Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09231
• Subject: NM_145595.2
• Aligned Length: 714
• Identities: 607
• Gaps: 9

Alignment

Query   1  ATGGACAAAGTGTGTGCTGTTTTTGGAGGCTCCCGAGGCATTGGCAGAGCTGTGGCCCAGTTAATGGCCCGGAA  74
           |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||||||.|||||||||.|||
Sbjct   1  ATGGACAAAGTCTGTGCGGTTTTTGGAGGCTCCCGGGGGATCGGCAGGGCGGTAGCCCAGCTAATGGCCCAGAA  74

Query  75  AGGCTACCGACTGGCGGTCATTGCCAGAAACCTGGAAGGGGCCAAAGCCGCCGCCGGTGACCTCGGCGGAGATC  148
           .||.|||||.||||||.||.|..|||||||||||||||.||||||||.|.|||||||.||.|||||||||.|.|
Sbjct  75  GGGTTACCGTCTGGCGATCGTCTCCAGAAACCTGGAAGTGGCCAAAGTCACCGCCGGCGAGCTCGGCGGAAACC  148

Query 149  ATTTGGCATTTAGCTGTGATGTTGCTAAAGAACATGATGTTCAAAATACATTTGAAGAGATGGAGAAACATTTA  222
           |.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACTTGGCATTTAGGTGTGATGTTGCCAAAGAACAAGATGTTCAGAGTACATTTCAAGAGATGGAGAAACATTTA  222

Query 223  GGTCGAGTAAATTTCTTGGTAAATGCAGCTGGTATTAACAGGGATGGTCTTTTAGTAAGAACAAAAACTGAAGA  296
           ||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||..|||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct 223  GGTCCAGTAAATTTCTTGGTAAATGCAGCCGGTATCAACAGAGACAGTCTTCTAGTAAGAACAAAGACTGAAGA  296

Query 297  TATGGTATCTCAGCTTCATACTAACCTCTTGGGTTCCATGCTGACCTGTAAAGCTGCCATGAGGACTATGATTC  370
           .|||.|.||||||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||| 
Sbjct 297  CATGATCTCTCAGCTGCACACTAACCTCCTGGGCTCCATGCTGACCTGTAAAGCTGCCATGAAGACAATGATT-  369

Query 371  AACAACAGGGAGGGTCTATTGTTAATGTAGGAAGCATTGTTGGCTTAAAAGGCAACTCTGGCCAGTCCGTTTAC  444
             ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.|||||||||..|||||||||.|..|||
Sbjct 370  --CAGCAGGGAGGGTCTATTGTTAATGTGGGAAGTATTATTGGTTTGAAAGGCAACGTTGGCCAGTCTGCATAC  441

Query 445  AGTGCCAGTAAAGGAGGATTAGTTGGATTTTCACGTGCTCTTGCTAAAGAGGTAGCAAGAAAGAAAATTAGAGT  518
           |||||||..|||||||||.|.|||||.||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||
Sbjct 442  AGTGCCACCAAAGGAGGACTCGTTGGGTTTTCACGCTCGCTTGCTAAAGAGGTTGCACGGAAGAAAATCAGAGT  515

Query 519  GAATGTAGTTGCACCAGGATTTGTACACACAGATATGACGAAAGACTTGAAAGAAGAACATTTAAAGAAAAATA  592
           ||||||.||.||||||||||||.|.|.|||.||||||||.|.|.||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 516  GAATGTGGTGGCACCAGGATTTATTCGCACGGATATGACAAGACACTTGAAAGAAGAACACTTCAAGAAAAACA  589

Query 593  TTCCTCTTGGGAGGTTTGGAGAAACTATTGAGGTGGCACATGCGGTTGTGTTTCTTTTAGAATCACCGTATATT  666
           ||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 590  TTCCTCTTGGGAGGTTTGGAGAAACTCTTGAGGTAGCACATGCCGTTGTGTTTCTTTTAGAGTCACCATACATC  663

Query 667  ACAGGGCATGTTCTGGTAGTGGATGGGGGATTACAACTCA---TTTTG  711
           |||||.||||||||..|.||||||||.|||||.||.||||   |.   
Sbjct 664  ACAGGCCATGTTCTTATCGTGGATGGAGGATTGCAGCTCACCGTC---  708