Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09906
- Subject:
- XM_017000913.2
- Aligned Length:
- 1902
- Identities:
- 1779
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCATGTGGAACAGGCCATGCCAGAGGCTGCCTCAGCAGCCTCTGGTAGCTGAGCCCACTGCAGAGGGGGA 74
Query 75 GCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCCACACCTGCCCACGGGCCGGGAGCTGACTGAGGCCAACCGCTTCGCCTATGCTGCCCTCTGTGGCATCTCCC 148
Query 149 TGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGTCCCAGTTATTTCCTGAACCCGAACACAGCTCCTTCTGCACAGAGTTCATGGCAGGCCTGGTGCAGTGGCTG 222
Query 223 GAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGTTGTCTGAAGCTGTCTTGCCAACCATGACTGCTTTTGCGAGCGGCCTGGGAGGTGAAGGAGCAGATGTGTT 296
Query 297 TGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTTCAAATTTTACTGAAGGACCCCATCTTGAAGGACGACCCGACGGTGATCACTCAGGACCTTCTGAGCTTCT 370
Query 371 CACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACTCAAGGATGGGCACTATGACGCCCGGGCCAGAGTCCTCGTTTGCCACATGACCTCCCTGCTCCAAGTGCCC 444
Query 445 TTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGGAGGAGCTGGATGTCCTTGAAGAGATGTTCCTGGAGAGCCTGAAGGAAATCAAAGAAGAGGAATCTGAAAT 518
Query 519 GGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCCGAGGCATCCCGAAAGAAGAAAGAAAACCGGAGGAAATGGAAGCGTTATCTCCTGATAGGCCTGGCGACTG 592
Query 593 TCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCGGAGGCGGAACGGTGATCGGTGTGACTGGAGGTCTAGCTGCACCCCTTGTTGCCGCTGGAGCAGCGACGATT 666
Query 667 ATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTGGCAGCGCCGGGGCAGCGGCTCTGGGCTCAGCAGCCGGCATAGCCATCATGACCTCGCTGTTTGGTGCAGC 740
Query 741 TGGAGCTGGCCTGACAGGATACAAGATGAAGAAGCGAGTGGGAGCCATTGAAGAGTTCACGTTTCTGCCTCTGA 814
|||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGAGCTGGCCTGACAG--------------------------------------------------------- 757
Query 815 CGGAGGGCAGGCAGCTGCACATCACCATCGCCGTCACGGGGTGGCTCGCTTCTGGCAAATACCGCACCTTCAGT 888
|||||||||||
Sbjct 758 ---------------------------------------------------------------GCACCTTCAGT 768
Query 889 GCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 769 GCCCCGTGGGCTGCCCTGGCCCACAGCCGTGAGCAGTACTGCCTGGCCTGGGAAGCCAAGTACCTGATGGAGCT 842
Query 963 CGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 CGGCAATGCCCTGGAGACCATCCTCAGTGGTCTCGCCAACATGGTGGCCCAGGAGGCCCTAAAGTACACAGTGT 916
Query 1037 TGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 TGTCTGGCATTGTGGCTGCCCTGACCTGGCCAGCCTCACTCCTCAGTGTCGCCAATGTCATCGACAACCCCTGG 990
Query 1111 GGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 991 GGGGTGTGTCTCCATCGATCAGCAGAGGTTGGCAAGCACCTGGCCCACATCCTGCTCTCCCGGCAGCAGGGGCG 1064
Query 1185 ACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065 ACGACCTGTCACCTTGATTGGCTTCAGCCTGGGAGCCAGAGTCATCTACTTCTGTCTGCAGGAGATGGCTCAAG 1138
Query 1259 AGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 AGAAAGATTGCCAAGGAATCATCGAGGACGTCATCCTGCTGGGTGCGCCTGTGGAGGGAGAAGCCAAGCATTGG 1212
Query 1333 GAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 GAGCCTTTCCGGAAGGTGGTGTCCGGGAGGATCATCAACGGCTACTGCAGGGGAGACTGGCTGCTGAGTTTCGT 1286
Query 1407 GTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCACGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGA 1480
||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287 GTACCGCACATCCTCGGTGCAGCTCCGTGTCGCCGGCCTACAGCCCGTGCTGCTGCAGGACAGGAGGGTGGAGA 1360
Query 1481 ACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361 ACGTGGACCTGACCTCTGTGGTCAGCGGCCACCTGGACTATGCCAAGCAGATGGATGCCATCCTGAAGGCCGTG 1434
Query 1555 GGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 GGCATCCGCACCAAGCCAGGCTGGGACGAGAAGGGGCTCTTGCTGGCCCCAGGCTGCCTGCCCTCCGAGGAGCC 1508
Query 1629 TCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 TCGCCAGGCAGCAGCTGCCGCCTCATCAGGCGAGACCCCCCACCAGGTTGGGCAAACCCAGGGTCCCATATCCG 1582
Query 1703 GAGACACCTCCAAANTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAA 1776
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583 GAGACACCTCCAAATTGGCCATGTCCACAGACCCCAGCCAAGCCCAGGTGCCAGTAGGGCTGGACCAGTCTGAA 1656
Query 1777 GGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1657 GGGGCCTCCCTTCCTGCTGCTGCCAGCCCTGAAAGGCCCCCCATCTGCAGCCATGGCATGGACCCCAACCCACT 1730
Query 1851 GGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1731 GGGCTGCCCCGATTGTGCCTGCAAGACCCAGGGCCCCAGCACGGGGCTGGAC 1782