Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09195
- Subject:
- NM_001281521.1
- Aligned Length:
- 2641
- Identities:
- 2510
- Gaps:
- 122
Alignment
Query 1 ATGAATGGAGAGTATAGAGGCAGAGGATTTGGACGAGGAAGATTTCAAAGCTGGAAAAGGGGAAGAGGTGGTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAATGGAGAGTATAGAGGCAGAGGATTTGGACGAGGAAGATTTCAAAGCTGGAAAAGGGGAAGAGGTGGTGG 74
Query 75 GAACTTCTCAGGAAAATGGAGAGAAAGAGAACACAGACCTGATCTGAGTAAAACCACAGGAAAACGTACTTCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAACTTCTCAGGAAAATGGAGAGAAAGAGAACACAGACCTGATCTGAGTAAAACCACAGGAAAACGTACTTCTG 148
Query 149 AACAAACCCCACAGTTTTTGCTTTCAACAAAGACCCCACAGTCAATGCAGTCAACATTGGATCGATTCATACCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAAACCCCACAGTTTTTGCTTTCAACAAAGACCCCACAGTCAATGCAGTCAACATTGGATCGATTCATACCA 222
Query 223 TATAAAGGCTGGAAGCTTTATTTCTCTGAAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCATT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATAAAGGCTGGAAGCTTTATTTCTCTGAAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCATT 296
Query 297 TGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGTAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGTAG 370
Query 371 ATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATGCA 444
Query 445 CCTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCAGC 518
Query 519 TGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAGGG 592
Query 593 TGTACAACTATGAGCCTTTGACACAGCTCAAGAATGTCAGAGCAAATTACTATGGAAAATACATTGCTCTAAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTACAACTATGAGCCTTTGACACAGCTCAAGAATGTCAGAGCAAATTACTATGGAAAATACATTGCTCTAAGA 666
Query 667 GGGACAGTGGTTCGTGTCAGTAATATAAAGCCTCTTTGCACCAAGATGGCTTTTCTTTGTGCTGCATGTGGAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGACAGTGGTTCGTGTCAGTAATATAAAGCCTCTTTGCACCAAGATGGCTTTTCTTTGTGCTGCATGTGGAGA 740
Query 741 AATTCAGAGCTTTCCTCTTCCAGATGGAAAATACAGTCTTCCCACAAAGTGTCCTGTGCCTGTGTGTCGAGGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATTCAGAGCTTTCCTCTTCCAGATGGAAAATACAGTCTTCCCACAAAGTGTCCTGTGCCTGTGTGTCGAGGCA 814
Query 815 GGTCATTTACTGCTCTCCGCAGCTCTCCTCTCACAGTTACGATGGACTGGCAGTCAATCAAAATCCAGGAATTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGTCATTTACTGCTCTCCGCAGCTCTCCTCTCACAGTTACGATGGACTGGCAGTCAATCAAAATCCAGGAATTG 888
Query 889 ATGTCTGATGATCAGAGAGAAGCAGGTCGGATTCCACGAACAATAGAATGTGAGCTTGTTCATGATCTTGTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGTCTGATGATCAGAGAGAAGCAGGTCGGATTCCACGAACAATAGAATGTGAGCTTGTTCATGATCTTGTGGA 962
Query 963 TAGCTGTGTCCCGGGAGACACAGTGACTATTACTGGAATTGTCAAAGTCTCAAATGCGGAAGAAGGTTCTCGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAGCTGTGTCCCGGGAGACACAGTGACTATTACTGGAATTGTCAAAGTCTCAAATGCGGAAGAAGGTTCTCGAA 1036
Query 1037 ATAAGAATGACAAGTGTATGTTCCTTTTGTATATTGAAGCAAATTCTATTAGTAATAGCAAAGGACAGAAAACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATAAGAATGACAAGTGTATGTTCCTTTTGTATATTGAAGCAAATTCTATTAGTAATAGCAAAGGACAGAAAACA 1110
Query 1111 AAGAGTTCTGAGGATGGGTGTAAGCATGGAATGTTGATGGAGTTCTCACTTAAAGACCTTTATGCCATCCAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGAGTTCTGAGGATGGGTGTAAGCATGGAATGTTGATGGAGTTCTCACTTAAAGACCTTTATGCCATCCAAGA 1184
Query 1185 GATTCAAGCTGAAGAAAACCTGTTTAAACTCATTGTCAACTCG---CTTTGCCCTGTC---------------- 1239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.| | ||||.|||||
Sbjct 1185 GATTCAAGCTGAAGAAAACCTGTTTAAACTCATTGTCAAATGGAGTC-TTGCTCTGTCGCCCAGGCTAGAGTAC 1257
Query 1240 ---------ATTTTTGGTCA-TGAA------------------------------------------------- 1254
||.|..|.||| ||.|
Sbjct 1258 AGTGGTGCGATCTCAGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAAGTTCAAACAGTTCTCCCACCTCAGCCTGCCGAGT 1331
Query 1255 -------------------------------------------CTTGTTAAAGCAGGTTTGGCATTAGCACTCT 1285
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 AGCTGGGACTACAGGCATGCGCCACCAGACCCAGCTACTTTTGCTTGTTAAAGCAGGTTTGGCATTAGCACTCT 1405
