Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09069
Subject:
NM_134136.3
Aligned Length:
3584
Identities:
2969
Gaps:
247

Alignment

Query    1  ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA  74
            |||||.||||||||||||||||..|||...|||.|.|||.|.|.|||..|..|.||.|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGGACCACGAAAGAAAAGTGCTAAAGTGTGTGTGATGGACAGTGAGGTCGCTGAGGAAATGACAGCCGATGA  74

Query   75  AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA  148
            |...||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct   75  AGAGAAGGACTACATGAACCAGCTGTCACATGAAGTGCTCTGTCATATCTTCAGGTACCTGCCACTACAGGACA  148

Query  149  TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA  222
            |||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.|||||.||.
Sbjct  149  TCATGTGCATGGAATGCCTCTCTCGGAAGCTAAAGGAGGCAGTCACTCTGTATCTGAGAGTTGTCAGAGTGGTG  222

Query  223  GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA  296
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  223  GATCTCTGTGCAGGGCGCTGGTGGGAATATATGCCAAGTGGCTTCACAGATTCCAGTTTCCTAACCCTTTTGAA  296

Query  297  GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  297  GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTGTATGGCCTTCACCCTAGATACCTCGAGAGGCGAAGAGTGAGGGGCCAGG  370

Query  371  AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGTCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT  444
            |||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  AGGCTTTCAGCATCCCAGGAGTCTTGGAAGCTTTGCAAGCGTGCCCAAACTTGGTGGGTGTAGAAACATCTCAT  444

Query  445  TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCGCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAACGG  518

Query  519  AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG  592
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  519  AGCATTTCCGATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATCCCCATAGGAGCCAAAATCCAAACTTTGCATTTAGTTG  592

Query  593  GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA  666
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  593  GTGTCAATGTTCCTGAAATCCCTTGTATCCCTATGCTAAGGCACCTGTACATGAAGTGGGTGAGACTCACTAAA  666

Query  667  CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA  740
            ||||||||.||||||||.||||||||.||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  CCACAGCCGTTTAAAGATTTCCTTTGCATCAGCTTGCGAACTTTTGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCAACAAA  740

Query  741  TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG  814
            .|||||||||||.||.||.||.||||||||..|.||.||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  CTCCTTGAAATACGTGCCCTTGGTAACAGGTCTGGCATCTGCCCGTAACCTGGAACACTTGGAAATGGTTCGAG  814

Query  815  TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC  888
            |.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  815  TCCCTTTCCTGGGAGGTCTCATCCAACACGTGGTTGAAGACAGCTGGAGATCAGGTGGTTTTAGGAACTTGCAC  888

Query  889  ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG  962
            ||||||||..|.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  889  ACTATTGTCTTAGGAGCTTGCAAGAATGCCCTGGAAGTAGACCTTGGCTACCTCATCATCACTGCTGCGCGAAG  962

Query  963  GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  GTTACATGAAGTTCGCATCCAGCCTTCTTTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAATTGG  1036

Query 1037  AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1037  AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTGGGATATGTAGATGAGTTCTTGCTACAGAGCAGAATGGCGAATGCA  1110

Query 1111  GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT  1184
            |||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GATTTGGTGAAGTATGGCTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATTACTGATATAGGGATGAAGGCAGT  1184

Query 1185  CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTATAACTGTCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA  1258

Query 1259  TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT  1332
            |||||||||||||.||.||||..|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  TCTCAGACCACTCGAGGTGGATGCGACTGGTTGATATCAACCTCGTGCGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGATTCT  1332

Query 1333  TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA  1406
            ||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1333  TTTGGCCAGTTTGTTGAATTATTGCCCAGCCTGGAATTTATTTCTCTGGACCAGATGTTCCGTGAGCCACCCAA  1406

Query 1407  GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT  1480
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1407  GGGCTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGAACTGGAATTGGGGTTTCCTCAGCGCTTGTCAGCAACCAGAATT  1480

Query 1481  CCAACAATGAC---GATAATAATGC-CCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGA  1550
            |||||||||||   ||.|||||||| ||| ||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1481  CCAACAATGACAATGACAATAATGCTCCA-AATAACAACGCCAACCTCCATGATAACAATCACCATCACCCAGA  1553

Query 1551  TGACTCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGA-GCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTA  1623
            |||.||.||.||.||.|||||||||||.|.|||.||.||..||||||| ||| ||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1554  TGATTCGGATGACGACAATGACTTTCGTCCAGACCTACAAGCAGGAGAGGCA-CAATTTGCAGCCGATGCGTTG  1626

Query 1624  AATGAGATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAG  1697
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||..||||.|||||||||||||||..||..||||||||||.
Sbjct 1627  AATGAGATGGAAGACATGGTCCAGGAAGATGGAGAACTGGTAGCCGAGAGTGGAAATGGTATGCCAGCTCACAA  1700

Query 1698  CCAGGCAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAA  1771
            .|.||.|.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1701  TCGGGAAGTTCTTCCTGTGGATGCTGATGAGGAACAAGCAGGACCTAGTGGTCTACAACGCGTGGTAAAACCTA  1774

Query 1772  CCTCAATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCT  1845
            |..|||||.|||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1775  CACCAATTGCTGATCACGATTCAGAGAGCGATGATGAAGAAGATAGTTTAGAACTCCAAGAAGTCTGGGCTCCT  1848

Query 1846  AAGAACGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGT  1919
            |||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.||||..||||||||.|||..|.||||
Sbjct 1849  AAGAATGGCACCCGGCGTTACTCAGAGCGGGAAGAAAAGACTGGAGACTCAGGACAGTCCAGGGAAACGGCAGT  1922

