Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09814
• Subject: NM_027216.5
• Aligned Length: 1020
• Identities: 879
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG  74
            |||||||||||..|||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTCCAAGGTTACAGCTCCGTGGTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGCAATGACAGCAGCCGG  74

Query   75  GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG  148
            ||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGCAGCTCTCGTGTTCATATTCTCCAGCGGGCAGAGGCGGATCTTAGACGGAAGCCTGGGCTTTGCCGCAGGGG  148

Query  149  TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT  222
            |||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TCATGTTAGCGGCTTCCTACTGGTCGCTGCTTGCACCAGCGGTGGAGATGGCGACATCCTCGGGGGGCTTCGGA  222

Query  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTTGCCTTCTTCCCAGTGGCTGTTGGCTTCACCCTGGGGGCCGCCTTTGTCTACCTGGCTGACCTCCTGAT  296

Query  297  GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA  370
            |||||||.|||||||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|.|.||.|.|||||   |||||
Sbjct  297  GCCTCACCTGGGTGCTACAGAAGACCCCCAGACAGCCCTGGCGCTGAACTTGGACCCTGCATTGAT---GAAGA  367

Query  371  AGTCTGATCCTGAGGGTCCC----GCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGAGTGA  440
            |||||||||| .||||.|||    .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  368  AGTCTGATCC-CAGGGACCCCACTTCGCTGCTCTTCCCGGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGCGTGA  440

Query  441  GAATGGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCCTGC-TGTCCCTGTGCCT  513
            ||||||.||||.|||.|||||.|||||||.||||||.||||.|||..||||||     || ||.||     ||.
Sbjct  441  GAATGGCGAGGTATACCAGAGGAAGAAGGTGGCAGCTACTGACCTCGCAGAGG-----GCGTGGCC-----CCC  504

Query  514  TC----TCGA-----GGGA-ATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCATCTTGG  577
            ||    ||||     |||| .||.|| .|||||.||.||.|||||||||||||||||.||..||||||||.|||
Sbjct  505  TCAGGATCGATGCACGGGAGCTCAGG-GCAGCCTGGGGGGAGCAGCTGGAGGAGGATTGCTTTGCTCATCCTGG  577

Query  578  CCATCACTATACACAACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCT  651
            |||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||..||||||||||.||||||
Sbjct  578  CCATCACCATACACAACATTCCAGAGGGTCTTGCTGTTGGCGTAGGATTTGGAGCAGTAGAAAAGACTGCATCT  651

Query  652  GCTACCTTTGAGAGTGCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAG  725
            ||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  652  GCCACCTTCGAGAGTGCCAGGAATCTGGCCATTGGAATTGGGATCCAGAATTTCCCAGAGGGCCTGGCTGTCAG  725

Query  726  CCTTCCCTTGCGAGGGGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGC  799
            ||||||..||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  CCTTCCTCTGCGTGGAGCAGGCTTCTCTACCTGGAAAGCTTTCTGGTATGGACAGCTGAGCGGCATGGTGGAGC  799

Query  800  CCCTGGCCGGGGTCTTTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCT  873
            ||.||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  800  CCTTGGCTGGGGTCTTTGGAGCATTTGCGGTGGTACTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTATGCACTGGCCTTTGCT  873

Query  874  GCCGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGC  947
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  874  GCTGGTGCCATGGTCTACGTGGTCATGGATGACATCATCCCCGAGGCCCAGATCAGTGGCAACGGGAAGCTGGC  947

Query  948  ATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC  1005
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  948  ATCCTGGGCCTCCATCCTGGGATTTGTGGTGATGATGTCCCTTGATGTGGGCCTCGGC  1005