Query 1286 TTGGAGGAAGCCAGAAATACGCAGATGACAAAAACAGAATTCCAATTCGGGGAGACCCCCACATCCTTGTTGTT 1359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 TTGGAGGAAGCCAGAAATACGCAGATGACAAAAACAGAATTCCAATTCGGGGAGACCCCCACATCCTTGTTGTT 1479
Query 1360 GGAGATCCAGGCTTAGGAAAAAGTCAAATGCTACAGGCAGCGTGCAATGTTGCCCCACGTGGCGTGTATGTTTG 1433
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 GGAGATCCAGGCCTAGGAAAAAGTCAAATGCTACAGGCAGCGTGCAATGTTGCCCCACGTGGCGTGTATGTTTG 1553
Query 1434 TGGTAACACCACGACCACCTCTGGTCTGACGGTAACTCTTTCAAAAGATAGTTCCTCTGGAGATTTTGCTTTGG 1507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TGGTAACACCACGACCACCTCTGGTCTGACGGTAACTCTTTCAAAAGATAGTTCCTCTGGAGATTTTGCTTTGG 1627
Query 1508 AAGCTGGTGCCCTGGTACTTGGTGATCAAGGTATTTGTGGAATCGATGAATTTGATAAGATGGGGAATCAACAT 1581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AAGCTGGTGCCCTGGTACTTGGTGATCAAGGTATTTGTGGAATCGATGAATTTGATAAGATGGGGAATCAACAT 1701
Query 1582 CAAGCCTTGTTGGAAGCCATGGAGCAGCAAAGTATTAGTCTTGCTAAGGCTGGTGTGGTTTGTAGCCTTCCTGC 1655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 CAAGCCTTGTTGGAAGCCATGGAGCAGCAAAGTATTAGTCTTGCTAAGGCTGGTGTGGTTTGTAGCCTTCCTGC 1775
Query 1656 AAGAACTTCCATTATTGCTGCTGCAAATCCAGTTGGAGGACATTACAATAAAGCCAAAACAGTTTCTGAGAATT 1729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 AAGAACTTCCATTATTGCTGCTGCAAATCCAGTTGGAGGACATTACAATAAAGCCAAAACAGTTTCTGAGAATT 1849
Query 1730 TAAAAATGGGGAGTGCACTACTATCCAGATTTGATTTGGTCTTTATCCTGTTAGATACTCCAAATGAGCATCAT 1803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 TAAAAATGGGGAGTGCACTACTATCCAGATTTGATTTGGTCTTTATCCTGTTAGATACTCCAAATGAGCATCAT 1923
Query 1804 GATCACTTACTCTCTGAACATGTGATTGCAATAAGAGCTGGAAAGCAGAGAACCATTAGCAGTGCCACAGTAGC 1877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 GATCACTTACTCTCTGAACATGTGATTGCAATAAGAGCTGGAAAGCAGAGAACCATTAGCAGTGCCACAGTAGC 1997
Query 1878 TCGTATGAATAGTCAAGATTCAAATACTTCCGTACTTGAAGTAGTTTCTGAGAAGCCATTATCAGAAAGACTAA 1951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 TCGTATGAATAGTCAAGATTCAAATACTTCCGTACTTGAAGTAGTTTCTGAGAAGCCATTATCAGAAAGACTAA 2071
Query 1952 AGGTGGTTCCTGGAGAAACAATAGATCCCATTCCCCACCAGCTATTGAGAAAGTACATTGGCTATGCTCGGCAG 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 AGGTGGTTCCTGGAGAAACAATAGATCCCATTCCCCACCAGCTATTGAGAAAGTACATTGGCTATGCTCGGCAG 2145
Query 2026 TATGTGTACCCAAGGCTATCCACAGAAGCTGCTCGAGTTCTTCAAGATTTTTACCTTGAGCTCCGGAAACAGAG 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 TATGTGTACCCAAGGCTATCCACAGAAGCTGCTCGAGTTCTTCAAGATTTTTACCTTGAGCTCCGGAAACAGAG 2219
Query 2100 CCAGAGGTTAAATAGCTCACCAATCACTACCAGGCAGCTGGAATCTTTGATTCGTCTGACAGAGGCACGAGCAA 2173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 CCAGAGGTTAAATAGCTCACCAATCACTACCAGGCAGCTGGAATCTTTGATTCGTCTGACAGAGGCACGAGCAA 2293
Query 2174 GGTTGGAATTGAGAGAGGAAGCAACCAAAGAAGACGCTGAGGATATAGTGGAAATTATGAAATATAGCATGCTA 2247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 GGTTGGAATTGAGAGAGGAAGCAACCAAAGAAGACGCTGAGGATATAGTGGAAATTATGAAATATAGCATGCTA 2367
Query 2248 GGAACTTACTCTGATGAATTTGGGAACCTAGATTTTGAGCGATCCCAGCATGGTTCTGGAATGAGCAACAGGTC 2321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 GGAACTTACTCTGATGAATTTGGGAACCTAGATTTTGAGCGATCCCAGCATGGTTCTGGAATGAGCAACAGGTC 2441
Query 2322 AACAGCGAAAAGATTTATTTCTGCTCTCAACAACGTTGCTGAAAGAACTTATAATAATATATTTCAATTTCATC 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 AACAGCGAAAAGATTTATTTCTGCTCTCAACAACGTTGCTGAAAGAACTTATAATAATATATTTCAATTTCATC 2515
Query 2396 AACTTCGGCAGATTGCCAAAGAACTAAACATTCAGGTTGCTGATTTTGAAAATTTTATTGGATCACTAAATGAC 2469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 AACTTCGGCAGATTGCCAAAGAACTAAACATTCAGGTTGCTGATTTTGAAAATTTTATTGGATCACTAAATGAC 2589
Query 2470 CAGGGTTACCTCTTGAAAAAAGGCCCAAAAGTTTACCAGCTTCAAACTATG 2520
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 CAGGGTTACCTCTTGAAAAAAGGCCCAAAAGTTTACCAGCTTCAAACTATG 2640