Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09549
• Subject: NM_001205301.2
• Aligned Length: 3051
• Identities: 3025
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGATTTAATCCGAGGCGTCTTGCTCCGGCTCCTGCTCCTGGCTTCCAGCCTCGGACCCGGCGCGGTGTCGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATTTAATCCGAGGCGTCTTGCTCCGGCTCCTGCTCCTGGCTTCCAGCCTCGGACCCGGCGCGGTGTCGCT  74

Query   75  CCGAGCGGCCATCCGAAAACCAGGCAAGGTAGGGCCTCCTCTTGACATCAAGCTGGGCGCATTGAACTGTACGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGAGCGGCCATCCGAAAACCAGGCAAGGTAGGGCCTCCTCTTGACATCAAGCTGGGCGCATTGAACTGTACGG  148

Query  149  CTTTCAGCATCCAGTGGAAAATGCCAAGGCATCCTGGAAGTCCCATCCTTGGGTACACTGTCTTTTACTCTGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTTTCAGCATCCAGTGGAAAATGCCAAGGCATCCTGGAAGTCCCATCCTTGGGTACACTGTCTTTTACTCTGAG  222

Query  223  GTTGGCGCAGATAAATCCCTGCAGGAGCAGTTGCACAGCGTGCCTCTCAGCCGGGACATCCCGACCACGGAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTGGCGCAGATAAATCCCTGCAGGAGCAGTTGCACAGCGTGCCTCTCAGCCGGGACATCCCGACCACGGAGGA  296

Query  297  AGTGATTGGAGATTTGAAACCAGGCACTGAATATCGTGTGAGCATAGCAGCTTACAGCCAGGCTGGCAAAGGGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTGATTGGAGATTTGAAACCAGGCACTGAATATCGTGTGAGCATAGCAGCTTACAGCCAGGCTGGCAAAGGGC  370

Query  371  GGCTGAGCTCTCCTCGGCATGTCACCACTTTGTCCCAAGATTCCTGCCTGCCTCCTGCAGCTCCCCAGCAGCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTGAGCTCTCCTCGGCATGTCACCACTTTGTCCCAAGATTCCTGCCTGCCTCCTGCAGCTCCCCAGCAGCCA  444

Query  445  CATGTCATTGTGGTTTCGGATTCTGAGGTGGCCCTGTCTTGGAAACCTGGAGCGAGTGAAGGAAGCGCCCCTAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGTCATTGTGGTTTCGGATTCTGAGGTGGCCCTGTCTTGGAAACCTGGAGCGAGTGAAGGAAGCGCCCCTAT  518

Query  519  TCAGTACTATTCTGTGGAATTCATCAGGCCAGATTTCGACAAGAAGTGGACCTCAATCCATGAGCGGATCCAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGTACTATTCTGTGGAATTCATCAGGCCAGATTTCGACAAGAAGTGGACCTCAATCCATGAGCGGATCCAGA  592

Query  593  TGGACTCCATGGTTATCAAGGGCCTCGATCCAGATACCAACTACCAGTTTGCCGTGAGGGCAATGAATTCCCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGACTCCATGGTTATCAAGGGCCTCGATCCAGATACCAACTACCAGTTTGCCGTGAGGGCAATGAATTCCCAT  666

Query  667  GGCCCCAGCCCCCGCAGCTGGCCCAGTGACATCATCCGGACCCTCTGCCCTGAGGAGGCGGGAAGTGGCCGCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCCCAGCCCCCGCAGCTGGCCCAGTGACATCATCCGGACCCTCTGCCCTGAGGAGGCGGGAAGTGGCCGCTA  740

Query  741  TGGACCCCGTTATATCACCGACATGGGAGCTGGTGAGGATGATGAAGGATTTGAAGACGACTTAGATTTGGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGACCCCGTTATATCACCGACATGGGAGCTGGTGAGGATGATGAAGGATTTGAAGACGACTTAGATTTGGATA  814

Query  815  TTTCCTTTGAGGAGGTTAAACCACTTCCTGCTACCAAAGGAGGGAATAAGAAATTTTTGGTGGAAAGCAAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTCCTTTGAGGAGGTTAAACCACTTCCTGCTACCAAAGGAGGGAATAAGAAATTTTTGGTGGAAAGCAAGAAG  888

Query  889  ATGTCTATATCTAACCCAAAGACCATTTCTAGGCTCATCCCCCCTACCTCAGCATCTCTCCCTGTGACCACGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGTCTATATCTAACCCAAAGACCATTTCTAGGCTCATCCCCCCTACCTCAGCATCTCTCCCTGTGACCACGGT  962

Query  963  GGCTCCCCAGCCCATTCCCATACAGAGAAAGGGGAAGAATGGTGTGGCCATAATGTCAAGGCTCTTTGACATGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTCCCCAGCCCATTCCCATACAGAGAAAGGGGAAGAATGGTGTGGCCATAATGTCAAGGCTCTTTGACATGC  1036

