Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09120
• Subject: NM_001193451.2
• Aligned Length: 882
• Identities: 773
• Gaps: 108

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MVVTTSARGGGGDRTPSRRRGCGLAPAGAAALLAGASCLCYGRSLQGEFVHDDVWAIVNNPDVRPGAPLRWGIF  74

Query   1  ----------------------------------MNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTA  40
                                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTGMNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTA  148

Query  41  LLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETG  114
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETG  222

Query 115  ITVFGVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENGKQQRFPHKGAWGGCHSPLPPEP  188
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ITVFGVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENGKQQRFPHKGAWGGCHSPLPPEP  296

Query 189  KSSGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSLH  262
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  KSSGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSLH  370

Query 263  CLAAFKRLEHKEVLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLI  336
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CLAAFKRLEHKEVLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLI  444

Query 337  VSTVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHAS  410
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  VSTVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHAS  518

Query 411  ALNNLGTLTRDTAEAKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLL  484
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  ALNNLGTLTRDTAEAKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLL  592

Query 485  AEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHVAMVNLGRLYRSLGEN  558
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHVAMVNLGRLYRSLGEN  666

Query 559  SMAEEWYKRALQVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMT  632
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  SMAEEWYKRALQVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMT  740

Query 633  NHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALDAIDKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRL  706
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 741  NHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALDAIDKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRV  814

Query 707  AVQLNPDQAQAWMNMGGIQHIKGKYVSARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKLDRLEKRLQEVREKDQT  774
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  AVQLNPDQAQAWMNMGGIQHIKGKYVSARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKLDRLEKRLQEVREKDQT  882