Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09069
• Subject: XM_006525501.3
• Aligned Length: 1120
• Identities: 1048
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  MGPRKKSVKTCIMNNEIPEEMTADETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVV  74
            |||||||.|.|.|..|..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGPRKKSAKVCVMDSEVAEEMTADEEKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVV  74

Query   75  DLCAGRWWEYMPSGFTDASFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQSCPNLVGVETSH  148
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct   75  DLCAGRWWEYMPSGFTDSSFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGQEAFSIPGVLEALQACPNLVGVETSH  148

Query  149  LELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTK  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTK  222

Query  223  PQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLH  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  PQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLH  296

Query  297  TIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANA  370

Query  371  DLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWTRLVDINLVRCHALKLDS  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  371  DLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWMRLVDINLVRCHALKLDS  444

Query  445  FGQFIELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNND-DNNAQNNNANIHDNNHHHPD  517
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|||||.|||||||||
Sbjct  445  FGQFVELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNNDNDNNAPNNNANLHDNNHHHPD  518

Query  518  DSDEENDFRQDLQPGEQQFAADALNEMEDIVQEDGEVVAESGNNTPAHSQAIIPVDVDEEQAGPSGLQRVVKPT  591
            |||..||||.|||.||.||||||||||||.||||||.||||||..|||.....|||.|||||||||||||||||
Sbjct  519  DSDDDNDFRPDLQAGEAQFAADALNEMEDMVQEDGELVAESGNGMPAHNREVLPVDADEEQAGPSGLQRVVKPT  592

Query  592  SITVHDSESDDEEDSLELQEVWIPKNGTRRYSEREEKTGESVQSRE-LSVSGKGKTPLRKR-YNSHQMGQSKQF  663
            .|..||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|.|||| ..|||||||||||| .||||.||.|.|
Sbjct  593  PIADHDSESDDEEDSLELQEVWAPKNGTRRYSEREEKTGDSGQSRETAAVSGKGKTPLRKRCNNSHQTGQAKPF  666

Query  664  PLEESSCEKGCQVTSEQIKADMKAARDIPEKKKNKDVYPSC----SSTTASTVGNSSSHNTASQSPDFVRTVNS  733
            |||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||    |||.|||.||.||..||||||||.|||.|
Sbjct  667  PLEESSCEKGCQVTSEQIKADMKAARDVSEKKKSKDVYPSCSSSSSSTAASTAGNASSPSTASQSPDFARTVTS  740

Query  734  GGSSEPSPTEVDVSRQCACSPGGSEDSEAMEEGDAESSVCPRCCCHRPQESQRRTSRCSDEERPSTSRACVVNG  807
            .|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  741  SGSSEPSPPEVDVSRQCVCSPGGSEDSEAMEEGDAESSVCPRCCCLRPQESQRRTGRCSDEERPSTSRACVVNG  814

Query  808  PDEVAKTKPRHAMKRKRTADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRC  881
            .||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ADEVAKTKPCHAMKRKRTADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRC  888

Query  882  RVLKHLKVENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICII  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  RVLKHLKVENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICII  962

Query  956  HEFSNPPNVRNKVRIRSWMDTIANINQELIKYEFFPEATRSEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISD  1029
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  HEFSNPPNVRNKVRIRNWMDTIANINQELIKYEFFLEATRTEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISD  1036

Query 1030  FPWLRSLRAAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKKGVFQRVVAIFIHYCDV  1103
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1037  FPWLRSLRTAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKRGIFQRVVAIFIHYCDV  1110

Query 1104  NGEPVEDDYI  1113
            ||||||||||
Sbjct 1111  NGEPVEDDYI  1120