Query 1037  CTTGTGATGAAACTCTCTGCTCTGCTGACAGCTTCTGTGTCAATGACTACACCTGGGGGGGCTCGCGATGCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTGTGATGAAACTCTCTGCTCTGCTGACAGCTTCTGTGTCAATGACTACACCTGGGGGGGCTCGCGATGCCAG  1110

Query 1111  TGCACCCTGGGCAAAGGTGGTGAGAGCTGCTCAGAAGATATTGTTATCCAGTATCCTCAGTTCTTTGGCCACTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGCACCCTGGGCAAAGGTGGTGAGAGCTGCTCAGAAGATATTGTTATCCAGTATCCTCAGTTCTTTGGCCACTC  1184

Query 1185  CTATGTAACGTTTGAACCTCTGAAGAATTCTTATCAGGCATTTCAAATTACTCTTGAATTTAGGGCGGAGGCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTATGTAACGTTTGAACCTCTGAAGAATTCTTATCAGGCATTTCAAATTACTCTTGAATTTAGGGCGGAGGCAG  1258

Query 1259  AGGATGGCTTACTGCTCTACTGTGGGGAGAACGAACACGGGAGGGGGGATTTCATGTCCCTGGCTATCATCCGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGATGGCTTACTGCTCTACTGTGGGGAGAACGAACACGGGAGGGGGGATTTCATGTCCCTGGCTATCATCCGA  1332

Query 1333  CGCTCCCTGCAGTTCAGGTTTAATTGTGGAACTGGGGTTGCCATCATCGTAAGTGAGACCAAAATCAAACTAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGCTCCCTGCAGTTCAGGTTTAATTGTGGAACTGGGGTTGCCATCATCGTAAGTGAGACCAAAATCAAACTAGG  1406

Query 1407  GGGTTGGCACATGGTTATGCTCTACAGAGATGGGCTGAACGGGCTGCTGCAGCTGAACAATGGCACCCCAGTGA  1480
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGTTGGCACACGGTTATGCTCTACAGAGATGGGCTGAACGGGCTGCTGCAGCTGAACAATGGCACCCCAGTGA  1480

Query 1481  CAGGCCAGTCTCAGGGCCAATACAGTAAAATTACTTTCCGGACACCTCTCTATCTTGGTGGCGCTCCCAGCGCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGGCCAGTCTCAGGGCCAATACAGTAAAATTACTTTCCGGACACCTCTCTATCTTGGTGGCGCTCCCAGCGCT  1554

Query 1555  TACTGGTTGGTTAGAGCAACAGGGACAAACCGAGGCTTTCAAGGCTGTGTGCAGTCGCTCGCTGTGAATGGGAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TACTGGTTGGTTAGAGCAACAGGGACAAACCGAGGCTTTCAAGGCTGTGTGCAGTCGCTCGCTGTGAATGGGAG  1628

Query 1629  GAGAATTGACATGAGGCCCTGGCCCCTGGGAAAAGCACTCAGTGGGGCTGATGTGGGGGAATGCAGCAGTGGAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAGAATTGACATGAGGCCCTGGCCCCTGGGAAAAGCACTCAGTGGGGCTGATGTGGGGGAATGCAGCAGTGGAA  1702

Query 1703  TCTGTGATGAGGCCTCGTGCATCCATGGTGGCACCTGCACAGCAATCAAAGCCGACTCCTACATTTGCCTCTGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCTGTGATGAGGCCTCGTGCATCCATGGTGGCACCTGCACAGCAATCAAAGCCGACTCCTACATTTGCCTCTGT  1776

Query 1777  CCCCTTGGGTTTAAAGGTCGACACTGTGAAGATGCTTTCACCTTGACCATTCCTCAGTTCAGAGAGTCTCTGAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCCTTGGGTTTAAAGGTCGACACTGTGAAGATGCTTTCACCTTGACCATTCCTCAGTTCAGAGAGTCTCTGAG  1850

Query 1851  ATCTTACGCTGCAACTCCCTGGCCACTGGAGCCCCAGCATTACCTTTCCTTCATGGAATTTGAGATCACATTTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATCTTACGCTGCAACTCCCTGGCCACTGGAGCCCCAGCATTACCTTTCCTTCATGGAATTTGAGATCACATTTC  1924

Query 1925  GGCCAGACTCAGGAGATGGTGTCCTCCTGTACAGCTATGACACAGGCAGCAAAGACTTCCTGTCCATCAACTTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGCCAGACTCAGGAGATGGTGTCCTCCTGTACAGCTATGACACAGGCAGCAAAGACTTCCTGTCCATCAACTTG  1998

Query 1999  GCAGGGGGCCACGTGGAGTTCCGCTTTGACTGTGGCTCTGGGACCGGTGTCCTCAGGAGTGAAGATCCCCTCAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCAGGGGGCCACGTGGAGTTCCGCTTTGACTGTGGCTCTGGGACCGGTGTCCTCAGGAGTGAAGATCCCCTCAC  2072

