Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09680
• Subject: XM_006712334.3
• Aligned Length: 1872
• Identities: 1408
• Gaps: 462

Alignment

Query    1  ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCCACCCCAAGAGACAAATAGGCCTTTCAGCACACTTGATAACCGCAGCGGGCAGGTCCAAGTCCTGTC  74

Query   75  CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCCACCCCGCTATTGCAGAGGAATCCCTACAGCAGCCCGGATATCATGCACATTAAAGGGTCGGAGGCTTCTT  148

Query  149  CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGTCCCTTACGCCCTGAACCAGGGCACGACGGCCCTGCCTAAGAACAAGAACCAGGAGGGCACCGGGCACCGG  222

Query  223  CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACACCAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CTGCTGAACATGCTGAGAAAAACTCTTAAAGAGTCTGATAGTGAAGAACTGGAAATAACACAGGAGACGCCAAA  296

Query  297  TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTGGTGCCATTTGGGGATGTGGTTGGCTGCCTGGGCATTCATATAAAGAACTGCAGACATTTTATGCCTAAGA  370

Query  371  TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAGTTTACAACATTATGCTAATTTATTCATTCGCATCTCTATAAACAAAGCTGTGAAATGTACAAAAATGTGT  444

Query  445  AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCTTGCTATCCAAAAACGATGAGAAGAACACTGTAATTAAGTTCGATGAAGTGAAGTATTTTTCTGTACAGGT  518

Query  519  TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCAGACGTTATGATGATAAGCGGAATAATATTTTATTGGAACTCATACAATATGACAATAGAGAAAAACGTG  592

Query  593  CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTTCTTGTTAGGGAGTGTTCAGATACATCTTTATGAGGTAATTCAGAAAGGGTGCTTCATTGAAGAGGTCCAA  666

Query  667  GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTTGCATGGAAACATATTTGTCTGCAGGCTGGAGGTGGAATTTATGTTCTCCTATGGAAACTTTGGTTATGG  740

Query  741  ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTTTCACATCAGTTAAAACCTCTTCAGAAAATTACTGAGCCATCCATGTTTATGAATCTTGCACCACCTCCAG  814

Query  815  AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGAACAGATCCCGTGACAAAAGTTATTACACCACAGACAGTAGAATATCCAGCATTCTTATCCCCAGACCTG  888

Query  889  AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATGTTACTGTTGGGACTCCAGCTGTGCAATCCTCCAACCAGCCATCTGTAGTGCGACTTGAAAAACTTCAGCA  962

Query  963  ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAACCCCGGGAAAGGCTGGAAAAGATGAAAAAAGAATATAGAAATCTGAATACATGGATAGATAAAGCTAACT  1036

Query 1037  ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTTAGAAAGCATTCTAATGCCAAAATTGGAACATAAGGATTCTGAGGAAACTAATATAGATGAGGCATCTGAA  1110

Query 1111  AACACGAAAAGTAATCAACCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGT---AGATATCCCTCTTGTAAATGA  1181
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACACGAAAAGTAATCATCCTGAAGAGGAGCTTGAAAATATTGTAGGAGTAGCAGATATCCCTCTTGTAAATGA  1184

Query 1182  GGAAGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACC  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAAGCTGAAACTACTGCAAATGAGTTACTGGATAATGATTCTGAGAAAGGCCTGACTATACCAACTTTGAACC  1258

Query 1256  AATCGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCAC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATCGGACCAAGATAATTCAACTGCTGATGCTTCTAAAAATGATGAATCAACACCTTCACCCACAGAAGTGCAC  1332

Query 1330  TCATTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTTAGGTGAACGTCAATCAGA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 1333  TCATTGTGCACTATTTCTAACCAGGAAACAATAAAAGCAGGCAGAATACCACCTTT------------------  1388

Query 1404  AAGCATGCCAGACAGAAAAATGAAAAATGTATTTTTTCCATTAGAAGTAAAATTAAAAGATAACTATCCAAGCA  1477
                                                                                      
Sbjct 1389  --------------------------------------------------------------------------  1388

Query 1478  TTTTAAAAGCAGACTCATCTCTATCAGAGGTGGCTTTTTCACCAAAAGAATATAATTCACCATCTTTCAGACCA  1551
                                       |||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1389  ---------------------------AGGTGGCTTTTTCACCAAAAGAATA----------------------  1413

Query 1552  GAATATATAGAATTCAAACCAAAATTTCAGGATTGTTCAGATAAATTTGAGGATTTACATGACATGACCTCATT  1625
                                                                                      
Sbjct 1414  --------------------------------------------------------------------------  1413

Query 1626  TACACACCTTAAAAAAGTAAAATCAAGATCAAGGCTTTTAGGAAAAAGCTCAGATGATATCCATAACCATGCCA  1699
                                                                                      
Sbjct 1414  --------------------------------------------------------------------------  1413

Query 1700  GACACTCTGCAAGACCATATACTGCTCCGGAGGTTAACAAGCAACGAGAAAGCTACAGTGGAAAGTTTACAAGT  1773
                                                                                      
Sbjct 1414  --------------------------------------------------------------------------  1413

Query 1774  CGTCGAATGGTTTCATCAGGCTTAGTTCATATAAATGATAAAACATCAGATTATGAAATGCATAAAATGCGGCC  1847
                                                                                      
Sbjct 1414  --------------------------------------------------------------------------  1413

Query 1848  AAAAAAAATTAAAAGAGGATAT  1869
                                  
Sbjct 1414  ----------------------  1413