAGCTGAACAGCCTGAA  758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGAGCAGAAACCCACATCAGAAATACTCAGCACTTCAGGGAAGCTGAATAAGGGCCAGCTGAACAGCCTGAA  962

Query  759  ACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGTGCTACTCCTCAAAACGTC  832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCAAGCAATGTGACTGTGGACGTTTTTGTGCAGTGGTTCCAAGATTTGAAGGAGTGCTACTCCTCAAAACGTC  1036

Query  833  TTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTGAACTATGTTCAAATCCTG  906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTTTCTACTGGTCTCTATGGTGGGCTTTCGCCACAGCAGGTTTTAACCAGGTTTTGAACTATGTTCAAATCCTG  1110

Query  907  TGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGCTATTGCAACCTTTGGAGG  980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGGGATTACAAGGCGCCATCCCAAGATTCTTCCATCTATAATGGGGCCGTAGAAGCTATTGCAACCTTTGGAGG  1184

Query  981  GGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAGAGCTGGCTCTGGTGGTCT  1054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTGTGGCTGCCTTTGCAGTGGGTTATGTGAAAGTCAACTGGGACCTTCTGGGAGAGCTGGCTCTGGTGGTCT  1258

Query 1055  TCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGGGCGTGCTATGCTGGCTAT  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTCAGTTGTCAATGCCGGTTCTTTATTTCTCATGCATTACACAGCCAATATCTGGGCGTGCTATGCTGGCTAT  1332

Query 1129  TTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGCAGTTAATCTGAATGTGGA  1202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGATATTCAAGTCCAGCTATATGCTTCTTATAACCATAGCAGTATTTCAGATTGCAGTTAATCTGAATGTGGA  1406

Query 1203  ACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCATCATGACTGTGATTGTAG  1276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACGCTATGCCTTGGTATTTGGAATCAACACCTTTATTGCCTTGGTGATTCAGACCATCATGACTGTGATTGTAG  1480

Query 1277  TAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGCTATTTTGCAGTAATTGCT  1350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAGATCAGAGAGGGCTCAACTTGCCAGTCAGCATTCAGTTTTTAGTTTATGGGAGCTATTTTGCAGTAATTGCT  1554

Query 1351  GGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGATGTACAGAGCCCTGCTCC  1424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGAATTTTCCTAATGAGAAGCATGTATATTACCTACTCAACCAAATCCCAGAAGGATGTACAGAGCCCTGCTCC  1628

Query 1425  AAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAACAAAACTC  1488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAGTGAGAATCCAGATGTGTCTCACCCAGAGGAAGAGAGTAATATCATCATGTCAACAAAACTC  1692