Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09191
• Subject: XM_017320833.1
• Aligned Length: 1813
• Identities: 1360
• Gaps: 254

Alignment

Query    1  ATGAGTGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCCCAGCCCGCTGGAGAAGTCGCCCAGCACGGCGATCCTGTGCAA  74
            |||||.|||||||||||||||||||||||||....|||.|||||||||.||.|||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGAGCGCAGTGTCGCAGCCCCAGGCTGCTCATGCCCCACTGGAGAAGCCGGCCAGCACTGCGATCCTGTGTAA  74

Query   75  CACGTGTGGGAATGTGTGCAAGGGCGAGGTGCTGCGGGTGCAGGACAAGTACTTCCACATCAAGTGCTTCGTCT  148
            .||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||.||.|
Sbjct   75  TACCTGTGGGAATGTGTGCAAGGGAGAGGTGCTGCGTGTGCAGAACAAGTACTTCCACATCAGGTGCTTTGTGT  148

Query  149  GTAAAGCATGTGGCTGCGACCTGGCCGAGGGCGGCTTCTTCGTGCGGCAGGGCGAGTACATCTGCACGCTGGAC  222
            |.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||.||||.|||||.|..|||
Sbjct  149  GCAAAGCGTGTGGCTGTGACCTGGCTGAGGGTGGCTTCTTCGTGAGGCAGGGTGAGCACATTTGCACACGTGAC  222

Query  223  TACCAGAGGCTCTACGGCACCCGCTGCTTCAGCTGCGACCAGTTCATTGAGGGTGAGGTGGTGTCGGCGCTGGG  296
            ||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||..||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  223  TACCAGCGGCTCTATGGCACTCGCTGCTTCAGCTGTGACCGCTTCATTGAAGGCGAAGTGGTGTCGGCGCTTGG  296

Query  297  CAAGACCTACCACCCCGACTGCTTCGTGTGTGCCGTCTGCCGGCTGCCCTTCCCCCCCGGGGACCGAGTGACCT  370
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  297  GAAGACCTACCACCCTGACTGCTTCGTGTGTGCTGTCTGCAGGCTGCCCTTTCCTCCTGGGGACCGTGTGACCT  370

Query  371  TCAACGGGAAGGAATGCATGTGCCAGAAGTGTTCCCTGCCCGTATCGGTGGGCAGCAGCGCGCACCTGTCCCAG  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..|||..||.|.||||||.|||.||.|||.||.|||||
Sbjct  371  TCAACGGGAAGGAGTGTATGTGCCAGAAGTGTTCCCCACCCACATTGCTGGGCAACAGTGCTCACGTGGCCCAG  444

Query  445  GGCCTCCGAAGTTGTGGGGGCTGCGGCACAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTAGCCTTGGACAAGCACTG  518
            ||||||||.||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  GGCCTCCGGAGTTGTGGGGGCTGTGGCTTAGAAATCAAGAATGGCCAGGCCCTGGTGGCTTTGGACAAGCACTG  518

Query  519  GCACTTGGGCTGTTTTAAGTGCAAGAGCTGTGGGAAGCTCCTGAATGCCGAGTACATCAGCAAGGATGGGCTGC  592
            ||||.||||.||.||.||||||||||..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GCACCTGGGATGCTTCAAGTGCAAGACTTGTGGGAAACTCCTCAATGCAGAGTACATCAGCAAGGACGGGCTGC  592

Query  593  CCTACTGCGAAGCTGACTATCACGCCAAGTTCGGCATCCGCTGTGACAGCTGTGAGAAATACATCACGGGGCGC  666
            ||||||||||.|||||.||||||..||||||.|||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  593  CCTACTGCGAGGCTGATTATCACAGCAAGTTTGGCATCCGCTGCGACGGCTGTGAGAAGTACATCACGGGCCGG  666

Query  667  GTGCTGGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCCTGCGCGCTATGTGTCAGGTGCGGCCAGATGTTTGCAGA  740
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  667  GTGCTAGAGGCCGGAGAGAAGCACTACCACCCTTCATGTGCGCTATGCGTCAGGTGCGGCCAGATGTTCTCAGA  740

Query  741  AGGCGAAGAGATGTATCTTCAAGGTTCCTCCATCTGGCATCCGGCGTGTCGACAAGCAGCCAGAACTGAAGACA  814
            .|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  GGGCGAGGAGATGTACCTGCAAGGCTCCTCCATCTGGCATCCGGCATGTCGACAGGCAGCCAGGACTGAAGACA  814

Query  815  GAAACA---------------------------------------------------------AGGAAACCAGA  831
            ..|.||                                                         ||||||||||.
Sbjct  815  AGAGCAAGATGCACAGCTCTGTTTGCAGCCAGCCCTGCCCGGGCACCCTGCCCTGTGCCTTACAGGAAACCAGG  888

