Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09602
• Subject: XM_006526325.3
• Aligned Length: 1800
• Identities: 1522
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGCCAGCTTTGTCTACGGGATCTGGGAGTGACACTGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCAGCCCAGCT  74
            ||||||||..||.|.||.|||||.|...|.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCAGCGCTGGCCACAGGATCGGCTTGCGACATGGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCTGCCCAGCT  74

Query   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAAGACCTGACCTTCCTCTGGGATATGTTTGGTGAAAAAAGCCTGCATTCAT  148
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAGGACCTGACCTTCCTCTGGGACGTGTTTGGTGAAAAGAGCCTGCATTCAC  148

Query  149  TGGTAAAGATTCATGAAAAACTACACTACTATGAGAAGCAGAGTCCGGTGCCCATTCTCCATGGTGCGGCGGCC  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TGGTCAAGATTCATGAAAAACTTCACTGCTATGAGAAGCAGAATCCGTTGCCCATTCTCCATGGTGCAGCAGCG  222

Query  223  TTGGCCGATGATCTGGCCGAAGAGCTTCAGAACAAGCCATTAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTACT  296
            |||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TTGGCTGATGATCTGACTGAAGAGCTACAGAACAAGCTACCAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTGCT  296

Query  297  GTCAAAACCCAATGTGAAGGCTTTGCTCTCTGTACATGATACTGTGGCTCAGAAGAATTACGACCCAGTGTTGC  370
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||.||.||||
Sbjct  297  GTCAAAACCCAATGTCAAGGCTTTGCTGTCAGTACATGATACTGTGGCTCAAAAGAGTTATGATCCTGTATTGC  370

Query  371  CTCCTATGCCTGAAGATATTGACGATGAGGAAGACTCAGTAAAAATAATCCGTCTGGTCAAAAATAGAGAACCA  444
            ||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  CTCCCGTGCCTGACGATATTGATGATGAGGAAGACTCTGTGAAAATAATCCGCCTGGTCAAAAATAGCGAGCCC  444

Query  445  CTGGGAGCTACCATTAAGAAGGATGAACAGACCGGGGCGATCATTGTGGCCAGAATCATGAGAGGAGGAGCTGC  518
            |||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||.|||||||.||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  445  CTGGGTGCTACCATTAAAAAAGATGAGCAGACCGGAGCAATCACTGTGGCCCGAATCATGCGGGGAGGAGCTGC  518

Query  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCATGTTGGTGATGAACTTAGGGAAGTCAACGGGATACCAGTGGAGGATAAAAGGC  592
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCACGTGGGTGATGAGCTGAGGGAAGTGAATGGAATCCCAGTGGAAGATAAGAGGC  592

Query  593  CTGAGGAAATAATACAGATTTTGGCTCAGTCTCAGGGAGCAATTACATTTAAGATTATACCCGGCAGCAAAGAG  666
            ||||||||||||||.||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||
Sbjct  593  CTGAGGAAATAATAAAGATTTTGAGTCAGTCCAAGGGAGCAATTACATTTAAGATAATACCCAGCACCAAAGAG  666

Query  667  GAGACACCATCAAAAGAAGGCAAGATGTTTATCAAAGCCCTCTTTGACTATAATCCTAATGAGGATAAGGCAAT  740
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.||.||||||||
Sbjct  667  GAGACACCTTCGAAAGAAGGCAAGATATTTATCAAAGCCCTCTTTGACTACGATCCTAAGGAAGACAAGGCAAT  740

Query  741  TCCATGTAAGGAAGCTGGGCTTTCTTTCAAAAAGGGAGATATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGCAACTT  814
            .||.|||||.||.||.|||||.|||||||..|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||.|
Sbjct  741  CCCGTGTAAAGAGGCAGGGCTGTCTTTCAGGAAGGGGGACATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGTGACAT  814

Query  815  GGTGGCAAGCGAAACACGAAGCTGATGCCAACCCCAGGGCAGGCTTGATCCCCTCAAAGCATTTCCAGGAAAGG  888
            |||||||.||.||.||.||||..||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||.||
Sbjct  815  GGTGGCAGGCTAAGCATGAAGGAGATGCCAACCCCAGAGCGGGCCTGATTCCCTCCAAGCACTTCCAGGAACGG  888

