Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09864
- Subject:
- NM_152725.3
- Aligned Length:
- 2073
- Identities:
- 1961
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA 74
Query 75 GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGACAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC 148
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGATAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC 148
Query 149 TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC 222
Query 223 CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG 296
Query 297 AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC 370
Query 371 ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG 444
Query 445 AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA 518
Query 519 GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG 592
Query 593 AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG 666
Query 667 GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT 740
Query 741 CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC 814
Query 815 ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA 888
Query 889 AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT 962
Query 963 ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA 1036
Query 1037 GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC 1110
Query 1111 ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA 1184
Query 1185 GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC 1258
Query 1259 TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT 1332
Query 1333 ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT 1406
Query 1407 ATCACCAAATGACAAGCAGGGCCTGTCATTGGTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACT 1480
|||||||||||||||
Sbjct 1407 ATCACCAAATGACAA----------------------------------------------------------- 1421
Query 1481 CTGAATTAAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTGAAAAGCCCAGAAGATTCACAG 1554
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422 ----------------------------------------------------GAAAAGCCCAGAAGATTCACAG 1443
Query 1555 GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444 GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT 1517
Query 1629 GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG 1591
Query 1703 AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592 AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC 1665
Query 1777 TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666 TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT 1739
Query 1851 ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT 1813
Query 1925 TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC 1887
Query 1999 CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888 CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT 1961
Query 2073 A 2073
|
Sbjct 1962 A 1962