Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09630
• Subject: XM_005255144.3
• Aligned Length: 1560
• Identities: 1143
• Gaps: 414

Alignment

Query    1  ATGGCATCCAACGATAAAGGCATGGCACCCTCGCTGGGCTCTCCCTGGGCCTCCCGGATGGGGCCCTGGGATGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCCTCAAGGCTGTCAAAGACCAGCTCCCGTCTCTGGACTCAGACTCCCCTTTGTCGGACTATGGGGAAGAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGCTGTTCATCTTCCAGCGAAACCAAACCTCCCTGATTCCAGACCTGTCGGAGGAGCTGGCTGAAGATCCTGCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATGGCGACAAGTCCAGGGCCTGGGTCGCTGCAGCTGAAGAGTCCCTTCCCGAGCCAGTTCTGGTGCCTGCAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ATTGGCCACAGAACCTGGGTGCAGACAGAACACAAGGACAAAGGATGCATCCTCTCAGGAAGGAAGAGACCCTG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GCAGGCCTTTTGAAAGCTCTGGTGAAGTCAGCGCTCTTCTTGGGATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAA  444
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------ATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAA  30

Query  445  GGCGACCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  GGCGACCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCAC  104

Query  519  TCTCTCCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  105  TCTCTCCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGG  178

Query  593  CCCTCCGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  CCCTCCGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCG  252

Query  667  ACCAGCAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  253  ACCAGCAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCC  326

Query  741  CCTCGTGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  327  CCTCGTGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCC  400

Query  815  TTCAGAGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  401  TTCAGAGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCAC  474

Query  889  CGCCAAGTTCAAGACTGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCAC  962
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  475  CGCCAAGTTCAAGACCGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCAC  548

Query  963  GCAGTCCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  549  GCAGTCCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAG  622

Query 1037  GAAGCAGATGTGCCTCAAGGAAGCGGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  623  GAAGCAGATGTGCCTCAAGGAAGCAGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTT  696

Query 1111  AACGCAGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  697  AACGCAGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTC  770

Query 1185  CAGCCACAGCTCCTCTGACAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  771  CAGCCACAGCTCCTCTGACAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCAT  844

Query 1259  CTCCTTCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  845  CTCCTTCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAG  918

Query 1333  GGGACAGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCTTGAAGACACAGC  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  919  GGGACAGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCCTGAAGACACAGC  992

Query 1407  TGGATCACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  993  TGGATCACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAA  1066

Query 1481  GAGGCAGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067  GAGGCAGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAG  1140

Query 1555  CAACTA  1560
            ||||||
Sbjct 1141  CAACTA  1146