Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09518
- Subject:
- NM_001322144.1
- Aligned Length:
- 964
- Identities:
- 730
- Gaps:
- 221
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCACCCAAGCTGCTGTGTGCAGGAAGGTGTGTGGGCCAGGACGGGGCTGCACAGGCCTGGCACTGCCCTCC 74
Query 1 -----------------------ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGC------------CCTG-- 37
||| ||.|.||..|| ||||.| ||.|
Sbjct 75 AGGACAGGGTCACTCAGTGTGGGATG-----------CTGTCAGAATG--CCTCTCGGGGCGGGGACTCCAGTC 135
Query 38 --TTTCCAAAAACGCG-----------------------TACAGGCTCATCTTGGCAGCCAACAGGGATGAATT 86
|.|.||||.|||.| .||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 AATGTACAAAGACGTGAAGACTCAGCCACAGAAGGCAGCCACAGGCTCATCTTGGCAGCCAACAGGGATGAATT 209
Query 87 CTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGCTGGACATGGAGG 160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210 CTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGCTGGACATGGAGG 283
Query 161 AAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACCAACTACCTGCAG 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 284 AAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACCAACTACCTGCAG 357
Query 235 CCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGACGTGGACAGCTT 308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 CCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGACGTGGACAGCTT 431
Query 309 GTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAGCCAACCTGAGCA 382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 432 GTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAGCCGACCTGAGCA 505
Query 383 CAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTTTGACGCCAGGCACC 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506 CAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTTTGACGCCAGGCACC 579
Query 457 TACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAGCTCTTCCTGGAGGC 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 580 TACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAGCTCTTCCTGGAGGC 653
Query 531 TGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGCCAGCCTCCTGGATGTGCTCAACAATAAAGAGG 604
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 654 TGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGCCAGCCTCCTGGATGTGCTCAACAATGAAGAG- 726
Query 605 CGCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGCAAGTACGCGGCT 678
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 727 -GCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGCAAGTACGCGGCT 799
Query 679 GTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCAGAACCAACACTATCATCCTGGTAGATGCGGACGGCCACGTGAC 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 GTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCAGAACCAACACTATCATCCTGGTAGATGCGGACGGCCACGTGAC 873
Query 753 CTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAACCTATGAGTTCACACTGCAGA 826
||||||
Sbjct 874 CTTCAC-------------------------------------------------------------------- 879
Query 827 GC 828
Sbjct 880 -- 879