Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09438
- Subject:
- XM_011540607.1
- Aligned Length:
- 2559
- Identities:
- 2470
- Gaps:
- 84
Alignment
Query 1 ATGACCGTGGAGTTCGAGGAGTGCGTCAAGGACTCCCCG-------------------CGCT--------TCAG 47
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Sbjct 1 ---------------------------ATGGCCTACCCGTCTTTCCAGCGGACCATGCCGCTTGCAGCTGTGAG 47
Query 48 GGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGACGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCA 121
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Sbjct 48 GGCGACCATTGACGAGGTGGAGACGGACGTGGTGGAGATTGAGGCCAAACTGGACAAGCTGGTGAAGCTGTGCA 121
Query 122 GTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCC 195
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Sbjct 122 GTGGCATGGTGGAAGCCGGTAAGGCCTACGTCAGCACCAGCAGGCTTTTCGTGAGCGGCGTCCGCGACCTGTCC 195
Query 196 CAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTC------------------------------GGAATGTCTGCAGAG 239
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Sbjct 196 CAGCAGTGCCAGGGCGACACCGTCATCTCGGTGAGGGGCCGACTGACCTCTGACCTCAAGGAATGTCTGCAGAG 269
Query 240 GTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGAACCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGC 313
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Sbjct 270 GTTCGCTGACAGCCTACAGGAGGTGGTGAACTACCACATGATCCTGTTTGACCAGGCCCAGAGGTCCGTGCGGC 343
Query 314 AGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGG 387
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Sbjct 344 AGCAGCTCCAGAGCTTTGTCAAAGAGGATGTGCGGAAGTTCAAGGAGACAAAGAAGCAGTTTGACAAGGTGCGG 417
Query 388 GAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCAC 461
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Sbjct 418 GAGGACCTGGAGCTGTCCCTGGTGAGGAACGCCCAGGCCCCGAGGCACCGGCCCCACGAGGTGGAGGAAGCCAC 491
Query 462 CGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGC 535
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Sbjct 492 CGGGGCCCTCACCCTCACCAGGAAGTGCTTCCGCCACCTGGCACTGGACTATGTGCTCCAGATCAATGTTCTGC 565
Query 536 AGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAG 609
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Sbjct 566 AGGCCAAGAAGAAGTTTGAGATCCTGGACTCTATGCTGTCCTTCATGCACGCCCAGTCCAGCTTCTTCCAGCAG 639
Query 610 GGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGA 683
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Sbjct 640 GGCTACAGCCTCCTGCACCAGCTGGACCCCTACATGAAGAAGCTGGCAGCCGAGCTGGACCAGCTGGTGATCGA 713
Query 684 CTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCT 757
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Sbjct 714 CTCTGCGGTGGAAAAGCGTGAGATGGAGCGAAAGCACGCCGCCATCCAGCAGCGGACGCTGCTGCAGGACTTCT 787
Query 758 CCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAG 831
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Sbjct 788 CCTACGATGAGTCCAAAGTGGAGTTTGACGTGGACGCGCCCAGTGGGGTGGTGATGGAGGGCTACCTCTTCAAG 861
Query 832 AGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAA 905
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Sbjct 862 AGGGCCAGCAACGCTTTCAAGACATGGAACCGGCGCTGGTTCTCCATTCAGAACAGCCAGCTGGTCTACCAGAA 935
Query 906 GAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCG 979
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Sbjct 936 GAAGCTCAAGGATGCCCTCACCGTGGTGGTGGATGACCTCCGCCTGTGCTCTGTGAAGCCGTGTGAGGACATCG 1009
Query 980 AGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGG 1053
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Sbjct 1010 AGCGGAGGTTCTGCTTCGAGGTGCTGTCACCCACCAAGAGCTGCATGCTGCAGGCTGACTCCGAGAAGCTGCGG 1083
Query 1054 CAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGA 1127
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Sbjct 1084 CAAGCCTGGGTCCAGGCTGTGCAGGCCAGCATCGCCTCCGCCTACCGCGAGAGCCCTGACAGTTGCTATAGCGA 1157
Query 1128 GAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGA 1201
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Sbjct 1158 GAGGCTGGACCGCACAGCATCCCCGTCCACGAGCAGCATCGACTCCGCCACCGACACTCGGGAGCGTGGCGTGA 1231