Query  832  ACTTCCTCAGAGAGCATCATTTCTGTCCCTGCTTCCAGCACCTCAGGGTCTCCGAGCCGTGTGATTTATGCCAA  905
            |||||.||.||||||||..|.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  889  ACTTCTTCGGAGAGCATTGTCTCCGTGCCTGCCTCCAGCACGTCAGGGTCCCCGAGCCGTGTGATCTACGCAAA  962

Query  906  GCTTGGTGGTGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCAGCCCTTCCTAAAAGTAAGGCCATCTATGACATCGACC  979
            ||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||..||.||.|||||..|||||||||
Sbjct  963  GCTTGGCGATGAGATCCTGGACTACAGGGACTTGGCTGCTCTTCCCAAAAACAAAGCGATCTACAACATCGACC  1036

Query  980  GCCCCGACATGATCTCCTACTCACCCTACATCAGCCACTCTGC---AGGGGACAGGCAGAGCTACGGC------  1044
            |||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||   .|||||||||||||||||.|||      
Sbjct 1037  GCCCCGACATGATCTCCTATTCGCCCTACATTAGCCACTCGGCCGTGGGGGACAGGCAGAGCTATGGCGAGTCA  1110

Query 1045  ---------------------------GAGGGGGATCAGGATGACCGGTCCTACAAGCAGTGCCGGACCTCCAG  1091
                                       |||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1111  CCTCAGTTGCTCTCACCAACGCCGACTGAGGGGGATCAGGATGATCGGTCCTACAAGCAGTGCAGGACCTCCAG  1184

Query 1092  CCCAAGCTCCACTGGGTCGGTTAGCCTCGGGCGCTACACTCCGACCTCACGGTCACCACAGCACTACAGCCGTC  1165
            |||.|||||..|.||.||.||.||||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1185  CCCCAGCTCTGCCGGCTCAGTCAGCCTCGGACACTACACCCCAACCTCACGGTCACCCCAGCACTACAGTCGTC  1258

Query 1166  CA------------------------------------------------------------------------  1167
            ||                                                                        
Sbjct 1259  CAGGCAGCGAAAGTGGCCGTAGCACCCCGAGTCTCTCAGTGCACTCCGACAGCAGACCTCCTTCCTCTACCTAC  1332

Query 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167
                                                                                      
Sbjct 1333  CAGCAGGCTCCGAGACACTTCCACGTCCCAGACACTGGCGTAAAAGATAACATCTATAGGAAACCCCCTATCTA  1406

Query 1168  ----------GCTGCCAGGCGATCGGATGGGGAGGATGGAAGCTTGGACCAGGATAACAGGAAGCAGAAGAGCA  1231
                      |||||||||||||.|||.|.||||||..|.|||||.||||||||.|.|||||   ||||||..|
Sbjct 1407  CAAACAGCACGCTGCCAGGCGATTGGACGTGGAGGACAGCAGCTTTGACCAGGACAGCAGGA---AGAAGACAA  1477

Query 1232  GCTGGCTGATGCTCAAGGGGGATGCAGACACAAGGACCAATTCTCCAGACCTGGACACCCAGTCCTTGTCCCAC  1305
            .|||||||.|.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||..|||||..||||||.|
Sbjct 1478  CCTGGCTGCTTCTCAAGGGGGATGCAGACACCAGAACTAACTCTCCAGACCTGGACAGTCAGTCGCTGTCCCTC  1551

Query 1306  AGCAGCGGGACCGA-CAGAGACCCTCTCCAAAGGATGGCAGGGGACAGCTTTCACTCACAATACAAGATCTATC  1378
            |||||||||||.|| ||| ||.|||||||||||.|||||||||||||||.|..|||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1552  AGCAGCGGGACTGACCAG-GAACCTCTCCAAAGAATGGCAGGGGACAGCCTCTACTCACAGTATAAGATATATC  1624

Query 1379  CGTATGACTCCCTCATCGTCACAAACCGAATTCGCGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACGAGACTGGAG  1452
            |.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||
Sbjct 1625  CCTATGATTCCCTCATCGTAACAAACCGAATTCGTGTGAAACTGCCCAAAGACGTGGACCGGACACGGCTGGAG  1698

Query 1453  AGACACTTGTCGCCCGAGGAGTTCCAGGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTCTG  1526
            ||||||.|.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1699  AGACACCTATCACCTGAGGAGTTCCAAGAAGTGTTTGGGATGAGCATCGAGGAGTTTGACCGCCTGGCCCTGTG  1772

Query 1527  GAAGAGGAATGACCTTAAGAAGAAAGCCCTTTTGTTC  1563
            |||||||||||||||.||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1773  GAAGAGGAATGACCTCAAGAAGAAAGCCTTGCTGTTC  1809