Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09677
• Subject: NM_001352811.2
• Aligned Length: 1497
• Identities: 1105
• Gaps: 390

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGGTACTCCTTAAGCCCTGACAACCATCTTGAAGATGGAATCATGAATATGGCAAATTTTCTACGGGGCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAAGAAAAGGGGATAAAGAACGACAGGCCTGAGGACCAGTTGAGCAAAGAGAAAAAGAAAATTCTTTTCTCCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCTGTGAGGTGTGCAACATCCAGCTGAACTCTGCAGCCCAGGCTCAGGTGCATTCCAACGGCAAATCCCACCGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAACGAGTGAAGCAGCTGAGTGATGGGCAGCCCCCACCACCCGCCCAGGCCAGCCCCAGCAGCAACAGCAGCAC  296

Query    1  -------------------------------------------------------ATGATGCATCCTTCACTGG  19
                                                                   ||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AGGCAGTACATGCCACACTACTACCCTTCCTGCTCTTGTGCGCACACCTACCCTGATGATGCAGCCTTCACTGG  370

Query   20  ATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACACA---  90
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  371  ATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACACAAAA  444

Query   91  ------------------------------------ATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATT  128
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAAGAGGCTTATTTGAGACCAATAAATTTTGCCAGATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATT  518

Query  129  TGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATA  202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATA  592

Query  203  GCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAA  276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAA  666

Query  277  CCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAA  350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAA  740

Query  351  CTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCT  424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCT  814

Query  425  CATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGA  498
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGA  888

Query  499  GCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGC  572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGC  962

Query  573  TGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATG  646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATG  1036

Query  647  GGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGA  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGA  1110

Query  721  CTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACAT  794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACAT  1184

Query  795  TTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCC  868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCC  1258

Query  869  AGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTC  942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTC  1332

Query  943  CTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCT  1016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCT  1406

Query 1017  CTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCA  1090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCA  1480

Query 1091  TCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            |||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCTCTTTGCTCCGTAC  1497