Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09069
• Subject: NM_001271723.1
• Aligned Length: 1113
• Identities: 942
• Gaps: 170

Alignment

Query    1  MGPRKKSVKTCIMNNEIPEEMTADETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVV  74
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Sbjct    1  MGPRKKSVKTCIMNNEIPEEMTADETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVV  74

Query   75  DLCAGRWWEYMPSGFTDASFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQSCPNLVGVETSH  148
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Sbjct   75  DLCAGRWWEYMPSGFTDASFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQACPNLVGVETSH  148

Query  149  LELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTK  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTK  222

Query  223  PQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLH  296
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Sbjct  223  PQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLH  296

Query  297  TIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANA  370
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Sbjct  297  TIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANA  370

Query  371  DLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWTRLVDINLVRCHALKLDS  444
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Sbjct  371  DLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWTRLVDINLVRCHALKLDS  444

Query  445  FGQFIELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNNDDNNAQNNNANIHDNNHHHPDD  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  FGQFIELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNNDDNNAQNNNANIHDNNHHHPDD  518

Query  519  SDEENDFRQDLQPGEQQFAADALNEMEDIVQEDGEVVAESGNNTPAHSQAIIPVDVDEEQAGPSGLQRVVKPTS  592
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Sbjct  519  SDEENDFRQDLQPGEQQFAADALNEMEDIVQEDGEVVAESGNNTPAHSQAIIPVDVDEEQAGPSGLQRVVKPTS  592

Query  593  ITVHDSESDDEEDSLELQEVWIPKNGTRRYSEREEKTGESVQSRELSVSGKGKTPLRKRYNSHQMGQSKQFPLE  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  593  ITVHDSESDDEEDSLELQEVWIPKNGTRRYSEREEKTGESVQSRELS---------------------------  639

Query  667  ESSCEKGCQVTSEQIKADMKAARDIPEKKKNKDVYPSCSSTTASTVGNSSSHNTASQSPDFVRTVNSGGSSEPS  740
                                                                                      
Sbjct  640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query  741  PTEVDVSRQCACSPGGSEDSEAMEEGDAESSVCPRCCCHRPQESQRRTSRCSDEERPSTSRACVVNGPDEVAKT  814
                                                                                 |||||
Sbjct  640  ---------------------------------------------------------------------EVAKT  644

Query  815  KPRHAMKRKRTADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRCRVLKHLK  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  KPRHAMKRKRTADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRCRVLKHLK  718

Query  889  VENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICIIHEFSNPP  962
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Sbjct  719  VENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICIIHEFSNPP  792

Query  963  NVRNKVRIRSWMDTIANINQELIKYEFFPEATRSEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISDFPWLRSL  1036
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Sbjct  793  NVRNKVRIRSWMDTIANINQELIKYEFFPEATRSEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISDFPWLRSL  866

Query 1037  RAAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKKGVFQRVVAIFIHYCDVNGEPVED  1110
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Sbjct  867  RAAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKKGVFQRVVAIFIHYCDVNGEPVED  940

Query 1111  DYI  1113
            |||
Sbjct  941  DYI  943