Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09120
• Subject: XM_024449218.1
• Aligned Length: 2322
• Identities: 2113
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCTTAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCATTCTACTTTCATGCAGTAAATATAATTTTACACTGCTTAGTGACTCTTGTGCTGATGTACACCTG  74

Query   75  TGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCATTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGATAAAACTGTCTTCAAGAATCGTGGACTTGCTTTTGTAACGGCATTGCTTTTTGCTGTACATCCTATTCATA  148

Query  149  CTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTGTCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAGGCGGTGGCTGGGATCGTTGGCAGAGCGGACGTGTTAGCGTGTCTGCTGTTTCTATTGGCCTTTCTCTCG  222

Query  223  TACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTTCCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACAACAGGAGTCTGGATCAGGGCTGTGTTGGGGGAAGTTTCCCTTCCACGGTGTCTCCCTTCTTCTTGCTGCT  296

Query  297  CAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGCATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGTTTGTTTCTGGGGACCTGTGCGATGCTGGTGAAAGAGACAGGCATCACGGTGTTTGGAGTGTGCTTGGTTT  370

Query  371  ATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTCGAGCAATGGGGCCCTCTGTCCACGCAGCCCACAGCAG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                     
Sbjct  371  ATGACCTCTTTTCCCTTTCCAACAAGCAAGACAAGTC-------------------------------------  407

Query  445  CCCGGGAGCCCCCAGCCCTCCTCACTGCCAGGCCATCCTCACCGGGAGAATGGGAAGCAGCAGCGGTTCCCTCA  518
                                                                                      
Sbjct  408  --------------------------------------------------------------------------  407

Query  519  CAAAGGAGCTTGGGGTGGCTGCCACTCTCCACTGCCACCAGAACCCAAGAGCAGTGGATTCCCAGTGTCCCCAC  592
                                                                                      
Sbjct  408  --------------------------------------------------------------------------  407

Query  593  GAGCTGTGTGGTCCATGATGAGATTCCTCACCTATTCCTACCTCTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCA  666
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  ----------------------ATTCCTCACCTATTCCTACCTCTTGGCCTTCAATGTGTGGCTTCTGCTTGCA  459

Query  667  CCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  CCCGTGACCCTGTGCTATGACTGGCAGGTCGGCAGTATTCCTCTGGTAGAGACCATATGGGACATGCGGAACTT  533

Query  741  AGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534  AGCCACCATCTTTCTGGCGGTTGTGATGGCCTTATTGAGCCTGCACTGCTTAGCAGCCTTTAAGAGACTGGAGC  607

Query  815  ACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  ACAAGGAGGTTTTAGTCGGCTTGTTGTTCCTGGTGTTCCCGTTCATTCCAGCCAGCAACCTCTTCTTCAGGGTG  681

Query  889  GGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCTACTGCATCCTTTTTGTGCACGGACTGAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  682  GGTTTTGTGGTGGCGGAGAGAGTCCTTTACATGCCTAGCATGGGCTACTGCATCCTTTTTGTGCATGGACTGAG  755

Query  963  CAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATTGTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  CAAGCTCTGCACTTGGCTGAATCGATGTGGGGCCACCACCCTGATTGTGTCCACTGTGTTGCTGCTGTTGCTTT  829

Query 1037  TCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGAGTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  TCTCTTGGAAAACTGTGAAACAGAATGAAATTTGGCTGTCAAGAGAGTCCCTATTCAGGTCTGGAGTTCAAACT  903

Query 1111  CTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904  CTGCCCCACAATGCCAAGGTTCACTACAACTATGCCAATTTCCTGAAGGACCAAGGTCGGAACAAGGAAGCGAT  977

Query 1185  CTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  978  CTACCACTACAGAACAGCTCTCAAGTTGTATCCACGCCATGCAAGTGCGCTCAACAACCTTGGAACACTGACGA  1051

Query 1259  GAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052  GAGACACAGCAGAGGCAAAGATGTACTATCAGAGGGCTCTCCAGCTCCATCCACAGCATAACCGGGCTCTTTTC  1125

Query 1333  AATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126  AATCTGGGGAATCTCCTCAAGTCCCAGGAGAAAAAGGAAGAAGCTATCACCTTACTGAAGGATTCCATCAAATA  1199

Query 1407  TGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200  TGGTCCAGAGTTTGCAGATGCATATTCAAGCTTAGCTTCGTTATTGGCTGAGCAGGAGCGGTTTAAAGAAGCTG  1273

Query 1481  AAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274  AAGAAATATACCAAACTGGAATAAAGAACTGTCCAGACAGCTCAGATTTACACAACAACTATGGGGTTTTCTTA  1347

Query 1555  GTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348  GTTGATACTGGCTTACCAGAAAAGGCAGTGGCCCATTACCAGCAGGCCATCAAACTTAGCCCCAGTCATCACGT  1421

Query 1629  GGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422  GGCCATGGTGAACTTGGGAAGACTCTACAGGTCACTGGGAGAGAACAGCATGGCTGAAGAATGGTACAAGCGCG  1495

Query 1703  CCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496  CCCTGCAGGTGGCACACAAAGCTGAGATATTGTCACCTTTGGGAGCACTGTATTACAACACTGGCCGATACGAA  1569

Query 1777  GAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570  GAGGCTTTGCAGATTTACCAGGAAGCTGCAGCACTTCAGCCTTCTCAGAGGGAGCTCCGCTTGGCACTGGCTCA  1643

Query 1851  GGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGAT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1644  GGTTTTGGCCGTGATGGGTCAGACAAAAGAAGCTGAAAAGATGACCAATCACATTGTGTCAGAGGAGACCGGAT  1717

Query 1925  GCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718  GCCTTGAATGCTATCGCCTCTTGTCAGCCATCTATAGCAAGCAGGAGAACCACGACAAGGCACTTGATGCTATA  1791

Query 1999  GACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792  GACAAGGCTCTCCAGCTGAAACCAAAGGACCCAAAAGTCATTTCTGAACTTTTTTTCACAAAAGGAAACCAATT  1865

Query 2073  AAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGATTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCAC  2146
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866  AAGAGAGCAGAACCTTCTCGACAAAGCTTTTGAGAGCTATAGAGTGGCTGTGCAACTAAACCCAGACCAAGCAC  1939

Query 2147  AGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940  AGGCCTGGATGAACATGGGTGGCATCCAACACATCAAGGGAAAATATGTGTCTGCAAGAGCTTATTATGAGAGA  2013

Query 2221  GCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2014  GCCTTACAGCTGGTTCCAGACAGCAAACTGCTGAAGGAAAATCTTGCCAAATTGGATCGCCTAGAAAAACGATT  2087

Query 2295  ACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  2322
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088  ACAAGAAGTTCGAGAAAAGGATCAAACA  2115