Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09263
- Subject:
- NM_001177628.2
- Aligned Length:
- 1667
- Identities:
- 1458
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGGTCCAGAGGCTGTGGGTGAGCCGCCTGCTGCGGCACCGGAAAGCCCAGCTCTTGCTGGTCAACCTGCTAAC 74
|||.|||||||||||||||..|||||.|||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGATCCAGAGGCTGTGGGCCAGCCGTCTGCTACGGCACCGGAAAGCTCAGCTCCTGCTGGTCAACCTGCTCAC 74
Query 75 CTTTGGCCTGGAGGTGTGTTTGGCCGCAGGCATCACCTATGTGCCGCCTCTGCTGCTGGAAGTGGGGGTAGAGG 148
||||||||||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 75 CTTTGGCCTGGAGGTGTGCCTGGCTGCCGGCATTACCTATGTGCCACCCCTTCTGCTGGAAGTCGGGGTGGAGG 148
Query 149 AGAAGTTCATGACCATGGTGCTGGGCATTGGTCCAGTGCTGGGCCTGGTCTGTGTCCCGCTCCTAGGCTCAGCC 222
||||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||.|.|||.||.|||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAATTCATGACCATGGTGTTGGGCATTGGCCCAGTGCTAGGCCTGGTTTCTGTTCCACTCCTAGGCTCAGCC 222
Query 223 AGTGACCACTGGCGTGGACGCTATGGCCGCCGCCGGCCCTTCATCTGGGCACTGTCCTTGGGCATCCTGCTGAG 296
||||||||.||||||||.||||||||||||||..|.|||||.||||||||..|||||.||||..|||||||.||
Sbjct 223 AGTGACCAGTGGCGTGGGCGCTATGGCCGCCGGAGACCCTTTATCTGGGCTTTGTCCCTGGGTGTCCTGCTAAG 296
Query 297 CCTCTTTCTCATCCCAAGGGCCGGCTGGCTAGCAGGGCTGCTGTGCCCGGATCCCAGGCCCCTGGAGCTGGCAC 370
|||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||.|||.||..||||||||||||||.||||.|
Sbjct 297 CCTCTTTCTCATCCCGAGGGCTGGCTGGCTGGCAGGACTGCTGTACCCAGACACCAGGCCCCTGGAGTTGGCCC 370
Query 371 TGCTCATCCTGGGCGTGGGGCTGCTGGACTTCTGTGGCCAGGTGTGCTTCACTCCACTGGAGGCCCTGCTCTCT 444
||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||.|.|||||.
Sbjct 371 TGCTGATCTTGGGAGTGGGGCTGCTGGACTTTTGTGGCCAGGTGTGCTTTACTCCATTGGAGGCCTTACTCTCC 444
Query 445 GACCTCTTCCGGGACCCGGACCACTGTCGCCAGGCCTACTCTGTCTATGCCTTCATGATCAGTCTTGGGGGCTG 518
|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 GACCTCTTCCGGGACCCAGACCACTGCCGCCAAGCCTTCTCTGTCTACGCCTTCATGATCAGCCTTGGGGGCTG 518
Query 519 CCTGGGCTACCTCCTGCCTGCCATTGACTGGGACACCAGTGCCCTGGCCCCCTACCTGGGCACCCAGGAGGAGT 592
|||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 519 CCTGGGCTACCTCTTACCTGCCATTGACTGGGACACCAGCGTTCTGGCCCCCTACCTGGGTACTCAGGAAGAAT 592
Query 593 GCCTCTTTGGCCTGCTCACCCTCATCTTCCTCACCTGCGTAGCAGCCACACTGCTGGTGGCTGAGGAGGCAGCG 666
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||.|.||||||||.|||.|.|||.|.||||||||||..
