Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09616
- Subject:
- NM_001313971.1
- Aligned Length:
- 951
- Identities:
- 758
- Gaps:
- 42
Alignment
Query 1 ATGCTGGTCACCTTGGGACTGCTCACCTCCTTCTTCTCGTTCCTGTATATGGTAGCTCCATCCATCAGGAAGTT 74
||||||.|.|.|||||.||||||.||.||||||.||||..||.|||||.||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGTTTATCTTGGTACTGCTTACGTCCTTCCTCTCCATCTTGTATCTGACAGCTCCATCCATCAGGAAGTT 74
Query 75 CTTTGCTGGTGGAGTGTGTAGAACAAATGTGCAGCTTCCTGGCAAGGTAGTGGTGATCACTGGCGCCAACACGG 148
|||||||||||||||.||||.|||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 75 CTTTGCTGGTGGAGTTTGTACAACAAATGTCCAGATCCCAGGGAAGGTAGTGGTCATCACAGGTGCCAACACAG 148
Query 149 GCATTGGCAAGGAGACGGCCAGAGAGCTCGCTAGCCGAGGAGCCCGAGTCTATATTGCCTGCAGAGATGTACTG 222
||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|..|||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||.|||
Sbjct 149 GCATTGGCAAGGAGACAGCCAGAGAGCTTGCTCGAAGAGGAGCACGAGTATACATTGCTTGCCGAGATGTGCTG 222
Query 223 AAGGGGGAGTCTGCTGCCAGTGAAATCCGAGTGGATACAAAGAACTCCCAGGTGCTGGTGCGGAAATTGGACCT 296
|||||.|||||||||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGGGAGAGTCTGCTGCTAGTGAAATCCGAGCAGATACCAAGAACTCCCAGGTGCTAGTGCGGAAATTGGACCT 296
Query 297 ATCCGACACCAAATCTATCCGAGCCTTTGCTGAGGGCTTTCTGGCAGAGGAAAAGCAGCTCCATATTCTGATCA 370
.||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.|||
Sbjct 297 GTCTGACACCAAATCCATCCGAGCCTTTGCTGAACGCTTCCTAGCA---------------------------- 342
Query 371 ACAATGCGGGAGTAATGATGTGTCCATATTCCAAGACAGCTGATGGCTTTGAAACCCACCTGGGAGTCAACCAC 444
|||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||
Sbjct 343 --------GGAGTGATGATGTGCCCATATTCTAAGACAACAGATGGCTTTGAGACCCACTTTGGAGTCAACCAC 408
Query 445 CTGGGCCACTTCCTCCTCACCTACCTGCTCCTGGAGCAGCTAAAGGTGTCTGCCCCTGCACGGGTGGTTAATGT 518
|||||.|||||.||.||.||.||||||||..|||||..|||.||||.||||||.||.|||||||||||.||..|
Sbjct 409 CTGGGACACTTTCTTCTTACATACCTGCTGTTGGAGAGGCTGAAGGAGTCTGCTCCCGCACGGGTGGTCAACCT 482
Query 519 GTCCTCGGTGGCTCACCACATTGGCAAGATTCCCTTCCACGACCTCCAGAGCGAGAAGCGCTACAGCAGGGGTT 592
.|||||..|.|||||||..|||||||||||.|..|||||.||||||||..||.||||.||.|||.||||.|.||
Sbjct 483 TTCCTCAATAGCTCACCTGATTGGCAAGATCCGTTTCCATGACCTCCAAGGCCAGAAACGATACTGCAGTGCTT 556
Query 593 TTGCCTATTGCCACAGCAAGCTGGCCAATGTGCTTTTTACTCGTGAGCTGGCCAAGAGGCTCCAAGGCACCGGG 666
||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.
Sbjct 557 TTGCCTATGGCCACAGCAAGCTGGCCAATCTGCTCTTCACTCGAGAACTGGCTAAGCGGCTCCAAGGGACTGGA 630
Query 667 GTCACCACCTACGCAGTGCACCCAGGCGTCGTCCGCTCTGAGCTGGTCCGGCACTCCTCCCTGCTCTGCCTGCT 740
||||||.||||.||.||.|||||.|||||.||....||.|||.|...|.||.||||||.||||||.||..||||
Sbjct 631 GTCACCGCCTATGCGGTTCACCCGGGCGTTGTATTGTCAGAGATCACCAGGAACTCCTACCTGCTGTGTTTGCT 704
Query 741 CTGGCGGCTCTTCTCCCCCTTTGTCAAG---ACGGCACGGGAGGGGGCGCAGACCAGCCTGCACTGCGCCCTGG 811
.||||||||||||||.|||||..||||| ||..|.| |||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 705 ATGGCGGCTCTTCTCACCCTTCTTCAAGTCCACTTCTC---AGGGGGCTCAGACCAGCCTGCACTGTGCTCTGG 775
Query 812 CTGAGGGCCTGGAGCCCCTGAGTGGCAAGTACTTCAGTGACTGCAAGAGGACCTGGGTGTCTCCAAGGGCCCGA 885
|.||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||..||||||||||.
Sbjct 776 CGGAGGACCTAGAGCCCCTGAGTGGAAAGTACTTCAGTGACTGCAAGAGGATGTGGGTATCCTCAAGGGCCCGG 849
Query 886 AATAACAAAACAGCTGAGCGCCTATGGAATGTCAGCTGTGAGCTTCTAGGAATCCGGTGGGAG 948
||.||.||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 850 AACAAGAAAACAGCTGAGCGATTGTGGAACGTCAGCTGCGAGCTTCTAGGAATCCAGTGGGAA 912