Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09483
• Subject: XM_006534431.2
• Aligned Length: 1150
• Identities: 918
• Gaps: 182

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74
            |||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAAATGGGAGCCCAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74

Query   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148

Query  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACAACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACCTTCGCAGACCCAGCAAGT  222

Query  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCAAAAGTTGCATTTCCTCG  296

Query  297  TCGAGCGCAACC--------------------------------------------------------------  308
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  297  TCGAGCGCAACCTAAGAGTCAAGAGCAGGGAGGCTCCTGGAAACGCACATGGACCACGGTCCAAGCTCGGGCTG  370

Query  309  ----------CAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGGAA  372
                      |.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  CCTCAGGTGACCAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATCTTCGTAGGAGGATTGTCTGCAAACACAGTAGTGGAA  444

Query  373  GATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAACAG  446
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  445  GATGTAAAGCAGTATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTAGAGGATGCGATGCTGATGTTCGACAAAACCACCAACAG  518

Query  447  GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG  520
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACCTTTGAGAATGAAGACGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCATG  592

Query  521  AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAGGC  666

Query  595  CGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTCGT  668
            |||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  667  CGGGCCCGGGGGCTGCCATACACCATGGATGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGCTACCCCAACTTTGT  740

Query  669  GGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAG---------------  727
            |||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||               
Sbjct  741  GGCAACCTATGGCAGAGGCTACCCCGGATTTGCTCCTAGCTATGGCTACCAGTTCCCAGCCCTATTACCATATT  814

Query  728  ---------GCTTCCCAGCAGCGGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGAT-----  787
                     |||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||..||||||     
Sbjct  815  TAAATGCAAGCTTCCCGGCGGCAGCTTATGGACCAGTGGCAGCGGCAGCTGTGGCAGCGGCTCGAGGATCAGTC  888

Query  788  -------------------------------------------------CAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGG  812
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGAATAGCTACAGTGCTCAACCGAATTTTGGCGCGCCCGCTTCCCCGGCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGG  962

Query  813  AGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGG  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGCTTCCCGGGGGCCAACAGCCCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGG  1036

Query  887  GGAATTACATAAGTGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGG---ACCTTTGAT-  956
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|   ||| |.||| 
Sbjct 1037  GGAATTACATAAGCGCGGCCAGCCCACAGCCGGGCTCCGGCTTCGGCCACGGCATAGCTAGCATACC-TGGATG  1109

Query  957  ----TGCAACGGCCT--------TTACAAATGGATACCAT  984
                .||||  |.||        ||.|             
Sbjct 1110  TCCAGGCAA--GACTGGGCGAAGTTTC-------------  1134