Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09321
- Subject:
- XM_017027467.1
- Aligned Length:
- 3186
- Identities:
- 2766
- Gaps:
- 420
Alignment
Query 1 ATGCTACGAACCGCAGGCAGGGACGGCCTCTGTCGCCTGTCCACCTACTTGGAAGAACTCGAGGCTGTGGAACT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAAGAAGTTCAAGTTATACCTGGGGACCGCGACAGAGCTGGGAGAAGGCAAGATCCCCTGGGGAAGCATGGAGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGCCGGTCCCCTGGAAATGGCCCAGCTGCTCATCACCCACTTCGGGCCAGAGGAGGCCTGGAGGTTGGCTCTC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGCACCTTTGAGCGGATAAACAGGAAGGACCTGTGGGAGAGAGGACAGAGAGAGGACCTGGTGAGGGATACCCC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ACCTGGTGGCCCGTCCTCACTTGGGAACCAGTCAACATGCCTTCTGGAAGTCTCTCTTGTCACTCCAAGAAAAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATCCCCAGGAAACCTACAGGGACTATGTCCGCAGGAAATTCCGGCTCATGGAAGACCGCAATGCGCGCCTAGGG 444
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------ATGGAAGACCGCAATGCGCGCCTAGGG 27
Query 445 GAATGTGTCAACCTCAGCCACCGGTACACCCGGCTCCTGCTGGTGAAGGAGCACTCAAACCCCATGCAGGTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 GAATGTGTCAACCTCAGCCACCGGTACACCCGGCTCCTGCTGGTGAAGGAGCACTCAAACCCCATGCAGGTCCA 101
Query 519 GCAGCAGCTTCTGGACACAGGCCGGGGACACGCGAGGACCGTGGGACACCAGGCTAGCCCCATCAAGATAGAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 GCAGCAGCTTCTGGACACAGGCCGGGGACACGCGAGGACCGTGGGACACCAGGCTAGCCCCATCAAGATAGAGA 175
Query 593 CCCTCTTTGAGCCAGACGAGGAGCGCCCCGAGCCACCGCGCACCGTGGTCATGCAAGGCGCGGCAGGGATAGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 CCCTCTTTGAGCCAGACGAGGAGCGCCCCGAGCCACCGCGCACCGTGGTCATGCAAGGCGCGGCAGGGATAGGC 249
Query 667 AAGTCCATGCTGGCACACAAGGTGATGCTGGACTGGGCGGACGGGAAGCTCTTCCAAGGCAGATTTGATTATCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 AAGTCCATGCTGGCACACAAGGTGATGCTGGACTGGGCGGACGGGAAGCTCTTCCAAGGCAGATTTGATTATCT 323
Query 741 CTTCTACATCAACTGCAGGGAGATGAACCAGAGTGCCACGGAATGCAGCATGCAAGACCTCATCTTCAGCTGCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 CTTCTACATCAACTGCAGGGAGATGAACCAGAGTGCCACGGAATGCAGCATGCAAGACCTCATCTTCAGCTGCT 397
Query 815 GGCCTGAGCCCAGCGCGCCTCTCCAGGAGCTCATCCGAGTTCCCGAGCGCCTCCTTTTCATCATCGACGGCTTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 GGCCTGAGCCCAGCGCGCCTCTCCAGGAGCTCATCCGAGTTCCCGAGCGCCTCCTTTTCATCATCGACGGCTTC 471
Query 889 GATGAGCTCAAGCCTTCTTTCCACGATCCTCAGGGACCCTGGTGCCTCTGCTGGGAGGAGAAACGGCCCACGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 GATGAGCTCAAGCCTTCTTTCCACGATCCTCAGGGACCCTGGTGCCTCTGCTGGGAGGAGAAACGGCCCACGGA 545
Query 963 GCTGCTTCTTAACAGCTTAATTCGGAAGAAGCTGCTCCCTGAGCTATCTTTGCTCATCACCACACGGCCCACGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 GCTGCTTCTTAACAGCTTAATTCGGAAGAAGCTGCTCCCTGAGCTATCTTTGCTCATCACCACACGGCCCACGG 619
Query 1037 CTTTGGAGAAGCTCCACCGTCTGCTGGAGCACCCCAGGCATGTGGAGATCCTGGGCTTCTCTGAGGCAGAAAGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 CTTTGGAGAAGCTCCACCGTCTGCTGGAGCACCCCAGGCATGTGGAGATCCTGGGCTTCTCTGAGGCAGAAAGG 693
Query 1111 AAGGAATACTTCTACAAGTATTTCCACAATGCAGAGCAGGCGGGCCAAGTCTTCAATTACGTGAGGGACAACGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 AAGGAATACTTCTACAAGTATTTCCACAATGCAGAGCAGGCGGGCCAAGTCTTCAATTACGTGAGGGACAACGA 767
