Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09120
• Subject: XM_017020003.1
• Aligned Length: 2832
• Identities: 2153
• Gaps: 678

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGGTGACCACCTCTGCCCGAGGCGGCGGCGGGGACCGCACACCCTCCCGGCGGCGGGGCTGCGGGCTAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCGGCCGGGGCCGCGGCGCTGCTGGCCGGGGCAAGCTGCCTGTGCTACGGCCGCTCCCTGCAGGGCGAGTTCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCACGACGACGTGTGGGCGATCGTGAACAACCCCGACGTGCGGCCCGGCGCCCCGCTCCGCTGGGGCATCTTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACCAACGACTTCTGGGGCAAGGGCATGGCCGAGAACACCAGCCACAAGTCCTACCGGCCGCTCTGCGTCCTCAC  296

Query    1  ----------------------------ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAAGCTAAACATATTTTTGACTGGTATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT  370

Query   47  TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA  444

Query  121  TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG  518

Query  195  TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT  592

Query  269  CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC  666

Query  343  ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGG  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGG  740

Query  417  GGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGG  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGG  814

Query  491  AGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCC  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCC  888

Query  565  AAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCATGAT---------------------------  611
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  889  AAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCATGATGAGGTATCTGAGAGCAAGCAGCAATAG  962

Query  612  --------------------------------------------------------------------------  611
                                                                                      
Sbjct  963  AAATTTCCTGCTTACCATGAGACCATTTTTAAAAAGGGCCATTTTGGTCCTAAGTTATGTGCTTGTCATTTTGT  1036

Query  612  --------------------------------------------------------------------------  611
                                                                                      
Sbjct 1037  ACTTCCGTCTGTGGATAATGGGAGGATCTATGCCCCTCTTTTCAGAGCAGGATAATCCAGCTTCATTTTCGCCT  1110

Query  612  -----------GAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGAC  674
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACATTCTTACGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGAC  1184

Query  675  CCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCA  748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCA  1258

Query  749  TCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAG  822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAG  1332

Query  823  GTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGT  896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGT  1406

Query  897  GGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCTACTGCATCCTTTTTGTGCACGGACTGAGCAAGCTCT  970
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 1407  GGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCT----------------------------------------------  1434

Query  971  GCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATTGTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGG  1044
                                                                                      
Sbjct 1435  --------------------------------------------------------------------------  1434

Query 1045  AAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGAGTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCA  1118
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  ------------------------------------------------AGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCA  1460

Query 1119  CAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACT  1192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461  CAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACT  1534

Query 1193  ACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACA  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535  ACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACA  1608

Query 1267  GCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGG  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609  GCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGG  1682

Query 1341  GAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAG  1414
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683  GAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAG  1756

Query 1415  AGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATA  1488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757  AGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATA  1830

Query 1489  TACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATAC  1562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1831  TACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATAC  1904

Query 1563  TGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGG  1636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1905  TGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGG  1978

Query 1637  TGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAG  1710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979  TGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAG  2052

Query 1711  GTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTT  1784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053  GTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTT  2126

Query 1785  GCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGG  1858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2127  GCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGG  2200

Query 1859  CCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAA  1932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2201  CCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAA  2274

Query 1933  TGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGC  2006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2275  TGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGC  2348

Query 2007  TCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGC  2080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2349  TCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGC  2422

Query 2081  AGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGATTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGG  2154
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2423  AGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGAGTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGG  2496

Query 2155  ATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACA  2228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2497  ATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACA  2570

Query 2229  GCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAG  2302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571  GCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAG  2644

Query 2303  TTCGAGAAAAGGATCAAACA  2322
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 2645  TTCGAGAAAAGGATCAAACA  2664