Query  889  AGATTGGCTTTGAGACGACCAGAAATATTGGTTCAGCCCCTGAAAGTTTCCAACAGGAAATCAT----------  952
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||.|||||||||.||||||||          
Sbjct  889  AGACTGGCTCTGAGACGACCAGAAATAGTAGTTCAGCCTCTGAAACTTTCCAACACGAAATCATATGAGGAAAC  962

Query  953  --------------------------------------------------------------CTGGTTTTAGAA  964
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  963  AGTTGAATGTGAGGAAATTAAAGACACTGGACATGATGGTAACAACAGCGGAACCTACATAGCTGGTTTTAGAA  1036

Query  965  GAAGTTTTCGTCTTAGTAGAAAAGATAAGAAAACAAATAAATCCATGTATGAATGCAAGAAGAGTGATCAGTAC  1038
            |||||||.||||||||.||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1037  GAAGTTTCCGTCTTAGCAGAAAAAATAAGAAAATAAATAAGTCCATGTATGAATGCAAAAAGAGTGAGCAGTAT  1110

Query 1039  GACACAGCTGACGTACCCACATACGAAGAAGTGACACCGTATCGGCGACAAACTAATGAAAAATACAGACTCGT  1112
            |||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|...||||.||||||||||||.|
Sbjct 1111  GACACGGCAGATGTGCCCACATATGAGGAGGTGACACCCTACCGGCGGCAGATCCATGACAAATACAGACTCAT  1184

Query 1113  TGTCTTGGTTGGTCCCGTGGGAGTAGGGCTGAATGAACTGAAACGAAAGCTGCTGATCAGTGACACACAGCACT  1186
            ||||.||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||..||||.|||||..|||||||||
Sbjct 1185  TGTCCTGGTTGGTCCTGTCGGAGTCGGGCTAAATGAGCTGAAGCGAAAGCTATTGATGAGTGATGCACAGCACT  1258

Query 1187  ATGGCGTGACAGTGCCCCATACCACCAGAGCAAGAAGAAGCCAGGAGAGTGATGGTGTTGAATACATTTTCATT  1260
            ||||.||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1259  ATGGTGTGATAGTGCCCCACACCACTAGAGCAAGAAGAAGCCAAGAGAGTGATGGTGTGGAATATATTTTTATT  1332

Query 1261  TCCAAGCATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTTATTGAATATGGAGAATATAAAAACAACTACTA  1334
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1333  TCCAAACATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTCATTGAGTATGGTGAATATAAAAACAACTATTA  1406

Query 1335  CGGCACAAGTATAGACTCAGTTCGGTCTGTCCTTGCTAAAAACAAAGTTTGTTTGTTGGATGTTCAGCCTCATA  1408
            .||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407  TGGTACAAGTATAGACTCGGTTCGCTCTGTCCTAGCTAAGAACAAGGTTTGTCTGTTGGATGTCCAGCCTCATA  1480

Query 1409  CAGTGAAGCATTTAAGGACACTAGAATTTAAGCCCTATGTGATATTTATAAAGCCTCCATCAATAGAGCGTTTG  1482
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  CAGTGAAGCATTTAAGGACACTGGAGTTCAAACCCTATGTGATATTTATAAAACCTCCATCCATAGAGCGTTTG  1554

Query 1483  AGAGAAACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGTGCTGCAAAACCCTTCACAGAAGA  1556
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1555  AGAGAGACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGGACTGCAAAGCCCTTCACGGAAGA  1628

Query 1557  AGATTTTCAAGAAATGATTAAATCTGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGTCATCTTTTTGACAAAATTATAA  1630
            |||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  AGACTTTCAGGAAATGATTAAATCAGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGCCATCTTTTTGACAAAATCATAA  1702

Query 1631  TAAATGATGACCTCACTGTGGCATTTAATGAGCTCAAAACAACTTTTGACAAATTAGAGACAGAGACCCATTGG  1704
            |.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||
Sbjct 1703  TCAATGATGATCTTACTGTGGCATTTAATGAGCTAAAAACAACATTTGACAAACTAGAGACTGATACCCATTGG  1776

Query 1705  GTGCCAGTGAGCTGGTTACATTCA  1728
            ||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1777  GTCCCAGTGAGTTGGTTACATTCA  1800