Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09616
• Subject: NM_030017.4
• Aligned Length: 951
• Identities: 790
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGCTGGTCACCTTGGGACTGCTCACCTCCTTCTTCTCGTTCCTGTATATGGTAGCTCCATCCATCAGGAAGTT  74
           ||||||.|.|.|||||.||||||.||.||||||.||||..||.|||||.||..|||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCTGTTTATCTTGGTACTGCTTACGTCCTTCCTCTCCATCTTGTATCTGACAGCTCCATCCATCAGGAAGTT  74

Query  75  CTTTGCTGGTGGAGTGTGTAGAACAAATGTGCAGCTTCCTGGCAAGGTAGTGGTGATCACTGGCGCCAACACGG  148
           |||||||||||||||.||||.|||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  75  CTTTGCTGGTGGAGTTTGTACAACAAATGTCCAGATCCCAGGGAAGGTAGTGGTCATCACAGGTGCCAACACAG  148

Query 149  GCATTGGCAAGGAGACGGCCAGAGAGCTCGCTAGCCGAGGAGCCCGAGTCTATATTGCCTGCAGAGATGTACTG  222
           ||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|..|||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||.|||
Sbjct 149  GCATTGGCAAGGAGACAGCCAGAGAGCTTGCTCGAAGAGGAGCACGAGTATACATTGCTTGCCGAGATGTGCTG  222

Query 223  AAGGGGGAGTCTGCTGCCAGTGAAATCCGAGTGGATACAAAGAACTCCCAGGTGCTGGTGCGGAAATTGGACCT  296
           |||||.|||||||||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGGGAGAGTCTGCTGCTAGTGAAATCCGAGCAGATACCAAGAACTCCCAGGTGCTAGTGCGGAAATTGGACCT  296

Query 297  ATCCGACACCAAATCTATCCGAGCCTTTGCTGAGGGCTTTCTGGCAGAGGAAAAGCAGCTCCATATTCTGATCA  370
           .||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.||.||||||||||||.||||.||||||.||||||
Sbjct 297  GTCTGACACCAAATCCATCCGAGCCTTTGCTGAACGCTTCCTAGCAGAGGAAAAGAAGCTTCATATTTTGATCA  370

Query 371  ACAATGCGGGAGTAATGATGTGTCCATATTCCAAGACAGCTGATGGCTTTGAAACCCACCTGGGAGTCAACCAC  444
           |||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||
Sbjct 371  ACAATGCAGGAGTGATGATGTGCCCATATTCTAAGACAACAGATGGCTTTGAGACCCACTTTGGAGTCAACCAC  444

Query 445  CTGGGCCACTTCCTCCTCACCTACCTGCTCCTGGAGCAGCTAAAGGTGTCTGCCCCTGCACGGGTGGTTAATGT  518
           |||||.|||||.||.||.||.||||||||..|||||..|||.||||.||||||.||.|||||||||||.||..|
Sbjct 445  CTGGGACACTTTCTTCTTACATACCTGCTGTTGGAGAGGCTGAAGGAGTCTGCTCCCGCACGGGTGGTCAACCT  518

Query 519  GTCCTCGGTGGCTCACCACATTGGCAAGATTCCCTTCCACGACCTCCAGAGCGAGAAGCGCTACAGCAGGGGTT  592
           .|||||..|.|||||||..|||||||||||.|..|||||.||||||||..||.||||.||.|||.||||.|.||
Sbjct 519  TTCCTCAATAGCTCACCTGATTGGCAAGATCCGTTTCCATGACCTCCAAGGCCAGAAACGATACTGCAGTGCTT  592

Query 593  TTGCCTATTGCCACAGCAAGCTGGCCAATGTGCTTTTTACTCGTGAGCTGGCCAAGAGGCTCCAAGGCACCGGG  666
           ||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||.|||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.||.
Sbjct 593  TTGCCTATGGCCACAGCAAGCTGGCCAATCTGCTCTTCACTCGAGAACTGGCTAAGCGGCTCCAAGGGACTGGA  666

Query 667  GTCACCACCTACGCAGTGCACCCAGGCGTCGTCCGCTCTGAGCTGGTCCGGCACTCCTCCCTGCTCTGCCTGCT  740
           ||||||.||||.||.||.|||||.|||||.||....||.|||.|...|.||.||||||.||||||.||..||||
Sbjct 667  GTCACCGCCTATGCGGTTCACCCGGGCGTTGTATTGTCAGAGATCACCAGGAACTCCTACCTGCTGTGTTTGCT  740

Query 741  CTGGCGGCTCTTCTCCCCCTTTGTCAAG---ACGGCACGGGAGGGGGCGCAGACCAGCCTGCACTGCGCCCTGG  811
           .||||||||||||||.|||||..|||||   ||..|.|   |||||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 741  ATGGCGGCTCTTCTCACCCTTCTTCAAGTCCACTTCTC---AGGGGGCTCAGACCAGCCTGCACTGTGCTCTGG  811

Query 812  CTGAGGGCCTGGAGCCCCTGAGTGGCAAGTACTTCAGTGACTGCAAGAGGACCTGGGTGTCTCCAAGGGCCCGA  885
           |.||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||..||||||||||.
Sbjct 812  CGGAGGACCTAGAGCCCCTGAGTGGAAAGTACTTCAGTGACTGCAAGAGGATGTGGGTATCCTCAAGGGCCCGG  885

Query 886  AATAACAAAACAGCTGAGCGCCTATGGAATGTCAGCTGTGAGCTTCTAGGAATCCGGTGGGAG  948
           ||.||.||||||||||||||..|.|||||.||||||||.||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 886  AACAAGAAAACAGCTGAGCGATTGTGGAACGTCAGCTGCGAGCTTCTAGGAATCCAGTGGGAA  948