Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09527
- Subject:
- NM_001033369.3
- Aligned Length:
- 1479
- Identities:
- 954
- Gaps:
- 390
Alignment
Query 1 ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGCAGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTC 222
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1 --ATGCTAACCAACGGGAAAGAGCAGGTGATCAAATCGTGTGTGTCCCTCCCGGAACTAAATGCTCAGGTCTTC 72
Query 223 TGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCT 296
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 73 TGTCACAGTTCCAACAACGTGACCAAAACCGAATGTTGCTTCACAGACTTCTGCAACAATATCACACTGCACCT 146
Query 297 TCCAACAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACCCATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCC 370
|||.|||
Sbjct 147 TCCCACA------------------------------------------------------------------- 153
Query 371 TCCTGTCCATAGCTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGGAAGAAAAAGAGA 444
Sbjct 154 -------------------------------------------------------------------------- 153
Query 445 CCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGTAAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGA 518
Sbjct 154 -------------------------------------------------------------------------- 153
Query 519 TGTGACCGCCTCTGGATCTGGCTCTGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTC 592
|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 154 -------------------------GGTCTGCCTCTCTTGGTTCAAAGAACAATCGCAAGGACAATTGTACTTC 202
Query 593 AGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAA 666
|.|||||.||||||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 203 AAGAAATCGTAGGAAAAGGTCGGTTTGGGGAAGTGTGGCACGGAAGATGGTGTGGAGAAGATGTGGCTGTGAAA 276
Query 667 ATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATATTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGA 740
||||||||||||||.|||||.||||.||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||
Sbjct 277 ATATTCTCCTCCAGGGATGAGAGATCTTGGTTCCGTGAGGCGGAAATTTATCAGACGGTGATGCTGAGACACGA 350
Query 741 AAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAAT 814
.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 351 GAACATCCTCGGTTTCATCGCAGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACACAACTCTGGCTTGTGTCAGAGT 424
Query 815 ATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCATGGCTGGAATGATCAAGCTGGCG 888
||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 425 ATCACGAGCAGGGCTCCTTGTATGACTATTTGAACAGAAACATAGTGACTGTGGCTGGAATGGTCAAGCTGGCG 498
Query 889 CTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCA 962
||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 499 CTTTCCATAGCGAGTGGTCTGGCTCACCTGCACATGGAGATCGTGGGTACTCAAGGTAAGCCTGCTATTGCTCA 572
Query 963 TCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTAAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTG 1036
.|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct 573 CCGAGATATAAAGTCAAAGAATATCCTAGTCAAAAAATGTGACACTTGTGCCATAGCTGACTTAGGGCTGGCTG 646
Query 1037 TGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCT 1110
|||||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 647 TGAAGCACGATTCTATCATGAACACTATAGACATACCCCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTACATGGCT 720
Query 1111 CCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGG 1184
||.|||||||||||||||||||||||..|||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 721 CCCGAAATGCTTGATGATACAATGAACCTGAGCATCTTTGAGTCCTTCAAGCGAGCTGACATCTATTCGGTGGG 794
Query 1185 TCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATG 1258
.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 795 GCTGGTTTACTGGGAAATAGCTCGAAGGTGTTCAGTTGGAGGAGTTGTTGAGGAGTACCAGTTGCCTTACTATG 868
Query 1259 ACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATC 1332
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||.|.||
Sbjct 869 ACATGGTGCCTTCAGATCCTTCGATAGAAGAAATGAGGAAGGTTGTCTGTGATCAGAAACTCCGACCAAATCTC 942
Query 1333 CCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGG 1406
|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 943 CCAAACCAGTGGCAAAGCTGTGAAGCGCTGCGGGTCATGGGAAGAATAATGCGTGAGTGCTGGTACGCCAACGG 1016
Query 1407 AGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC 1479
.||.||.|||||.||.||.||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1017 GGCAGCACGCCTGACAGCCCTGCGCGTGAAGAAGACCATCTCCCAGCTGTGTGTCAAGGAAGACTGTAAAGCT 1089