Query 1920  AAGTGGAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGT---ACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTC  1990
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||.||||.|||||||.||||||.|||||
Sbjct 1923  AAGTGGGAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTGCAACAACTCCCACCAGACGGGCCAGGCGAAGCCGTTTC  1996

Query 1991  CCCTCGAGGAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCT  2064
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1997  CCCTGGAGGAGAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTGACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCT  2070

Query 2065  AGGGATATTCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCA------------CCGC  2126
            ||||||.||.||||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||.||            ||||
Sbjct 2071  AGGGATGTTTCTGAAAAGAAAAAATCCAAGGATGTCTATCCCAGCTGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCACAGCCGC  2144

Query 2127  CAGCACAGTGGGAAACTCCAGCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCG  2200
            ||||||||.|||||||.|||||||||.||.|||||||||.||.|||||.|||||||.|||||||||||.||||.
Sbjct 2145  CAGCACAGCGGGAAACGCCAGCTCACCCAGCACTGCTTCCCAGAGCCCGGACTTTGCAAGGACGGTGACCAGCA  2218

Query 2201  GCGGCTCTTCCGAGCCTAGCCCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAG  2274
            ||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 2219  GCGGCTCTTCCGAGCCGAGCCCTCCAGAAGTAGATGTATCCAGGCAGTGTGTCTGCTCCCCTGGTGGGTCAGAG  2292

Query 2275  GACTCTGAGGCCATGGAGGAGGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGA  2348
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2293  GACTCTGAGGCCATGGAGGAGGGAGATGCAGAGAGCTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCTCAGGCCCCAGGA  2366

Query 2349  ATCCCAAAGGAGAACTAGCAGGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCC  2422
            .||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2367  GTCTCAAAGGAGAACTGGCAGGTGTTCTGATGAGGAGCGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCG  2440

Query 2423  CGGAT---------------------------------------------------------------------  2427
            |||||                                                                     
Sbjct 2441  CGGATGGTACGAGATCCGCCTTTTCCTTTAGGACTCTGCCACAAGGGGGGTCTTCAGGCCCAGCACATGATGAG  2514

Query 2428  --------------------------------------------------------------------------  2427
                                                                                      
Sbjct 2515  AGGACTAATGGGAGTGGCTGTGGGGCTACAGGTGAGGACAGGAGGGGGAGCTCCCAGCCTGAGAGTTGTGACGT  2588

Query 2428  --------------------------------------------------------------------------  2427
                                                                                      
Sbjct 2589  GCAGTCTAATGAAGACTATCCTCGGAGGCCCCTAACCAGGGCCAGGAGCAGACTGTCCCATGTACCGCTGATAT  2662

Query 2428  --------GAAGTAGCCAAAACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTAGT  2493
                    |||||.|||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 2663  CTGAGTCAGAAGTTGCCAAAACAAAGCCATGCCATGCCATGAAACGAAAGCGAACTGCAGATAAGTCTACCAGC  2736

Query 2494  ACAAGTGATCCTGTGATCGAGGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTCAC  2567
            ||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2737  ACCAGTGACCCTGTGATTGAAGATGACCACGTACAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAAAATCTTGTTGGAGTCAC  2810

Query 2568  TATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGT  2641
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2811  AATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTACTGAAAGACTGCCCCAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAGGT  2884

Query 2642  GCAGGGTACTAAAACATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAA  2715
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2885  GCAGGGTACTGAAGCATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGAAA  2958

Query 2716  CTGAACATGGATCAGGTACTAGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGCCC  2789
            ||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 2959  CTAAATATGGACCAGGTACTAGACCAAATACTGAGGATGCCTCCGGAGAGGAACCGGATCATCTACCTGCGCCC  3032

Query 2790  AATGCAGCAGGTGGACACTCTAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTATTA  2863
            ||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 3033  AATGCAGCAGGTAGACACACTAACTCTGGAGCAGAAGCTCTTCAGCGGGCCCTACCCCTATCACATCTGCATCA  3106

Query 2864  TCCATGAATTCAGTAACCCTCCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAAAC  2937
            ||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3107  TCCACGAGTTCAGCAATCCTCCCAACGTGCGGAACAAGGTGCGCATCCGCAATTGGATGGACACGATAGCCAAC  3180

Query 2938  ATCAATCAAGAGCTCATTAAATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATACCC  3011
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||.|.||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 3181  ATCAATCAAGAGCTCATTAAATACGAATTCTTCCTGGAAGCCACTCGGACTGAAGAGGATTTAAAGAAGTACCC  3254

Query 3012  CAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTCTG  3085
            .|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 3255  TAAGTATCCCTGGGGGAGAGAAATCTACACTTTAGAGGGTGTTGTAGATGGAGCGCCGTATTCCATGATTTCCG  3328

Query 3086  ACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATGAA  3159
            ||||||||||||||||||||.|.||..|.|||||||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 3329  ACTTCCCTTGGCTGAGGTCACTGCGGACCGCAGAGCCCAACAGCTTTGCCAGATATGATTTTGAAGATGATGAA  3402

Query 3160  GAAAGCACTATCTATGCTCCTAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAGGA  3233
            ||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 3403  GAGAGCACCATCTATGCTCCTCGAAGAAAAGGGCAGTTGTCTGCAGACATTTGTATGGAGACAATAGGAGAGGA  3476

Query 3234  AATTTCAGAGATGCGTCAGATGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGATG  3307
            .||.|||||||||||.||||||||||.|||..||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 3477  GATCTCAGAGATGCGCCAGATGAAGAGGGGCATATTTCAGCGAGTAGTAGCGATTTTTATCCACTACTGTGATG  3550

Query 3308  TCAATGGAGAGCCAGTTGAAGATGACTACATT  3339
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 3551  TCAATGGAGAGCCAGTTGAAGACGACTACATT  3582