Query 1185 GCCTCTCTTCACCATGTGCTTCGTCCCCCTGGTGTGCTGGGTGGTGTGTACCTGCCTCCAGCAGCAGCTGGAGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GCCTCTCTTCACCATGTGCTTCGTCCCCCTGGTGTGCTGGGTGGTGTGTACCTGCCTCCAGCAGCAGCTGGAGG 841
Query 1259 GTGGGGGGCTGTTGAGACAGACGTCCAGGACCACCACTGCAGTGTACATGCTCTACCTGCTGAGTCTGATGCAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 GTGGGGGGCTGTTGAGACAGACGTCCAGGACCACCACTGCAGTGTACATGCTCTACCTGCTGAGTCTGATGCAA 915
Query 1333 CCCAAGCCGGGGGCCCCGCGCCTCCAGCCCCCACCCAACCAGAGAGGGTTGTGCTCCTTGGCGGCAGATGGGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 CCCAAGCCGGGGGCCCCGCGCCTCCAGCCCCCACCCAACCAGAGAGGGTTGTGCTCCTTGGCGGCAGATGGGCT 989
Query 1407 CTGGAATCAGAAAATCCTATTTGAGGAGCAGGACCTCCGGAAGCACGGCCTAGACGGGGAAGACGTCTCTGCCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 CTGGAATCAGAAAATCCTATTTGAGGAGCAGGACCTCCGGAAGCACGGCCTAGACGGGGAAGACGTCTCTGCCT 1063
Query 1481 TCCTCAACATGAACATCTTCCAGAAGGACATCAACTGTGAGAGGTACTACAGCTTCATCCACTTGAGTTTCCAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 TCCTCAACATGAACATCTTCCAGAAGGACATCAACTGTGAGAGGTACTACAGCTTCATCCACTTGAGTTTCCAG 1137
Query 1555 GAATTCTTTGCAGCTATGTACTATATCCTGGACGAGGGGGAGGGCGGGGCAGGCCCAGACCAGGACGTGACCAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 GAATTCTTTGCAGCTATGTACTATATCCTGGACGAGGGGGAGGGCGGGGCAGGCCCAGACCAGGACGTGACCAG 1211
Query 1629 GCTGTTGACCGAGTACGCGTTTTCTGAAAGGAGCTTCCTGGCACTCACCAGCCGCTTCCTGTTTGGACTCCTGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 GCTGTTGACCGAGTACGCGTTTTCTGAAAGGAGCTTCCTGGCACTCACCAGCCGCTTCCTGTTTGGACTCCTGA 1285
Query 1703 ACGAGGAGACCAGGAGCCACCTGGAGAAGAGTCTCTGCTGGAAGGTCTCGCCGCACATCAAGATGGACCTGTTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 ACGAGGAGACCAGGAGCCACCTGGAGAAGAGTCTCTGCTGGAAGGTCTCGCCGCACATCAAGATGGACCTGTTG 1359
Query 1777 CAGTGGATCCAAAGCAAAGCTCAGAGCGACGGCTCCACCCTGCAGCAGGGCTCCTTGGAGTTCTTCAGCTGCTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1360 CAGTGGATCCAAAGCAAAGCTCAGAGCGACGGCTCCACCCTGCAGCAGGGCTCCTTGGAGTTCTTCAGCTGCTT 1433
Query 1851 GTACGAGATCCAGGAGGAGGAGTTTATCCAGCAGGCCCTGAGCCACTTCCAGGTGATCGTGGTCAGCAACATTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 GTACGAGATCCAGGAGGAGGAGTTTATCCAGCAGGCCCTGAGCCACTTCCAGGTGATCGTGGTCAGCAACATTG 1507
Query 1925 CCTCCAAGATGGAGCACATGGTCTCCTCGTTCTGTCTGAAGCGCTGCAGGAGCGCCCAGGTGCTGCACTTGTAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508 CCTCCAAGATGGAGCACATGGTCTCCTCGTTCTGTCTGAAGCGCTGCAGGAGCGCCCAGGTGCTGCACTTGTAT 1581
Query 1999 GGCGCCACCTACAGCGCGGACGGGGAAGACCGCGCGAGGTGCTCCGCAGGAGCGCACACGCTGTTGGTGCAGCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582 GGCGCCACCTACAGCGCGGACGGGGAAGACCGCGCGAGGTGCTCCGCAGGAGCGCACACGCTGTTGGTGCAGCT 1655
Query 2073 ---ACCAGAGAGGACCGTTCTGCTGGACGCCTACAGTGAACATCTGGCAGCGGCCCTGTGCACCAATCCAAACC 2143
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656 CAGACCAGAGAGGACCGTTCTGCTGGACGCCTACAGTGAACATCTGGCAGCGGCCCTGTGCACCAATCCAAACC 1729
Query 2144 TGATAGAGCTGTCTCTGTACCGAAATGCCCTGGGCAGCCGGGGGGTGAAGCTGCTCTGTCAAGGACTCAGACAC 2217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 TGATAGAGCTGTCTCTGTACCGAAATGCCCTGGGCAGCCGGGGGGTGAAGCTGCTCTGTCAAGGACTCAGACAC 1803