Sbjct 593 GCCTCTTTGGCCTCCTCACCCTCATTTTCCTCATCTGCATGGCAGCCACTCTGTTTGTGACGGAGGAGGCAGTA 666
Query 667 CTGGGCCCCACCGAGCCAGCAGAAGGGCTGTCGGCCCCCTCCTTGTCGCCCCACTGCTGTCCATGCC----GGG 736
||||||||..|||||||.|||||||||.|||.||.|.|..||.||||||.||..|||||.||||||| .||
Sbjct 667 CTGGGCCCACCCGAGCCGGCAGAAGGGTTGTTGGTCTCTGCCGTGTCGCGCCGATGCTGCCCATGCCACGTTGG 740
Query 737 CCCGCTTGGCTTTCCGGAACCTGGGCGCCCTGCTTCCCCGGCTGCACCAGCTGTGCTGCCGCATGCCCCGCACC 810
|| |||||||||||||.|||||..|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 741 CC----TGGCTTTCCGGAATCTGGGTACCCTGTTTCCCCGGCTGCAGCAGCTGTGCTGCCGCATGCCTCGCACC 810
Query 811 CTGCGCCGGCTCTTCGTGGCTGAGCTGTGCAGCTGGATGGCACTCATGACCTTCACGCTGTTTTACACGGATTT 884
||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 811 CTACGCCGACTCTTTGTGGCTGAGCTGTGCAGCTGGATGGCACTTATGACTTTCACACTGTTCTACACGGACTT 884
Query 885 CGTGGGCGAGGGGCTGTACCAGGGCGTGCCCAGAGCTGAGCCTGGCACCGAGGCCCGGAGACACTATGATGAAG 958
||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 CGTGGGAGAGGGGCTGTACCAGGGTGTACCCAGAGCCGAGCCAGGCACCGAGGCCCGGAGACACTATGATGAAG 958
Query 959 GCGTTCGGATGGGCAGCCTGGGGCTGTTCCTGCAGTGCGCCATCTCCCTGGTCTTCTCTCTGGTCATGGACCGG 1032
||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 959 GCATTCGAATGGGCAGCCTGGGGCTCTTCCTGCAGTGTGCCATCTCCCTGGTCTTCTCCCTGGTCATGGACAGG 1032
Query 1033 CTGGTGCAGCGATTCGGCACTCGAGCAGTCTATTTGGCCAGTGTG--GCAGCTTTCCCTGTGGCTGCCGGTGCC 1104
|||||.|||...||||||||.||..||||||||.||||||||||| | |.|||| |||||||||||||.||||
Sbjct 1033 CTGGTACAGAAGTTCGGCACACGGTCAGTCTATCTGGCCAGTGTGATG-ACCTTT-CCTGTGGCTGCCGCTGCC 1104
Query 1105 ACATGCCTGTCCCACAGTGTGGCCGTGGTGACAGCTTCAGCCGCCCTCACCGGGTTCACCTTCTCAGCCCTGCA 1178
||.||||||||||||||.||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1105 ACCTGCCTGTCCCACAGCGTGGTGGTAGTGACAGCCTCAGCTGCCCTCACCGGGTTCACCTTCTCGGCCTTGCA 1178
Query 1179 GATCCTGCCCTACACACTGGCCTCCCTCTACCACCGGGAGAAGCAGGTGTTCCTGCCCAAATACCGAGGGGACA 1252
|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1179 GATCCTGCCTTACACGCTCGCCTCCCTCTACCACCGTGAGAAGCAGGTGTTCCTGCCCAAATACCGAGGGGACG 1252
Query 1253 CTGGAGGT-GCTAGCAGTGAGGACAGCCTGATGACCAGCTTCCTGCCAGGCCCTAAGCCTGGAGCTCCCTTCCC 1325
|||||||| || |||.||||||||||||.||..|||||||||.||||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1253 CTGGAGGTAGC-AGCGGTGAGGACAGCCAGACAACCAGCTTCTTGCCAGGCCCTAAGCCAGGAGCTCTCTTCCC 1325
Query 1326 TAATGGACACGTGGGTGCTGGAGGCAGTGGCCTGCTCCCACCTCCACCCGCGCTCTGCGGGGCCTCTGCCTGTG 1399
.||||||||||||||..||||..||||.|||.|.||..|.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1326 CAATGGACACGTGGGCTCTGGCAGCAGCGGCATCCTGGCCCCTCCACCTGCACTCTGTGGGGCCTCTGCCTGCG 1399
Query 1400 ATGTCTCCGTACGTGTGGTGGTGGGTGAGCCCACC-GAGGCCAGGGTGGTTCCGGGCCGGGGCATCTGCCTGGA 1472
||||||||.|.||.||||||||||||||| ||||| |||||||||||.|||.||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1400 ATGTCTCCATGCGAGTGGTGGTGGGTGAG-CCACCTGAGGCCAGGGTTGTTACGGGACGGGGCATTTGCCTGGA 1472
Query 1473 CCTCGCCATCCTGGATAGTGCCTTCCTGCTGTCCCAGGTGGCCCCATCCCTGTTTATGGGCTCCATTGTCCAGC 1546
|||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473 CCTGGCCATTCTGGACAGTGCCTTTCTGCTGTCCCAGGTGGCTCCGTCCCTGTTCATGGGCTCCATTGTCCAGC 1546
Query 1547 TCAGCCAGTCTGTCACTGCCTATATGGTGTCTGCCGCAGGCCTGGGTCTGGTCGCCATTTACTTTGCTACACAG 1620
|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547 TGAGCCACTCTGTCACTGCCTATATGGTATCAGCTGCAGGCTTGGGTCTGGTCGCCATTTACTTTGCTACACAG 1620
Query 1621 GTAGTATTTGACAAGAGCGACTTGGCCAAATACTCAGCG 1659
|||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1621 GTAGTGTTTGACAAGAACGACTTGGCCAAATACTCAGTG 1659