Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09680
Subject:
NM_001168217.2
Aligned Length:
628
Identities:
510
Gaps:
83

Alignment

Query   1  MEPPQETNRPFSTLDNRSGQVQVLSATPLLQRNPYSSPDIMHIKGSEASSVPYALNQGTTALPKNKNQEGTGHR  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MEPPQETNRPFSTLDNRSGQVQVLSATPLLQRNPYSSPDIMHIKGSEASSVPYALNQGTTALPKNKNQEGTGHR  74

Query  75  LLNMLRKTLKESDSEELEITQETPNLVPFGDVVGCLGIHIKNCRHFMPKISLQHYANLFIRISINKAVKCTKMC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  LLNMLRKTLKESDSEELEITQETPNLVPFGDVVGCLGIHIKNCRHFMPKISLQHYANLFIRISINKAVKCTKMC  148

Query 149  SLLSKNDEKNTVIKFDEVKYFSVQVPRRYDDKRNNILLELIQYDNREKRAFLLGSVQIHLYEVIQKGCFIEEVQ  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  SLLSKNDEKNTVIKFDEVKYFSVQVPRRYDDKRNNILLELIQYDNREKRAFLLGSVQIHLYEVIQKGCFIEEVQ  222

Query 223  VLHGNIFVCRLEVEFMFSYGNFGYGFSHQLKPLQKITEPSMFMNLAPPPERTDPVTKVITPQTVEYPAFLSPDL  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  VLHGNIFVCRLEVEFMFSYGNFGYGFSHQLKPLQKITEPSMFMNLAPPPERTDPVTKVITPQTVEYPAFLSPDL  296

Query 297  NVTVGTPAVQSSNQPSVVRLEKLQQQPRERLEKMKKEYRNLNTWIDKANYLESILMPKLEHKDSEETNIDEASE  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  NVTVGTPAVQSSNQPSVVRLEKLQQQPRERLEKMKKEYRNLNTWIDKANYLESILMPKLEHKDSEETNIDEASE  370

Query 371  NTKSNQPEEELENIVGVDIPLVNEEAETTANELLDNDSEKGLTIPTLNQSDQDNSTADASKNDESTPSPTEVHS  444
           |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  NTKSNHPEEELENIVGVDIPLVNEEAETTANELLDNDSEKGLTIPTLNQSDQDNSTADASKNDESTPSPTEVHS  444

Query 445  LCTISNQETIKAGRIPPLGERQSESMPDRKMKNVFFPLEVKLKDNYPSILKADSSLSEV-----AFSPKEYNSP  513
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ...||..|..
Sbjct 445  LCTISNQETIKAGRIPPLGERQSESMPDRKMKNVFFPLEVKLKDNYPSILKADSSLSEVNLRSICINPKSRNLD  518

Query 514  SFRPEYIEFKPKFQDCSDKFEDLHDMTSFTHLKKVKSRSRLLGKSSDDIHNHARHSARPYTAPEVNKQRESYSG  587
           | .|..|............ |...........|.                                        
Sbjct 519  S-SPTEISWQNNNLNLAER-ENTGLVSTRLKIKR----------------------------------------  550

Query 588  KFTSRRMVSSGLVHINDKTSDYEMHKMRPKKIKRGY  623
                                               
Sbjct 551  ------------------------------------  550