Query 2218 CCCAACTGCAAACTTCAGAACCTGAGGCTGAAGAGGTGCCGCATCTCCAGCTCAGCCTGCGAGGACCTCTCTGC 2291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 CCCAACTGCAAACTTCAGAACCTGAGGCTGAAGAGGTGCCGCATCTCCAGCTCAGCCTGCGAGGACCTCTCTGC 1877
Query 2292 AGCTCTCATAGCCAATAAGAATTTGACAAGGATGGATCTCAGTGGCAACGGCGTTGGATTCCCAGGCATGATGC 2365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878 AGCTCTCATAGCCAATAAGAATTTGACAAGGATGGATCTCAGTGGCAACGGCGTTGGATTCCCAGGCATGATGC 1951
Query 2366 TGCTTTGCGAGGGCCTGCGGCATCCCCAGTGCAGGCTGCAGATGATTCAGTTGAGGAAGTGTCAGCTGGAGTCC 2439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1952 TGCTTTGCGAGGGCCTGCGGCATCCCCAGTGCAGGCTGCAGATGATTCAGTTGAGGAAGTGTCAGCTGGAGTCC 2025
Query 2440 GGGGCTTGTCAGGAGATGGCTTCTGTGCTCGGCACCAACCCACATCTGGTTGAGTTGGACCTGACAGGAAATGC 2513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2026 GGGGCTTGTCAGGAGATGGCTTCTGTGCTCGGCACCAACCCACATCTGGTTGAGTTGGACCTGACAGGAAATGC 2099
Query 2514 ACTGGAGGATTTGGGCCTGAGGTTACTATGCCAGGGACTGAGGCACCCAGTCTGCAGACTACGGACTTTGTGGC 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 ACTGGAGGATTTGGGCCTGAGGTTACTATGCCAGGGACTGAGGCACCCAGTCTGCAGACTACGGACTTTGTGGC 2173
Query 2588 TGAAGATCTGCCGCCTCACTGCTGCTGCCTGTGACGAGCTGGCCTCAACTCTCAGTGTGAACCAGAGCCTGAGA 2661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 TGAAGATCTGCCGCCTCACTGCTGCTGCCTGTGACGAGCTGGCCTCAACTCTCAGTGTGAACCAGAGCCTGAGA 2247
Query 2662 GAGCTGGACCTGAGCCTGAATGAGCTGGGGGACCTCGGGGTGCTGCTGCTGTGTGAGGGCCTCAGGCATCCCAC 2735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2248 GAGCTGGACCTGAGCCTGAATGAGCTGGGGGACCTCGGGGTGCTGCTGCTGTGTGAGGGCCTCAGGCATCCCAC 2321
Query 2736 GTGCAAGCTCCAGACCCTGCGGTTGGGCATCTGCCGGCTGGGCTCTGCCGCCTGTGAGGGTCTTTCTGTGGTGC 2809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 GTGCAAGCTCCAGACCCTGCGGTTGGGCATCTGCCGGCTGGGCTCTGCCGCCTGTGAGGGTCTTTCTGTGGTGC 2395
Query 2810 TCCAGGCCAACCACAACCTCCGGGAGCTGGACTTGAGTTTCAACGACCTGGGAGACTGGGGCCTGTGGTTGCTG 2883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 TCCAGGCCAACCACAACCTCCGGGAGCTGGACTTGAGTTTCAACGACCTGGGAGACTGGGGCCTGTGGTTGCTG 2469
Query 2884 GCTGAGGGGCTGCAACATCCCGCCTGCAGACTCCAGAAACTGTGGCTGGATAGCTGTGGCCTCACAGCCAAGGC 2957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2470 GCTGAGGGGCTGCAACATCCCGCCTGCAGACTCCAGAAACTGTGGCTGGATAGCTGTGGCCTCACAGCCAAGGC 2543
Query 2958 TTGTGAGAATCTTTACTTCACCCTGGGGATCAACCAGACCTTGACCGACCTTTACCTGACCAACAACGCCCTAG 3031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2544 TTGTGAGAATCTTTACTTCACCCTGGGGATCAACCAGACCTTGACCGACCTTTACCTGACCAACAACGCCCTAG 2617
Query 3032 GGGACACAGGTGTCCGACTGCTTTGCAAGCGGCTGAGCCATCCTGGCTGCAAACTCCGAGTCCTCTGGTTATTT 3105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2618 GGGACACAGGTGTCCGACTGCTTTGCAAGCGGCTGAGCCATCCTGGCTGCAAACTCCGAGTCCTCTGGTTATTT 2691
Query 3106 GGGATGGACCTGAATAAAATGACCCACAGTAGGTTGGCAGCGCTTCGAGTAACAAAACCTTATTTGGACATTGG 3179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 GGGATGGACCTGAATAAAATGACCCACAGTAGGTTGGCAGCGCTTCGAGTAACAAAACCTTATTTGGACATTGG 2765
Query 3180 CTGC 3183
||||
Sbjct 2766 CTGC 2769