Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09284
• Subject: NM_054093.3
• Aligned Length: 1070
• Identities: 987
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  MFTLSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERAAVVIQAHVRSFLCRSRLQRDIRREIDDFFKADDPESTKRSAL  74
            |||.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.||.||||.|||.||.||...|.|||||
Sbjct    1  MFTVSQTSRAWFIDRARQAREERLVQKERERSAVTIQALVRSFLCRRRLHRDIRKEIDEFFSADESGSSKRSAL  74

Query   75  CIFKIARKLLFLFRIKEDNERFEKLCRSILSSMDAENEPKVWYVSLACSKDLTLLWIQQIKNILWYCCDFLKQL  148
            |||||||.|||.....||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.||..|.||
Sbjct   75  CIFKIARRLLFICKTTEDSERLEKLCRSILNSMDAENEPKVWYVSLALSKDLTLLWIKQIKSILWHCCELLGQL  148

Query  149  KPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRGKGESLRPAMNHICANIMGHLNQHGFYSVLQILLTRGLARPRP  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct  149  KPEILQDSRLITLYLTMLVTFTDTSTWKILRGKGESLRPALNHICANIMGHLNQRGLYSVLQVLLTRGLARPRP  222

Query  223  CLSKGTLTAAFSLALRPVIAAQFSDNLIRPFLIHIMSVPALVTHLSTVTPERLTVLESHDMLRKFIIFLRDQDR  296
            |||||.||||||||||||.||||||||.|||.||.|||||||.|||||.||||.||||||||||||.||||.||
Sbjct  223  CLSKGMLTAAFSLALRPVVAAQFSDNLMRPFIIHVMSVPALVAHLSTVAPERLGVLESHDMLRKFIVFLRDRDR  296

Query  297  CRDVCESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSPRVLEEETDGFVSLLTQTLCYCQKYVSQKKSNLTHWHPVLGWFSQSV  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|.||||.|||||.|||.||||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CRDACESLEGCHTLCLMGNLLHLGSLSLRLLEEEMDGFVSALTQMLCYCQKYVAQKKSNLTHWHPVLGWFSQPV  370

Query  371  DYGLNESMHLITKQLQFLWGVPLIRIFFCDILSKKLLESQEPA--HAQPASPQNVLPVKSLLKRAFQKSASVRN  442
            |||||.||.||||||||||.||||||.|.||||.||||..|||  ..||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct  371  DYGLNDSMYLITKQLQFLWAVPLIRILFSDILSRKLLEHAEPAPVQPQPSSPQTVLPVKSLLKRAFQKSASVRN  444

Query  443  ILRPVGGKRVDSAEVQKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLN  516
            |||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ILRPVGGRRVDSAEVRKVCNICVLYQTSLTTLTQIRLQILTGLTYLDDLLPKLWAFICELGPHGGLKLFLECLN  518

Query  517  NDTEESKQLLAMLMLFCDCSRHLITILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLEL  590
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  NDTGESKQLLAMLMLFCDCSRHLITILDDIEVYEEQISFKLEELVTISSFLNSFVFKMIWDGIVENAKGETLEL  592

Query  591  FQSVHGWLMVLYERDCRRRFTPEDHWLRKDLKPSVLFQELDRDRKRAQLILQYIPHVIPHKNRVLLFRTMVTKE  664
            ||||||||||||||||||||.|||||||.||||.|||||||.||.||||.||.||||.||||||||||.||.||
Sbjct  593  FQSVHGWLMVLYERDCRRRFAPEDHWLRRDLKPGVLFQELDKDRRRAQLVLQHIPHVVPHKNRVLLFRNMVIKE  666

Query  665  KEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEI  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  KEKLGLVETSSASPHVTHITIRRSRMLEDGYEQLRQLSQHAMKGVIRVKFVNDLGVDEAGIDQDGVFKEFLEEI  740

Query  739  IKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQLLGHHHSVF  812
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  741  IKRVFDPALNLFKTTSGDERLYPSPTSYIHENYLQLFEFVGKMLGKAVYEGIVVDVPFASFFLSQMLGHHHSVF  814

Query  813  YSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDITDLGLTLSYDEDVMGQLVCHELIPGGKTIPVTNENKISYIHLMAHF  886
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct  815  YSSVDELPSLDSEFYKNLTSIKRYDGDIADLGLTLSYDEDVMGQLVCHELVPGGKTIPVTDENKISYIHLMAHF  888

Query  887  RMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  RMHTQIKNQTAALISGFRSIIKPEWIRMFSTPELQRLISGDNAEIDLEDLKKHTVYYGGFHGSHRVIIWLWDIL  962

Query  961  ASDFTPDERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSS  1034
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ASDFTPEERAMFLKFVTSCSRPPLLGFAYLKPPFSIRCVEVSDDQDTGDTLGSVLRGFFTIRKREPGGRLPTSS  1036

Query 1035  TCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCFNLLKLPNYSKKSVLREKLRYAISMNTGFELS  1070