Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09191
- Subject:
- XM_006503910.1
- Aligned Length:
- 2050
- Identities:
- 1360
- Gaps:
- 491
Alignment
Query 1 ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA 74
|||||.|||||||||||||||||||||||||....|||.|||||||||.||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGAGCGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCATGCCCCACTGGAGAAGCCGGCCAGCACTGCGATCCTGTGTAA 74
Query 75 CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT 148
.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct 75 TACCTGTGGGAATGTGTGCAAGGGAGAGGTGCTGCGTGTGCAGAACAAGTACTTCCACATCAGGTGCTTTGTGT 148
Query 149 GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC 222
|.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||.||||.|||||.|..|||
Sbjct 149 GCAAAGCGTGTGGCTGTGACCTGGCTGAGGGTGGCTTCTTCGTGAGGCAGGGTGAGCACATTTGCACACGTGAC 222
Query 223 TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG 296
||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 223 TACCAGCGGCTCTATGGCACTCGCTGCTTCAGCTGTGACCGCTTCATTGAAGGCGAAGTGGTGTCGGCGCTTGG 296
Query 297 CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT 370
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 297 GAAGACCTACCACCCTGACTGCTTCGTGTGTGCTGTCTGCAGGCTGCCCTTTCCTCCTGGGGACCGTGTGACCT 370
Query 371 TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG 444
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||..||.|.||||||.|||.||.|||.||.|||||
Sbjct 371 TCAACGGGAAGGAGTGTATGTGCCAGAAGTGTTCCCCACCCACATTGCTGGGCAACAGTGCTCACGTGGCCCAG 444
Query 445 GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG 518
||||||||.||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 GGCCTCCGGAGTTGTGGGGGCTGTGGCTTAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTGGCTTTGGACAAGCACTG 518
Query 519 GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC 592
||||.||||.||.||.||||||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GCACCTGGGATGCTTCAAGTGCAAGACTTGTGGGAAACTCCTCAATGCAGAGTACATCAGCAAGGACGGGCTGC 592
Query 593 CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC 666
||||||||||.|||||.||||||..||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 593 CCTACTGCGAGGCTGATTATCACAGCAAGTTTGGCATCCGCTGCGACGGCTGTGAGAAGTACATCACGGGCCGG 666
Query 667 GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA 740
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 667 GTGCTAGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCATGTGCGCTATGCGTCAGGTGCGGCCAGATGTTCTCAGA 740
Query 741 AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA 814
.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 741 GGGCGAGGAGATGTACCTGCAAGGCTCCTCCATCTGGCATCCGGCATGTCGACAGGCAGCCAGGACTGAAGACA 814
Query 815 GAAACA---------------------------------------------------------AGGAAACCAGA 831
..|.|| ||||||||||.
Sbjct 815 AGAGCAAGATGCACAGCTCTGTTTGCAGCCAGCCCTGCCCGGGCACCCTGCCCTGTGCCTTACAGGAAACCAGG 888
Query 832 ACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAA 905
|||||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 889 ACTTCTTCGGAGAGCATTGTCTCCGTGCCTGCCTCCAGCACGTCAGGGTCCCCGAGCCGTGTGATCTACGCAAA 962
Query 906 GCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACC 979
||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||..||.||.|||||..|||||||||
Sbjct 963 GCTTGGCGATGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCTGCTCTTCCCAAAAACAAAGCGATCTACAACATCGACC 1036
Query 980 GCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGC---AGGGGACAGGCAGAGCTACGGC------ 1044
|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|| .|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 GCCCCGACATGATCTCCTATTCGCCCTACATTAGCCACTCGGCCGTGGGGGACAGGCAGAGCTATGGCGAGTCA 1110
Query 1045 ---------------------------GAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAG 1091
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1111 CCTCAGTTGCTCTCACCAACGCCGACTGAGGGGGATCAGGATGATCGGTCCTACAAGCAGTGCAGGACCTCCAG 1184
Query 1092 CCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTC 1165
|||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185 CCCCAGCTCTGCCGGCTCAGTCAGCCTCGGACACTACACCCCAACCTCACGGTCACCCCAGCACTACAGTCGTC 1258
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1259 CAGGCAGCGAAAGTGGCCGTAGCACCCCGAGTCTCTCAGTGCACTCCGACAGCAGACCTCCTTCCTCTACCTAC 1332
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1333 CAGCAGGCTCCGAGACACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTA 1406
Query 1166 -------------------------------------------------------------------------- 1165
Sbjct 1407 CAAACAGCACGGTCCTGTAGCCCAGTCCCCAATGTCCAAGCTCTCTGGCCTGGTGTCAGTTTTGTCCTTGGTGG 1480
Query 1166 ------------------------------------------------------CAGCTGCCAGGCGATCGGAT 1185
|||||||||||||||.|||.
Sbjct 1481 TGCAGGAGGCAGGGCGCTCCAAGAGATGGGCAGGGCTGAGCCCACCGCAGGCTGCAGCTGCCAGGCGATTGGAC 1554
Query 1186 GGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCAGCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGA 1259
|.||||||..|.|||||.||||||||.|.||||| ||||||..|.|||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGGAGGACAGCAGCTTTGACCAGGACAGCAGGA---AGAAGACAACCTGGCTGCTTCTCAAGGGGGATGCAGA 1625
Query 1260 CACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCACAGCAGCGGGACCGA-CAGAGACCCTCTC 1332
|||.||.||.||.||||||||||||||||..|||||..||||||.||||||||||||.|| ||| ||.||||||
Sbjct 1626 CACCAGAACTAACTCTCCAGACCTGGACAGTCAGTCGCTGTCCCTCAGCAGCGGGACTGACCAG-GAACCTCTC 1698
Query 1333 CAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCAC------------------------------------------- 1363
|||||.|||||||||||||||.|..||||||
Sbjct 1699 CAAAGAATGGCAGGGGACAGCCTCTACTCACGCTTTCCTTATTCCAAACCTGACACTCTTCCAGGACCCAGGAA 1772
Query 1364 -------------------------------------------------------------------------- 1363
Sbjct 1773 GGATGGCCTGGACCTCCGGAATGCCAACCTGGCCCCTTGTGGAGCAGACCCGGATGCCAGCTGGGGCACGCGAG 1846
Query 1364 AATACAAGATCTATCCGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGAC 1437
|.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 AGTATAAGATATATCCCTATGATTCCCTCATCGTAACAAACCGAATTCGTGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGAC 1920
Query 1438 CGGACGAGACTGGAGAGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGA 1511
|||||..|.||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CGGACACGGCTGGAGAGACACCTATCACCTGAGGAGTTCCAAGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGA 1994
Query 1512 CCGCCTGGCCCTCTGGAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC 1563
||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1995 CCGCCTGGCCCTGTGGAAGAGGAATGACCTCAAGAAGAAAGCCTTGCTGTTC 2046