Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09120
• Subject: XM_017020007.2
• Aligned Length: 2353
• Identities: 1801
• Gaps: 530

Alignment

Query    1  ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCTTAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCATTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTGTCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTTCCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGAC-----------AGG--CATCACGGTGTTTGG-  356
                                               |.|||||           |||  |||       ||||| 
Sbjct    1  -----------------------------------ATGAGACCATTTTTAAAAAGGGCCAT-------TTTGGT  32

Query  357  ----AG---TGTGCTTGGTTTATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGGGGCCCTC  423
                ||   ||||||||  |.||      |||...|||                               ||.||
Sbjct   33  CCTAAGTTATGTGCTTG--TCAT------TTTGTACTT-------------------------------CCGTC  67

Query  424  TGTCCACGCAGCCCACAGCAGCCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGGAGAATGG  497
            |||                                                              |||.|||||
Sbjct   68  TGT--------------------------------------------------------------GGATAATGG  79

Query  498  GAAGCAGCAGCGGTTCCCTCACAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCCAAGAGCA  571
            |                       ||||.||        .||||.||||...|               ||||||
Sbjct   80  G-----------------------AGGATCT--------ATGCCCCTCTTTTC---------------AGAGCA  107

Query  572  GTGGAT--TCC-----CAGTGTCCCCACGAGCTGTGTGGTCCA---TGATGAGATTCCTCACCTATTCCTACCT  635
              ||||  |||     ||.|.||.||            .|.||   |.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  108  --GGATAATCCAGCTTCATTTTCGCC------------TTACATTCTTACGAGATTCCTCACCTATTCCTACCT  167

Query  636  CTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTC  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  CTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCACCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTC  241

Query  710  TGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  TGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTTAGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTG  315

Query  784  CACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  CACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGCACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTT  389

Query  858  CATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGG  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  CATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTGGGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGG  463

Query  932  GCTACTGCATCCTTTTTGTGCACGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTG  1005
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  GCTACTGCATCCTTTTTGTGCATGGACTGAGCAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTG  537

Query 1006  ATTGTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAG  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  ATTGTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTTTCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAG  611

Query 1080  AGAGTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCC  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  AGAGTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACTCTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCC  685

Query 1154  TGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCA  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  TGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGATCTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCA  759

Query 1228  AGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCA  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  AGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGAGAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCA  833

Query 1302  GCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAG  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  GCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTCAATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAG  907

Query 1376  CTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTA  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  CTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATATGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTA  981

Query 1450  TTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTC  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  TTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTGAAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTC  1055

Query 1524  AGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGC  1597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  AGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTAGTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGC  1129

Query 1598  AGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAG  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  AGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGTGGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAG  1203

Query 1672  AACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGG  1745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  AACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCGCCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGG  1277

Query 1746  AGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTT  1819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  AGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAAGAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTT  1351

Query 1820  CTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATG  1893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  CTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCAGGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATG  1425

Query 1894  ACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCA  1967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  ACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGATGCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCA  1499

Query 1968  GGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTT  2041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  GGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATAGACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTT  1573

Query 2042  CTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGA  2115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  CTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATTAAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGA  1647

Query 2116  TTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAA  2189
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  GTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCACAGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAA  1721

Query 2190  ATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATC  2263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722  ATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGAGCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATC  1795

Query 2264  TTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  2322
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796  TTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATTACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  1854