Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09602
• Subject: XM_006526326.3
• Aligned Length: 1728
• Identities: 1522
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCAGCTTTGTCTACGGGATCTGGGAGTGACACTGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCAGCCCAGCT  74
            ||||||||..||.|.||.|||||.|...|.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCCAGCGCTGGCCACAGGATCGGCTTGCGACATGGGTCTGTATGAGCTGTTGGCTGCTCTGCCTGCCCAGCT  74

Query   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAAGACCTGACCTTCCTCTGGGATATGTTTGGTGAAAAAAGCCTGCATTCAT  148
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct   75  GCAGCCACATGTGGATAGCCAGGAGGACCTGACCTTCCTCTGGGACGTGTTTGGTGAAAAGAGCCTGCATTCAC  148

Query  149  TGGTAAAGATTCATGAAAAACTACACTACTATGAGAAGCAGAGTCCGGTGCCCATTCTCCATGGTGCGGCGGCC  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TGGTCAAGATTCATGAAAAACTTCACTGCTATGAGAAGCAGAATCCGTTGCCCATTCTCCATGGTGCAGCAGCG  222

Query  223  TTGGCCGATGATCTGGCCGAAGAGCTTCAGAACAAGCCATTAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTACT  296
            |||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  TTGGCTGATGATCTGACTGAAGAGCTACAGAACAAGCTACCAAACAGTGAGATCAGAGAGCTGTTGAAACTGCT  296

Query  297  GTCAAAACCCAATGTGAAGGCTTTGCTCTCTGTACATGATACTGTGGCTCAGAAGAATTACGACCCAGTGTTGC  370
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.|||.||.||.||.||||
Sbjct  297  GTCAAAACCCAATGTCAAGGCTTTGCTGTCAGTACATGATACTGTGGCTCAAAAGAGTTATGATCCTGTATTGC  370

Query  371  CTCCTATGCCTGAAGATATTGACGATGAGGAAGACTCAGTAAAAATAATCCGTCTGGTCAAAAATAGAGAACCA  444
            ||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  CTCCCGTGCCTGACGATATTGATGATGAGGAAGACTCTGTGAAAATAATCCGCCTGGTCAAAAATAGCGAGCCC  444

Query  445  CTGGGAGCTACCATTAAGAAGGATGAACAGACCGGGGCGATCATTGTGGCCAGAATCATGAGAGGAGGAGCTGC  518
            |||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||.|||||||.||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  445  CTGGGTGCTACCATTAAAAAAGATGAGCAGACCGGAGCAATCACTGTGGCCCGAATCATGCGGGGAGGAGCTGC  518

Query  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCATGTTGGTGATGAACTTAGGGAAGTCAACGGGATACCAGTGGAGGATAAAAGGC  592
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AGATAGAAGTGGTCTTATTCACGTGGGTGATGAGCTGAGGGAAGTGAATGGAATCCCAGTGGAAGATAAGAGGC  592

Query  593  CTGAGGAAATAATACAGATTTTGGCTCAGTCTCAGGGAGCAATTACATTTAAGATTATACCCGGCAGCAAAGAG  666
            ||||||||||||||.||||||||..||||||..||||||||||||||||||||||.||||||.|||.|||||||
Sbjct  593  CTGAGGAAATAATAAAGATTTTGAGTCAGTCCAAGGGAGCAATTACATTTAAGATAATACCCAGCACCAAAGAG  666

Query  667  GAGACACCATCAAAAGAAGGCAAGATGTTTATCAAAGCCCTCTTTGACTATAATCCTAATGAGGATAAGGCAAT  740
            ||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||.||.||||||||
Sbjct  667  GAGACACCTTCGAAAGAAGGCAAGATATTTATCAAAGCCCTCTTTGACTACGATCCTAAGGAAGACAAGGCAAT  740

Query  741  TCCATGTAAGGAAGCTGGGCTTTCTTTCAAAAAGGGAGATATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGCAACTT  814
            .||.|||||.||.||.|||||.|||||||..|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||.|
Sbjct  741  CCCGTGTAAAGAGGCAGGGCTGTCTTTCAGGAAGGGGGACATTCTTCAGATTATGAGCCAAGATGATGTGACAT  814

Query  815  GGTGGCAAGCGAAACACGAAGCTGATGCCAACCCCAGGGCAGGCTTGATCCCCTCAAAGCATTTCCAGGAAAGG  888
            |||||||.||.||.||.||||..||||||||||||||.||.|||.||||.|||||.|||||.|||||||||.||
Sbjct  815  GGTGGCAGGCTAAGCATGAAGGAGATGCCAACCCCAGAGCGGGCCTGATTCCCTCCAAGCACTTCCAGGAACGG  888

