Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09906
- Subject:
- XM_011541179.2
- Aligned Length:
- 2202
- Identities:
- 1899
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACTTCAGATAGAGATGTAGAATCAATGGGTGTCTCTTCTAAATGGCTGCAGAGGGTGCTGACCTGGGCCTG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCTAGACTCTGCCCTTCTAGGAGCATCTCAAGATTGTCTTATTTTGGGTGTGGGCAATTTGCATATTTCTCCAA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGAACCATCCAGAACCTGAGCAGCCTGTCTTCAGACAGAGAGAGGCCCACGGCTGTTTCTTGAAATCTGGTGAT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCAGGTCCTGTCCAGAAAGCTCGGGGTGTGGCAGTGAAAAAACAACCAGGGAACTGCCTCGTACACACAGCGCT 296
Query 1 ----ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGG 70
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGAATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGG 370
Query 71 GGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATC 144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGAGCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATC 444
Query 145 TCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTG 218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCCCTGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTG 518
Query 219 GCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATG 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATG 592
Query 293 TGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGC 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTTTGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGC 666
Query 367 TTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGT 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTCTCACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGT 740
Query 441 GCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTG 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCCTTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTG 814
Query 515 AAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCG 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAATGGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCG 888
Query 589 ACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGAC 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTGTCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGAC 962
Query 663 GATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTG 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GATTATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTG 1036
Query 737 CAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCT 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGCTGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCT 1110
Query 811 CTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTT 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGACGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTT 1184
Query 885 CAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGTGCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGG 1258
Query 959 AGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACA 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCTCGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACA 1332
Query 1033 GTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCC 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGTTGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCC 1406
Query 1107 CTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGG 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTGGGGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGG 1480
Query 1181 GGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCT 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGCGACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCT 1554
Query 1255 CAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCA 1328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAAGAGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCA 1628
Query 1329 TTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTT 1402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTGGGAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTT 1702
Query 1403 TCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTG 1476
||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCGTGTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTG 1776
Query 1477 GAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAGAACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGC 1850
Query 1551 CGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGG 1624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGTGGGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGG 1924
Query 1625 AGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATA 1698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGCCTCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATA 1998
Query 1699 TCCGGAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTC 1772
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCCGGAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTC 2072
Query 1773 TGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACC 1846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGAAGGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACC 2146
Query 1847 CACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CACTGGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC 2202