Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09280
• Subject: NM_001320316.1
• Aligned Length: 785
• Identities: 725
• Gaps: 56

Alignment

Query   1  MSHAVTIEEPQAQQQVSQTRYRERSRAGSHISSNRAYDFLY------------------DPLFIVSSEKDHTQA  56
                                                 ...                  |||||||||||||||
Sbjct   1  --------------------------------------MIFCTVRTAADLPPRPSPPRPDPLFIVSSEKDHTQA  36

Query  57  NIQATLIRSRLRKVPRFRTMFSNLIHYPRYSLYWSKSDPVPPFISREWKGHKEKHREALRQLTTTDASFQMPKE  130
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  37  NIQATLIRSRLRKVPRFKTMFSNLIHYPRYSLYWSKSDPVPPFISREWKGHKEKHREALRQLTTTDASFQMPKE  110

Query 131  VYEDPEVTGKNRYKYFERPFLPFFQQMPFNVVYAVSKAEPYTFPPTSTKHLSIPSKSTVGTQTDYRDADVQTDP  204
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 111  VYEDPEVTGKNRYKYFERPFLPFFQQMPFNVVYAVSKAEPYTFPPTSTKHLSIPSKSTVGTQTDYRDADVQTDP  184

Query 205  YSPEYVVCQDSIPELLTLATLTWGRGLPAGQAEVEMIERAREKRAWEASLPALSDTSQFEKRRKMMNEMERKEW  278
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 185  YSPEYVVCQDSIPELLTLATLTWGRGLPAGQAEVEMIERAREKRAWEASLPALSDTSQFEKRRKMMNEMERKEW  258

Query 279  AFREQEIEKLQEIRLEVLKELLRKREENQNEVNMKHLNARWSKLQEGKEAKMAKIQRTHVSTIRKLVGKRKNIE  352
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259  AFREQEIEKLQEIRLEVLKELLRKREENQNEVNMKHLNARWSKLQEGKEAKMAKIQRTHVSTIRKLVGKRKNIE  332

Query 353  GKLERRNIIKDYSDYASQVYGPLSRLGCFPDNNSEDFVVKNYYLNTYEGLVELESCLPDFVTQPQIRAPKPKVI  426
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333  GKLERRNIIKDYSDYASQVYGPLSRLGCFPDNNSEDFVVKNYYLNTYEGLVELESCLPDFVTQPQIRAPKPKVI  406

Query 427  TTKAGFLKRAARLDYELAEVHKALLDKKNKVLEVKKPPRFLQRNPIPQPRLPTPTLEMTSNEEEEMEMAVIYLQ  500
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 407  TTKAGFLKRAARLDYELAEVHKALLDKKNKVLEVKKPPRFLQRNPIPQPRLPTPTLEMTSNEEEEMEMAVIYLQ  480

Query 501  KLLRGRVVQNMMFEGKEKRLELIQELRTCHALQEDEKLVKKAEKQVTLALQRQRNLHEHKVSLVENHLAGLEGR  574
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481  KLLRGRVVQNMMFEGKEKRLELIQELRTCHALQEDEKLVKKAEKQVTLALQRQRNLHEHKVSLVENHLAGLEGR  554

Query 575  ALADMFDFLSKELVRLQEERRIHAFVMLAERQRRVREAEESGRRQVEKQRLREEDEIFKEVVKVHHSTISSYLE  648
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 555  ALADMFDFLSKELVRLQEERRIHAFVMLAERQRRVREAEESGRRQVEKQRLREEDEIFKEVVKVHHSTISSYLE  628

Query 649  DIILNTEANTAEEQARAEIEKMAEKINDIAYEMESRRTYLQSEEIVAELVYSFLIPEVQKYFVKEKVRNAQRKH  722
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 629  DIILNTEANTAEEQARAEIEKMAEKINDIAYEMESRRTYLQSEEIVAELVYSFLIPEVQKYFVKEKVRNAQRKH  702

Query 723  ILAAHQIIHSYTESMVQKKLTEGEQDEASNAAMLLEKETQNENNS  767
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703  ILAAHQIIHSYTESMVQKKLTEGEQDEASNAAMLLEKETQNENNS  747