Query  889  AGATTGGCTTTGAGACGACCAGAAATATTGGTTCAGCCCCTGAAAGTTTCCAACAGGAAATCATCTGGTTTTAG  962
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||||.||||||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGACTGGCTCTGAGACGACCAGAAATAGTAGTTCAGCCTCTGAAACTTTCCAACACGAAATCATCTGGTTTTAG  962

Query  963  AAGAAGTTTTCGTCTTAGTAGAAAAGATAAGAAAACAAATAAATCCATGTATGAATGCAAGAAGAGTGATCAGT  1036
            |||||||||.||||||||.||||||.|||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  963  AAGAAGTTTCCGTCTTAGCAGAAAAAATAAGAAAATAAATAAGTCCATGTATGAATGCAAAAAGAGTGAGCAGT  1036

Query 1037  ACGACACAGCTGACGTACCCACATACGAAGAAGTGACACCGTATCGGCGACAAACTAATGAAAAATACAGACTC  1110
            |.|||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|...||||.||||||||||||
Sbjct 1037  ATGACACGGCAGATGTGCCCACATATGAGGAGGTGACACCCTACCGGCGGCAGATCCATGACAAATACAGACTC  1110

Query 1111  GTTGTCTTGGTTGGTCCCGTGGGAGTAGGGCTGAATGAACTGAAACGAAAGCTGCTGATCAGTGACACACAGCA  1184
            .|||||.||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||..||||.|||||..|||||||
Sbjct 1111  ATTGTCCTGGTTGGTCCTGTCGGAGTCGGGCTAAATGAGCTGAAGCGAAAGCTATTGATGAGTGATGCACAGCA  1184

Query 1185  CTATGGCGTGACAGTGCCCCATACCACCAGAGCAAGAAGAAGCCAGGAGAGTGATGGTGTTGAATACATTTTCA  1258
            ||||||.||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1185  CTATGGTGTGATAGTGCCCCACACCACTAGAGCAAGAAGAAGCCAAGAGAGTGATGGTGTGGAATATATTTTTA  1258

Query 1259  TTTCCAAGCATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTTATTGAATATGGAGAATATAAAAACAACTAC  1332
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259  TTTCCAAACATTTGTTTGAGACAGATGTACAAAATAACAAGTTCATTGAGTATGGTGAATATAAAAACAACTAT  1332

Query 1333  TACGGCACAAGTATAGACTCAGTTCGGTCTGTCCTTGCTAAAAACAAAGTTTGTTTGTTGGATGTTCAGCCTCA  1406
            ||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  TATGGTACAAGTATAGACTCGGTTCGCTCTGTCCTAGCTAAGAACAAGGTTTGTCTGTTGGATGTCCAGCCTCA  1406

Query 1407  TACAGTGAAGCATTTAAGGACACTAGAATTTAAGCCCTATGTGATATTTATAAAGCCTCCATCAATAGAGCGTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1407  TACAGTGAAGCATTTAAGGACACTGGAGTTCAAACCCTATGTGATATTTATAAAACCTCCATCCATAGAGCGTT  1480

Query 1481  TGAGAGAAACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGTGCTGCAAAACCCTTCACAGAA  1554
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.|||
Sbjct 1481  TGAGAGAGACAAGAAAAAATGCAAAGATTATTTCAAGCAGAGATGACCAAGGGACTGCAAAGCCCTTCACGGAA  1554

Query 1555  GAAGATTTTCAAGAAATGATTAAATCTGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGTCATCTTTTTGACAAAATTAT  1628
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  GAAGACTTTCAGGAAATGATTAAATCAGCACAGATAATGGAAAGTCAATATGGCCATCTTTTTGACAAAATCAT  1628

Query 1629  AATAAATGATGACCTCACTGTGGCATTTAATGAGCTCAAAACAACTTTTGACAAATTAGAGACAGAGACCCATT  1702
            |||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||||
Sbjct 1629  AATCAATGATGATCTTACTGTGGCATTTAATGAGCTAAAAACAACATTTGACAAACTAGAGACTGATACCCATT  1702

Query 1703  GGGTGCCAGTGAGCTGGTTACATTCA  1728
            ||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1703  GGGTCCCAGTGAGTTGGTTACATTCA  1728