Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09120
• Subject: NM_198967.5
• Aligned Length: 943
• Identities: 689
• Gaps: 170

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MLVTRGDRGGGERAPSRRPRCGLVPAGAAALLAGASCLCYGRSLRGEFVHDDVWAIVNNPDVRPGTPLRWAIFA  74

Query   1  ---------------------------------MNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTAL  41
                                            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  NDFWGKGLADSTSHKSYRPLCVLSFRLNIFLTGMNPFYFHAVNVILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTAL  148

Query  42  LFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGI  115
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|..||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LFAVHPVHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYQRSLDQGCAGQCFPTTASPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGI  222

Query 116  TVFGVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENGKQQRFPHKGAWGGCHSPLPPEPK  189
           |||||||||||||.|.||||.||||.|..|..|||||||||...|||||. ..||||||..|||||||||||||
Sbjct 223  TVFGVCLVYDLFSPSHKQDKLSNGAVCQHSSGQPGSPQPSSQQAHPHRES-RKQRFPHKDSWGGCHSPLPPEPK  295

Query 190  SSGFPVSPRAVWSMM-----------------------------------------------------------  204
           |||||.||||.||.|                                                           
Sbjct 296  SSGFPMSPRAMWSLMRCLTGSTNRNFLLTLRPFLKRAILVISYVTVILYFRLWIMGGTMPLFSEQDNPASFSPY  369

Query 205  ---RFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSLHCLAAFKRLEHKEV  275
              |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 370  ILTRFLTYSYLLAFNVWLLLAPITLCYDWQVGSIPLVETIWDVRNLATILLAVVMALLSLHCVAAFKRLEHKEV  443

Query 276  LVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIVSTVLLLLLFSWK  349
           |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.|..||||||||||||
Sbjct 444  LAGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCAGLSRCGATSLMASTVLLLLLFSWK  517

Query 350  TVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDTA  423
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct 518  TVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTKDMA  591

Query 424  EAKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAITLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIY  497
           |||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 592  EAKMYYQKALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKTEEAIMLLKESIKYGPDFADAYSSLASLLAEQERFKEAEDIY  665

Query 498  QTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHVAMVNLGRLYRSLGENSMAEEWYKRALQV  571
           |.|||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|
Sbjct 666  QAGIKNCPDSSDLHNNYAVFLVDSGFPEKAVAHYQQAIQLSPSHHVAVVNLGRLYRSLGENSKAEEWYRRALKV  739

Query 572  AHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLEC  645
           |..||.|||||||||||||..|||..|.||..|||||||||||||||||||||||||||.|.||||||..||||
Sbjct 740  ARTAEVLSPLGALYYNTGRHKEALEVYREAVSLQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKITSHIVSEEPRCLEC  813

Query 646  YRLLSAIYSKQENHDKALDAIDKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRLAVQLNPDQAQAWM  719
           |||||||.||||.|.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|.||||||||
Sbjct 814  YRLLSAIHSKQEHHGKALEAIEKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYEAAVTLDPDQAQAWM  887

Query 720  NMGGIQHIKGKYVSARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKLDRLEKRLQEVREKDQT  774
           |||||.||.|.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 888  NMGGIRHIQGSYVSARAYYERALKLVPDSKLLKENLAKLDRLERRLQEVRERDQT  942