Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09191
• Subject: XM_006503907.1
• Aligned Length: 2116
• Identities: 1360
• Gaps: 557

Alignment

Query    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||....|||.|||||||||.||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGAGCGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCATGCCCCACTGGAGAAGCCGGCCAGCACTGCGATCCTGTGTAA  74

Query   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148
            .||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct   75  TACCTGTGGGAATGTGTGCAAGGGAGAGGTGCTGCGTGTGCAGAACAAGTACTTCCACATCAGGTGCTTTGTGT  148

Query  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222
            |.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||.||||.|||||.|..|||
Sbjct  149  GCAAAGCGTGTGGCTGTGACCTGGCTGAGGGTGGCTTCTTCGTGAGGCAGGGTGAGCACATTTGCACACGTGAC  222

Query  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296
            ||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  TACCAGCGGCTCTATGGCACTCGCTGCTTCAGCTGTGACCGCTTCATTGAAGGCGAAGTGGTGTCGGCGCTTGG  296

Query  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  297  GAAGACCTACCACCCTGACTGCTTCGTGTGTGCTGTCTGCAGGCTGCCCTTTCCTCCTGGGGACCGTGTGACCT  370

Query  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||..||.|.||||||.|||.||.|||.||.|||||
Sbjct  371  TCAACGGGAAGGAGTGTATGTGCCAGAAGTGTTCCCCACCCACATTGCTGGGCAACAGTGCTCACGTGGCCCAG  444

Query  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518
            ||||||||.||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTCCGGAGTTGTGGGGGCTGTGGCTTAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTGGCTTTGGACAAGCACTG  518

Query  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592
            ||||.||||.||.||.||||||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCACCTGGGATGCTTCAAGTGCAAGACTTGTGGGAAACTCCTCAATGCAGAGTACATCAGCAAGGACGGGCTGC  592

Query  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666
            ||||||||||.|||||.||||||..||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  593  CCTACTGCGAGGCTGATTATCACAGCAAGTTTGGCATCCGCTGCGACGGCTGTGAGAAGTACATCACGGGCCGG  666

Query  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  667  GTGCTAGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCATGTGCGCTATGCGTCAGGTGCGGCCAGATGTTCTCAGA  740

Query  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814
            .|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGGCGAGGAGATGTACCTGCAAGGCTCCTCCATCTGGCATCCGGCATGTCGACAGGCAGCCAGGACTGAAGACA  814

Query  815  GAAACA---------------------------------------------------------AGGAAACCAGA  831
            ..|.||                                                         ||||||||||.
Sbjct  815  AGAGCAAGATGCACAGCTCTGTTTGCAGCCAGCCCTGCCCGGGCACCCTGCCCTGTGCCTTACAGGAAACCAGG  888

Query  832  ACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAA  905
            |||||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  889  ACTTCTTCGGAGAGCATTGTCTCCGTGCCTGCCTCCAGCACGTCAGGGTCCCCGAGCCGTGTGATCTACGCAAA  962

Query  906  GCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACC  979
            ||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||..||.||.|||||..|||||||||
Sbjct  963  GCTTGGCGATGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCTGCTCTTCCCAAAAACAAAGCGATCTACAACATCGACC  1036

Query  980  GCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGC---AGGGGACAGGCAGAGCTACGGCGAGGGG  1050
            |||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||   .|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  GCCCCGACATGATCTCCTATTCGCCCTACATTAGCCACTCGGCCGTGGGGGACAGGCAGAGCTATGGCGAGGGG  1110

Query 1051  GATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAGCCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCG  1124
            |||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|.
Sbjct 1111  GATCAGGATGATCGGTCCTACAAGCAGTGCAGGACCTCCAGCCCCAGCTCTGCCGGCTCAGTCAGCCTCGGACA  1184

Query 1125  CTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTC---------------------------------  1165
            ||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||                                 
Sbjct 1185  CTACACCCCAACCTCACGGTCACCCCAGCACTACAGTCGTCCAGCTGGTACTGTGAGTGTTGGTACCAGTAGCT  1258

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1259  GTCTGTCCCTGTCCCAACACCCAAGCCCTACATCCGTGTTCAGACATCATTACATCCCCTACTTCCGAGGCAGC  1332

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1333  GAAAGTGGCCGTAGCACCCCGAGTCTCTCAGTGCACTCCGACAGCAGACCTCCTTCCTCTACCTACCAGCAGGC  1406

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1407  TCCGAGACACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTACAAACAGC  1480

Query 1166  --------------------------------------------------------------------------  1165
                                                                                      
Sbjct 1481  ACGGTCCTGTAGCCCAGTCCCCAATGTCCAAGCTCTCTGGCCTGGTGTCAGTTTTGTCCTTGGTGGTGCAGGAG  1554

Query 1166  ----------------------------------------------CAGCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGA  1193
                                                          |||||||||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 1555  GCAGGGCGCTCCAAGAGATGGGCAGGGCTGAGCCCACCGCAGGCTGCAGCTGCCAGGCGATTGGACGTGGAGGA  1628

Query 1194  TGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGA  1267
            ..|.|||||.||||||||.|.|||||   ||||||..|.|||||||.|.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1629  CAGCAGCTTTGACCAGGACAGCAGGA---AGAAGACAACCTGGCTGCTTCTCAAGGGGGATGCAGACACCAGAA  1699

Query 1268  CCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGA-CAGAGACCCTCTCCAAAGGAT  1340
            |.||.||||||||||||||||..|||||..||||||.||||||||||||.|| ||| ||.|||||||||||.||
Sbjct 1700  CTAACTCTCCAGACCTGGACAGTCAGTCGCTGTCCCTCAGCAGCGGGACTGACCAG-GAACCTCTCCAAAGAAT  1772

Query 1341  GGCAGGGGACAGCTTTCACTCAC---------------------------------------------------  1363
            |||||||||||||.|..||||||                                                   
Sbjct 1773  GGCAGGGGACAGCCTCTACTCACGCTTTCCTTATTCCAAACCTGACACTCTTCCAGGACCCAGGAAGGATGGCC  1846

Query 1364  ------------------------------------------------------------------AATACAAG  1371
                                                                              |.||.|||
Sbjct 1847  TGGACCTCCGGAATGCCAACCTGGCCCCTTGTGGAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCACGCGAGAGTATAAG  1920

Query 1372  ATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAG  1445
            ||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1921  ATATATCCCTATGATTCCCTCATCGTAACAAACCGAATTCGTGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACACG  1994

Query 1446  ACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGG  1519
            .||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  GCTGGAGAGACACCTATCACCTGAGGAGTTCCAAGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGG  2068

Query 1520  CCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1563
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|..|||||
Sbjct 2069  CCCTGTGGAAGAGGAATGACCTCAAGAAGAAAGCCTTGCTGTTC  2112