Query 2073  CCTGGGCAACTGGCACGAGCTTCGTGTATCTCGCACAGCAAAGAATGGAATCTTACAGGTGGATAAGCAGAAGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTGGGCAACTGGCACGAGCTTCGTGTATCTCGCACAGCAAAGAATGGAATCTTACAGGTGGATAAGCAGAAGA  2146

Query 2147  TAGTGGAGGGAATGGCAGAGGGAGGCTTCACACAGATTAAGTGCAACACAGACATTTTCATTGGCGGAGTCCCC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAGTGGAGGGAATGGCAGAGGGAGGCTTCACACAGATTAAGTGCAACACAGACATTTTCATTGGCGGAGTCCCC  2220

Query 2221  AATTATGATGATGTGAAGAAGAACTCGGGTGTCCTGAAGCCTTTCAGCGGGAGCATCCAGAAGATCATCCTGAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AATTATGATGATGTGAAGAAGAACTCGGGTGTCCTGAAGCCTTTCAGCGGGAGCATCCAGAAGATCATCCTGAA  2294

Query 2295  TGACCGAACCATCCATGTGAAGCATGACTTCACCTCCGGAGTGAATGTGGAGAATGCGGCCCACCCCTGTGTGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGACCGAACCATCCATGTGAAGCATGACTTCACCTCCGGAGTGAATGTGGAGAATGCGGCCCACCCCTGTGTGA  2368

Query 2369  GAGCCCCTTGTGCCCATGGGGGCAGCTGCCGGCCCAGGAAGGAGGGCTATGACTGTGACTGCCCCTTGGGCTTT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GAGCCCCTTGTGCCCATGGGGGCAGCTGCCGGCCCAGGAAGGAGGGCTATGACTGTGACTGCCCCTTGGGCTTT  2442

Query 2443  GAGGGGCTTCACTGCCAGAAAG------------------------CGATCATAGAAGCCATTGAGATCCCGCA  2492
            ||||||||||||||||||||||                        ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GAGGGGCTTCACTGCCAGAAAGAGTGTGGGAACTACTGCCTCAATACGATCATAGAAGCCATTGAGATCCCGCA  2516

Query 2493  GTTTATCGGCCGCAGTTACCTGACGTATGACAACCCAGATATCTTGAAGAGGGTGTCAGGATCAAGATCAAATG  2566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GTTTATCGGCCGCAGTTACCTGACGTATGACAACCCAGATATCTTGAAGAGGGTGTCAGGATCAAGATCAAATG  2590

Query 2567  TGTTCATGAGGTTTAAAACAACTGCCAAGGATGGCCTTTTGCTGTGGAGGGGAGACAGCCCCATGAGACCCAAC  2640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGTTCATGAGGTTTAAAACAACTGCCAAGGATGGCCTTTTGCTGTGGAGGGGAGACAGCCCCATGAGACCCAAC  2664

Query 2641  AGCGACTTCATTTCCTTGGGCCTTCGGGATGGAGCCCTCGTGTTCAGCTATAACCTGGGCAGTGGTGTGGCATC  2714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AGCGACTTCATTTCCTTGGGCCTTCGGGATGGAGCCCTCGTGTTCAGCTATAACCTGGGCAGTGGTGTGGCATC  2738

Query 2715  CATCATGGTGAATGGCTCCTTCAACGATGGTCGGTGGCACCGAGTTAAGGCCGTTAGGGATGGCCAGTCAGGAA  2788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CATCATGGTGAATGGCTCCTTCAACGATGGTCGGTGGCACCGAGTTAAGGCCGTTAGGGATGGCCAGTCAGGAA  2812

Query 2789  AGATAACCGTGGATGACTATGGAGCCAGAACAGGCAAATCCCCAGGCATGATGCGGCAGCTTAACATCAATGGA  2862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGATAACCGTGGATGACTATGGAGCCAGAACAGGCAAATCCCCAGGCATGATGCGGCAGCTTAACATCAATGGA  2886

Query 2863  GCTCTGTATGTGGGTGGAATGAAGGAAATTGCTCTGCACACTAACAGGCAATATATGAGAGGGCTCGTGGGCTG  2936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GCTCTGTATGTGGGTGGAATGAAGGAAATTGCTCTGCACACTAACAGGCAATATATGAGAGGGCTCGTGGGCTG  2960

Query 2937  TATCTCTCACTTCACCCTGTCCACCGATTACCACATTTCCCTCGTGGAAGATGCCGTGGATGGAAAAAACATCA  3010
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2961  TATCTCTCACTTCACCCTGTCCACCGATTACCACATTTCCCTCGTGGAAGATGCCGTGGATGGGAAAAACATCA  3034

Query 3011  ACACTTGTGGAGCCAAG  3027
            |||||||||||||||||
Sbjct 3035  ACACTTGTGGAGCCAAG  3051