Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09864
Subject:
NM_152725.3
Aligned Length:
2073
Identities:
1961
Gaps:
111

Alignment

Query    1  ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA  74

Query   75  GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGACAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGATAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC  148

Query  149  TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC  222

Query  223  CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG  296

Query  297  AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC  370

Query  371  ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG  444

Query  445  AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA  518

Query  519  GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG  592

Query  593  AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG  666

Query  667  GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT  740

Query  741  CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC  814

Query  815  ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA  888

Query  889  AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT  962

Query  963  ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA  1036

Query 1037  GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC  1110

Query 1111  ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA  1184

Query 1185  GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC  1258

Query 1259  TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT  1332

Query 1333  ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT  1406

Query 1407  ATCACCAAATGACAAGCAGGGCCTGTCATTGGTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACT  1480
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct 1407  ATCACCAAATGACAA-----------------------------------------------------------  1421

Query 1481  CTGAATTAAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTGAAAAGCCCAGAAGATTCACAG  1554
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422  ----------------------------------------------------GAAAAGCCCAGAAGATTCACAG  1443

Query 1555  GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444  GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT  1517

Query 1629  GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518  GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG  1591

Query 1703  AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592  AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC  1665

Query 1777  TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666  TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT  1739

Query 1851  ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740  ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT  1813

Query 1925  TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814  TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC  1887

Query 1999  CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888  CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT  1961

Query 2073  A  2073
            |
Sbjct 1962  A  1962