Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09630
• Subject: XM_017022975.1
• Aligned Length: 1629
• Identities: 1555
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGGC  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGCTCTTCCTTCTGCCGAGCTCCCCGGATTATGGTGCACTGAGAAGGCATCTGGAAGCCTGGGCCCTCATGGC  74

Query    6  ATCCAACGATAAAGGCATGGCACCCTCGCTGGGCTCTCCCTGGGCCTCCCGGATGGGGCCCTGGGATGCCATCC  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCCAACGATAAAGGCATGGCACCCTCGCTGGGCTCTCCCTGGGCCTCCCAGATGGGGCCCTGGGATGCCATCC  148

Query   80  TCAAGGCTGTCAAAGACCAGCTCCCGTCTCTGGACTCAGACTCCCCTTTGTCGGACTATGGGGAAGAGGAGCTG  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAAGGCTGTCAAAGACCAGCTCCCGTCTCTGGACTCAGACTCCCCTTTGTCGGACTATGGGGAAGAGGAGCTG  222

Query  154  TTCATCTTCCAGCGAAACCAAACCTCCCTGATTCCAGACCTGTCGGAGGAGCTGGCTGAAGATCCTGCCGATGG  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCATCTTCCAGCGAAACCAAACCTCCCTGATTCCAGACCTGTCGGAGGAGCTGGCTGAAGATCCTGCCGATGG  296

Query  228  CGACAAGTCCAGGGCCTGGGTCGCTGCAGCTGAAGAGTCCCTTCCCGAGCCAGTTCTGGTGCCTGCAGAATTGG  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGACAAGTCCAGGGCCTGGGTCGCTGCAGCTGAAGAGTCCCTTCCCGAGCCAGTTCTGGTGCCTGCAGAATTGG  370

Query  302  CCACAGAACCTGGGTGCAGACAGAACACAAGGACAAAGGATGCATCCTCTCAGGAAGGAAGAGACCCTGGCAGG  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACAGAACCTGGGTGCAGACAGAACACAAGGACAAAGGATGCATCCTCTCAGGAAGGAAGAGACCCTGGCAGG  444

Query  376  CCTTTTGAAAGCTCTGGTGAAGTCAGCGCTCTTCTTGGGATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAAGGCGA  449
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTTTTGAAAGCTCTGGTGAGGTCAGCGCTCTTCTTGGGATGGCCGAGGAGCCCCCCAGGTGGCTGGAAGGCGA  518

Query  450  CCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCACTCTCT  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTTGGAAGCCTGTCTTTCAACACCAAAGGATCCCAGGGTCCTCCCTGGGACCCACAGGCCGAAGCCACTCTCT  592

Query  524  CCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGGCCCTC  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTGCCATGAAGGAGACCCAAAGGCAGAGCCCCTCAGCACTGCCTCACAAGAATCTGTGAACCGCCGGGCCCTC  666

Query  598  CGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCGACCAG  671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGACAGGAGAGAAGGAAGATGATAGAGACGGACATCCTCCAGAAAGTCACCCGGGATGCCTGCGGCCCGACCAG  740

Query  672  CAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCCCCTCG  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGTGACAAAGGTGGGGTGAAGGAGGCGCCCTGCCACGCTGCGGAGTCAGCTCCCAGATCCAAAATGCCCCTCG  814

Query  746  TGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCCTTCAG  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGCCTCCGGAGGGACCACCAGTGCTCTCGCTCCAGCAACTTGAAGCGTGGGATTTGGATGACATCCTTCAG  888

Query  820  AGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCACCGCCA  893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTCTGGCGGGACAAGAAGACAACCAGGGAAATCGTGCACCTGGAACTGTGTGGTGGGCAGCTGACCACCGCCA  962

Query  894  AGTTCAAGACTGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCACGCAGT  967
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTTCAAGACCGCATGGTGCCGAGCGCCCACAACAGGCTCATGGAACAGCTGGCCCTCCTGTGCACCACGCAGT  1036

Query  968  CCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAGGAAGC  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAGGCCTCTGCTTGTGCCCGGAAGGTGCCTGCCGACACTCCCCAGGACACCAAAGAGGCAGATTCAGGAAGC  1110

Query 1042  AGATGTGCCTCAAGGAAGCGGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTTAACGC  1115
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGATGTGCCTCAAGGAAGCAGGGCTCCCAGGCTGGGCCAGGCCCGCAGCTGGCCCAGGGCATGAGGCTTAACGC  1184

Query 1116  AGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTCCAGCC  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGTCCCCCACCATCTTTATTGACCTGCGGCAGATGGAGCTACCAGACCACCTGTCCCCAGAAAGCTCCAGCC  1258

Query 1190  ACAGCTCCTCTGACAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCATCTCCT  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAGCTCCTCTGACAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGATGGCAGCTCTGGGAGACGCAGAGGGGGCATCTCCT  1332

Query 1264  TCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAGGGGAC  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCCTCCCTGGGGCTACGGACCTGTACCGGGAAAAGCCAGCTTCTCCAGCAGCTCAGGGCCTTTCAGAAGGGGAC  1406

Query 1338  AGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCTTGAAGACACAGCTGGAT  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCCCAGCCCGAGCTGCCTGCCAGCAAGGGGCCCGCGGGTGGGAGGGCTCAGGCCCCTGAAGACACAGCTGGAT  1480

Query 1412  CACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAAGAGGC  1485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACGAACTGGGAGGAAGCAACACATGAAGCTCTGTGCCAAGGGGCAGAGCGCCCAGGCTCGACTCCCAAGAGGC  1554

Query 1486  AGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAGCAACT  1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGCCCAGAGCCCTGGGGGATGTTCCTGAGCCAGGGGCAGCCAGGGAGGCCCTGATGCCTCCTCTGGAGCAACT  1628

Query 1560  A  1560
            |
Sbjct 1629  A  1629