Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09120
- Subject:
- NM_001193451.2
- Aligned Length:
- 2646
- Identities:
- 2320
- Gaps:
- 324
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTGGTGACCACCTCTGCCCGAGGCGGCGGCGGGGACCGCACACCCTCCCGGCGGCGGGGCTGCGGGCTAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCGGCCGGGGCCGCGGCGCTGCTGGCCGGGGCAAGCTGCCTGTGCTACGGCCGCTCCCTGCAGGGCGAGTTCG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGCACGACGACGTGTGGGCGATCGTGAACAACCCCGACGTGCGGCCCGGCGCCCCGCTCCGCTGGGGCATCTTC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACCAACGACTTCTGGGGCAAGGGCATGGCCGAGAACACCAGCCACAAGTCCTACCGGCCGCTCTGCGTCCTCAC 296
Query 1 ----------------------------ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT 46
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTCAAGCTAAACATATTTTTGACTGGTATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT 370
Query 47 TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA 444
Query 121 TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG 194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG 518
Query 195 TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT 592
Query 269 CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC 666
Query 343 ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGG 416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGG 740
Query 417 GGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGG 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGG 814
Query 491 AGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCC 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCC 888
Query 565 AAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCATGATGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTT 638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCATGATGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTT 962
Query 639 GGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGG 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGG 1036
Query 713 TAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCAC 786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCAC 1110
Query 787 TGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCAT 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCAT 1184
Query 861 TCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCT 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCT 1258
Query 935 ACTGCATCCTTTTTGTGCACGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATT 1008
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACTGCATCCTTTTTGTGCATGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATT 1332
Query 1009 GTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGA 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGA 1406
Query 1083 GTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGA 1156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGA 1480
Query 1157 AGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGT 1230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGT 1554
Query 1231 GCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCT 1304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCT 1628
Query 1305 CCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTA 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTA 1702
Query 1379 TCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTG 1452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTG 1776
Query 1453 GCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGA 1526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGA 1850
Query 1527 TTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGG 1924
Query 1601 CCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAAC 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAAC 1998
Query 1675 AGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGC 1748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGC 2072
Query 1749 ACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTC 1822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTC 2146
Query 1823 AGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACC 1896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACC 2220
Query 1897 AATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGA 1970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGA 2294
Query 1971 GAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTG 2044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTG 2368
Query 2045 AACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGATTG 2118
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2369 AACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGAGTG 2442
Query 2119 GCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATA 2192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATA 2516
Query 2193 TGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTG 2266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTG 2590
Query 2267 CCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA 2646