Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09120
• Subject: XM_017020004.1
• Aligned Length: 2720
• Identities: 2207
• Gaps: 493

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGGTGACCACCTCTGCCCGAGGCGGCGGCGGGGACCGCACACCCTCCCGGCGGCGGGGCTGCGGGCTAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCCGGCCGGGGCCGCGGCGCTGCTGGCCGGGGCAAGCTGCCTGTGCTACGGCCGCTCCCTGCAGGGCGAGTTCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCACGACGACGTGTGGGCGATCGTGAACAACCCCGACGTGCGGCCCGGCGCCCCGCTCCGCTGGGGCATCTTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACCAACGACTTCTGGGGCAAGGGCATGGCCGAGAACACCAGCCACAAGTCCTACCGGCCGCTCTGCGTCCTCAC  296

Query    1  ----------------------------ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAAGCTAAACATATTTTTGACTGGTATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCT  370

Query   47  TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTGTGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCA  444

Query  121  TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATACTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTG  518

Query  195  TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCGTACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTT  592

Query  269  CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCTCAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGC  666

Query  343  ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCG-AGCAATG  415
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
Sbjct  667  ATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGTA------  734

Query  416  GGGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGC-----------CCTCCTCAC--TG---CC  473
                  ||||            |.||||       ||    ||||           |||.||.||  ||   ||
Sbjct  735  ------TCTG------------AGAGCA-------AG----CAGCAATAGAAATTTCCTGCTTACCATGAGACC  779

Query  474  A-----------GGCCA------TCCTCA-------------------------CCG-----GGAGAATGGGAA  500
            |           |||||      ||||.|                         |||     |||.||||||  
Sbjct  780  ATTTTTAAAAAGGGCCATTTTGGTCCTAAGTTATGTGCTTGTCATTTTGTACTTCCGTCTGTGGATAATGGG--  851

Query  501  GCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCCAAGAGCAGTG  574
                                 ||||.||        .||||.||||...|               ||||||  |
Sbjct  852  ---------------------AGGATCT--------ATGCCCCTCTTTTC---------------AGAGCA--G  879

Query  575  GAT--TCC-----CAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCA---TGATGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTT  638
            |||  |||     ||.|.||.||            .|.||   |.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  GATAATCCAGCTTCATTTTCGCC------------TTACATTCTTACGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTT  941

Query  639  GGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGG  1015

Query  713  TAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCAC  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  TAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCAC  1089

Query  787  TGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCAT  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  TGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCAT  1163

Query  861  TCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCT  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  TCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCT  1237

Query  935  ACTGCATCCTTTTTGTGCACGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATT  1008
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  ACTGCATCCTTTTTGTGCATGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATT  1311

Query 1009  GTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  GTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGA  1385

Query 1083  GTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGA  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  GTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGA  1459

Query 1157  AGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGT  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  AGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGT  1533

Query 1231  GCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCT  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534  GCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCT  1607

Query 1305  CCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTA  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608  CCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTA  1681

Query 1379  TCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTG  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682  TCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTG  1755

Query 1453  GCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGA  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1756  GCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGA  1829

Query 1527  TTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGG  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1830  TTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGG  1903

Query 1601  CCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAAC  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1904  CCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAAC  1977

Query 1675  AGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGC  1748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978  AGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGC  2051

Query 1749  ACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTC  1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052  ACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTC  2125

Query 1823  AGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACC  1896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126  AGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACC  2199

Query 1897  AATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGA  1970
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2200  AATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGA  2273

Query 1971  GAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTG  2044
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2274  GAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTG  2347

Query 2045  AACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGATTG  2118
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2348  AACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGAGTG  2421

Query 2119  GCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATA  2192
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2422  GCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATA  2495

Query 2193  TGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTG  2266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2496  TGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTG  2569

Query 2267  CCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  2322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570  CCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  2625