Query 1202 AGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGAC 1275
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Sbjct 1232 AGGGCGAGAGTGTGCTGCAGCGTGTGCAGAGTGTGGCCGGCAACAGCCAGTGCGGCGACTGCGGCCAGCCGGAC 1305
Query 1276 CCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGT 1349
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Sbjct 1306 CCCCGCTGGGCCAGCATCAACCTGGGCGTGCTGCTCTGCATTGAGTGCTCCGGCATCCACAGGAGCCTGGGTGT 1379
Query 1350 CCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTG 1423
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Sbjct 1380 CCACTGCTCCAAGGTGCGGTCCCTGACGCTGGACTCGTGGGAGCCTGAGCTGCTAAAGCTGATGTGTGAGCTTG 1453
Query 1424 GAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGC 1497
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Sbjct 1454 GAAACAGCGCTGTGAATCAGATCTATGAGGCCCAGTGTGAGGGTGCAGGCAGCAGGAAACCCACAGCCAGCAGC 1527
Query 1498 TCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGC 1571
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Sbjct 1528 TCCCGGCAGGACAAGGAGGCCTGGATCAAGGACAAATACGTGGAAAAGAAGTTTCTGCGGAAGGCGCCCATGGC 1601
Query 1572 ACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCA 1645
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Sbjct 1602 ACCAGCCCTGGAGGCCCCAAGACGCTGGAGGGTGCAGAAGTGCCTGCGGCCCCACAGCTCTCCCCGCGCTCCCA 1675
Query 1646 CTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGAT 1719
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Sbjct 1676 CTGCCCGCCGCAAGGTCCGGCTTGAGCCCGTTCTGCCCTGTGTGGCCGCTCTGTCCTCAGTGGGCACCCTGGAT 1749
Query 1720 CGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGC 1793
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Sbjct 1750 CGTAAGTTCCGCCGAGACTCCCTCTTCTGTCCCGACGAGCTGGACTCGCTCTTCTCCTACTTCGACGCAGGGGC 1823
Query 1794 CGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCC 1867
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Sbjct 1824 CGCAGGGGCTGGCCCTCGCAGTCTGAGTAGCGACAGTGGCCTTGGGGGCAGCTCGGATGGCAGCTCGGACGTCC 1897
Query 1868 TGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGT 1941
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Sbjct 1898 TGGCTTTCGGCTCGGGCTCTGTGGTGGACAGCGTCACTGAGGAGGAGGGTGCAGAGTCGGAGGAGTCCAGCGGT 1971
Query 1942 GAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGC 2015
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Sbjct 1972 GAGGCAGACGGGGACACTGAGGCCGAGGCCTGGGGCCTGGCGGACGTGCGCGAGCTGCACCCGGGGCTCTTGGC 2045
Query 2016 GCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGG 2089
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Sbjct 2046 GCACCGCGCAGCGCGTGCCCGCGACCTTCCTGCGCTGGCGGCGGCGCTGGCCCACGGGGCCGAGGTCAACTGGG 2119
Query 2090 CGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTC 2163
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Sbjct 2120 CGGACGCGGAGGATGAGGGCAAGACGCCGCTGGTGCAGGCCGTGCTAGGGGGCTCCTTGATCGTCTGTGAGTTC 2193
Query 2164 CTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCT 2237
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Sbjct 2194 CTGCTGCAAAACGGAGCGGACGTGAACCAAAGAGACAGCCGGGGCCGGGCGCCCCTGCACCACGCCACGCTGCT 2267
Query 2238 GGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGG 2311
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Sbjct 2268 GGGCCGCACCGGCCAGGTTTGCCTGTTCCTGAAGCGGGGCGCGGACCAGCACGCCCTGGACCAAGAGCAGCGGG 2341
Query 2312 ACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAG 2385
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Sbjct 2342 ACCCGTTGGCCATCGCAGTGCAGGCGGCCAACGCTGACATCGTGACACTGCTCCGTCTGGCGCGCATGGCGGAG 2415
Query 2386 GAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCG 2459
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Sbjct 2416 GAAATGCGCGAGGCCGAGGCTGCCCCTGGTCCCCCGGGCGCCCTGGCGGGCAGCCCCACGGAGCTCCAGTTCCG 2489
Query 2460 CAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC 2502
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Sbjct 2490 CAGGTGTATCCAGGAGTTCATCAGCCTCCACCTGGAAGAGAGC 2532