Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09814
- Subject:
- XM_017024334.2
- Aligned Length:
- 1005
- Identities:
- 852
- Gaps:
- 150
Alignment
Query 1 ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTCCAAGGCCACAGCTCTGTGTTCCAGGCCTTGCTGGGGACCTTCTTCACCTGGGGGATGACAGCAGCTGG 74
Query 75 GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCAGCTCTCGTGTTCGTATTCTCTAGTGGACAGAGGCGGATCTTAGATGGAAGTCTTGGCTTTGCTGCAGGGG 148
Query 149 TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCATGTTGGCAGCTTCCTATTGGTCTCTTCTGGCCCCAGCAGTTGAGATGGCCACGTCCTCTGGGGGCTTCGGT 222
Query 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCTTTGCCTTCTTCCCTGTGGCTGTTGGCTTCACCCTTGGAGCGGCTTTTGTCTACTTGGCTGACCTCCTGAT 296
Query 297 GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGGCCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCTCACTTGGGTGCAGCAGAAGACCCCCAGACGACCCTGGCACTGAACTTCGGCTCTACGTTGATGAAGAAGA 370
Query 371 AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAGACAAGAGTGAGAAT 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 371 AGTCTGATCCTGAGGGTCCCGCGCTGCTCTTCCCTGAGAGTGAACTTTCCATCCGGATAG------GT------ 432
Query 445 GGTGAGGCATATCAGAGAAAGAAGGCGGCAGCCACTGGCCTTCCAGAGGGTCCTGCTGTCCCTGTGCCTTCTCG 518
|||| ||||.||||
Sbjct 433 -------------AGAG-----------------CTGGGCTTC------------------------------- 445
Query 519 AGGGAATCTGGCACAGCCCGGCGGCAGCAGCTGGAGGAGGATCGCACTGCTCATCTTGGCCATCACTATACACA 592
Sbjct 446 -------------------------------------------------------------------------- 445
Query 593 ACGTTCCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGT 666
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 ---TTTCAGAGGGTCTCGCTGTTGGAGTTGGATTTGGGGCTATAGAAAAGACGGCATCTGCTACCTTTGAGAGT 516
Query 667 GCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GCCAGGAATTTGGCCATTGGAATCGGGATCCAGAATTTCCCCGAGGGCCTGGCTGTCAGCCTTCCCTTGCGAGG 590
Query 741 GGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 GGCAGGCTTCTCCACCTGGAGAGCTTTCTGGTATGGGCAGCTGAGCGGCATGGTGGAGCCCCTGGCCGGGGTCT 664
Query 815 TTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 TTGGTGCCTTTGCCGTGGTGCTGGCTGAGCCCATCCTGCCCTACGCTCTGGCCTTTGCTGCCGGTGCCATGGTC 738
Query 889 TACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 TACGTGGTCATGGACGACATCATCCCCGAAGCCCAGATCAGTGGTAATGGGAAACTGGCATCCTGGGCCTCCAT 812
Query 963 CCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC 1005
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 CCTGGGATTTGTAGTGATGATGTCACTGGACGTTGGCCTGGGC 855