Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09804
• Subject: XM_017000579.1
• Aligned Length: 2081
• Identities: 1453
• Gaps: 622

Alignment

Query    1  ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  CCAGCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAA--AGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTAG  664
                                    ||||.|..||..|    ||  |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGGAGCTATTTA----AAGCAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTAG  46

Query  665  ATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGAA  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  ATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGAA  120

Query  739  GTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACAC  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  GTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACAC  194

Query  813  GGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAGA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  GGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAGA  268

Query  887  CAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAGC  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  CAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAGC  342

Query  961  AGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGTC  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  AGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGTC  416

Query 1035  CTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCACC  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCACC  490

Query 1109  CCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGCT  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  CCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGCT  564

Query 1183  CCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTTC  1256
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  CCGGCTCTCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTTC  638

Query 1257  TACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGACG  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  TACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGACG  712

Query 1331  CCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCAG  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  CCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCAG  786

Query 1405  GGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTCT  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  GGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTCT  860

Query 1479  GGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTGC  1552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  GGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTGC  934

Query 1553  AGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCAT  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  AGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCAT  1008

Query 1627  GGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCCC  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  GGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCCC  1082

Query 1701  ATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATGG  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  ATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATGG  1156

Query 1775  GTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAAC  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  GTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAAC  1230

Query 1849  ATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCTT  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  ATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCTT  1304

Query 1923  TGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTGG  1996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  TGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTGG  1378

Query 1997  AAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGAC  2070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  AAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGAC  1452

Query 2071  CGGCTCCAA  2079
            |||||||||
Sbjct 1453  CGGCTCCAA  1461