Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09191
• Subject: NM_001130083.2
• Aligned Length: 1935
• Identities: 1562
• Gaps: 372

Alignment

Query    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74

Query   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148

Query  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222

Query  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296

Query  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370

Query  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444

Query  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518

Query  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592

Query  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666

Query  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740

Query  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814

Query  815  GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAAACAAGGAAACCAGAACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGC  888

Query  889  CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGTGTGATTTATGCCAAGCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGC  962

Query  963  CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCTATGACATCGACCGCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGCAGGGGACAGGCAGA  1036

Query 1037  GCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTACGGCGAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGTCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCG  1110

Query 1111  GTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCA-----------------  1167
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1111  GTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTCCAGCTGGTACTGTGAGTGT  1184

Query 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167
                                                                                      
Sbjct 1185  GGGTACCAGTAGCTGCCTCTCCCTGTCCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTCAGACATCATTACATCCCCT  1258

Query 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167
                                                                                      
Sbjct 1259  ACTTCCGAGGCAGTGAAAGTGGCCGGAGCACCCCCAGCCTCTCCGTGCTCTCTGACAGCAAGCCGCCCCCCTCC  1332

Query 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167
                                                                                      
Sbjct 1333  ACCTACCAGCAGGCACCTCGCCACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCC  1406

Query 1168  ----------------GCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGA  1225
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATCTACAGACAGCATGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGA  1480

Query 1226  AGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTG  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTG  1554

Query 1300  TCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCAC----------  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
Sbjct 1555  TCCCACAGCAGCGGGACCGACAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACGATTCCCCTA  1628

Query 1364  --------------------------------------------------------------------------  1363
                                                                                      
Sbjct 1629  TTCCAAATCTGACCCTCTCCCAGGACATGGAAAGAATGGCTTGGACCAGCGGAATGCCAATCTGGCCCCCTGTG  1702

Query 1364  ---------------------------------AATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAAC  1404
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCATGCGAGAATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAAC  1776

Query 1405  CGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCA  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCA  1850

Query 1479  GGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAG  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAG  1924

Query 1553  CCCTTTTGTTC  1563
            |||||||||||
Sbjct 1925  CCCTTTTGTTC  1935